More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01828 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01828  beta-lactamase precursor  100 
 
 		 366 aa  753    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.284204  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  32.27 
 
 		 446 aa  140  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  29.97 
 
 		 487 aa  135  9e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.52 
 
 		 392 aa  127  3e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5150  beta-lactamase  25.72 
 
 		 369 aa  126  7e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.654906 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  35.65 
 
 		 442 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4152  beta-lactamase  30.22 
 
 		 378 aa  120  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0848463  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2638  beta-lactamase  35.68 
 
 		 445 aa  120  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  34.5 
 
 		 578 aa  120  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3872  beta-lactamase  30.19 
 
 		 375 aa  119  7e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4110  beta-lactamase  29.71 
 
 		 379 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1832  beta-lactamase  28.85 
 
 		 446 aa  119  9e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.29245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0502  penicillin-binding protein  30.69 
 
 		 412 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4818  putative penicillin-binding protein  30.71 
 
 		 416 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.618322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0483  putative penicillin-binding protein  30.69 
 
 		 412 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1906  beta-lactamase  33.74 
 
 		 369 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2294  penicillin-binding protein, putative  28.92 
 
 		 434 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.272122  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0473  penicillin-binding protein  30.69 
 
 		 421 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0416  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  30.69 
 
 		 421 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0430511  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1086  beta-lactamase  29.85 
 
 		 378 aa  117  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3422  beta-lactamase  35.8 
 
 		 593 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.126074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1750  beta-lactamase  32.37 
 
 		 375 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.339251  normal  0.99151 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0412  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  29.74 
 
 		 422 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3615  beta-lactamase  35.8 
 
 		 611 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0663146 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4174  beta-lactamase  30.65 
 
 		 378 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000652338  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0558  putative penicillin-binding protein  29.51 
 
 		 413 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.622752  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0505  putative penicillin-binding protein  30.71 
 
 		 415 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0859162  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3294  penicillin-binding protein  30.52 
 
 		 377 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.678008  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3511  putative penicillin-binding protein  30.52 
 
 		 377 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3731  beta-lactamase  36.36 
 
 		 603 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.227339 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3554  penicillin-binding protein  30.52 
 
 		 377 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0863  beta-lactamase  33.33 
 
 		 363 aa  114  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  33.03 
 
 		 559 aa  114  3e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3208  beta-lactamase  30.52 
 
 		 377 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0230735  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0159  beta-lactamase  27.78 
 
 		 410 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0419  beta-lactamase  29.96 
 
 		 416 aa  113  5e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2881  beta-lactamase  29.46 
 
 		 338 aa  113  6e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.74645  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3751  beta-lactamase  30.4 
 
 		 395 aa  113  6e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000498352 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3498  beta-lactamase  31.95 
 
 		 375 aa  113  6e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0555  penicillin-binding protein, putative  29.74 
 
 		 413 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.389605  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3264  beta-lactamase  29.39 
 
 		 377 aa  112  9e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.664291  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0428  beta-lactamase  29.55 
 
 		 404 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.354595  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3210  beta-lactamase  30 
 
 		 375 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.767379  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1520  Beta-lactamase  32.3 
 
 		 537 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000638983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2742  beta-lactamase  29.5 
 
 		 376 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0750006  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  31.87 
 
 		 356 aa  110  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2259  beta-lactamase  36.61 
 
 		 416 aa  110  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.296569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0939  beta-lactamase  33.18 
 
 		 338 aa  110  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.18746 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3175  beta-lactamase  30.84 
 
 		 351 aa  109  6e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0119788  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2736  beta-lactamase  27.97 
 
 		 417 aa  109  6e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.416885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2968  beta-lactamase  28.77 
 
 		 462 aa  108  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4043  beta-lactamase  32.94 
 
 		 361 aa  108  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0151  beta-lactamase  31.8 
 
 		 394 aa  106  7e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.288429 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3817  beta-lactamase  29.91 
 
 		 364 aa  106  8e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3507  penicillin-binding protein, putative  29.96 
 
 		 375 aa  105  8e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2727  beta-lactamase  27.53 
 
 		 486 aa  105  9e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3518  putative penicillin-binding protein  29.96 
 
 		 377 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1936  beta-lactamase  26.59 
 
 		 848 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.178754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4919  beta-lactamase  29.17 
 
 		 415 aa  104  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.318437  normal  0.850487 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  29.55 
 
 		 362 aa  104  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0343  beta-lactamase  27.57 
 
 		 482 aa  104  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4280  beta-lactamase  31.08 
 
 		 330 aa  103  6e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5443  putative beta-lactamase  30.04 
 
 		 364 aa  102  9e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.65256  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2080  beta-lactamase  31.08 
 
 		 370 aa  102  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.16247  normal  0.44675 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3062  beta-lactamase  28.12 
 
 		 614 aa  101  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.367625  hitchhiker  0.002383 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1551  beta-lactamase  32.92 
 
 		 333 aa  101  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.345066  normal  0.407276 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3688  beta-lactamase  30.94 
 
 		 543 aa  100  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497517  normal  0.011807 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0618  beta-lactamase  30.84 
 
 		 450 aa  101  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2177  beta-lactamase  30.94 
 
 		 543 aa  100  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.816506 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2921  beta-lactamase class C-like protein  28.57 
 
 		 451 aa  100  3e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.154271 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1457  beta-lactamase  29.96 
 
 		 325 aa  100  6e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.17461  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0335  hypothetical protein  30.27 
 
 		 533 aa  99.4  9e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2394  penicillin-binding protein  28.87 
 
 		 340 aa  99  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.70958  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  29.87 
 
 		 505 aa  97.8  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2632  penicillin-binding protein  27.52 
 
 		 341 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.149759  decreased coverage  0.000000240236 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2198  beta-lactamase  28.69 
 
 		 543 aa  98.6  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.176904  normal  0.0317754 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2793  beta-lactamase  28.01 
 
 		 510 aa  97.4  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.879811  normal  0.340954 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2433  penicillin-binding protein  27.66 
 
 		 340 aa  97.8  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0197006  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2668  penicillin-binding protein  27.66 
 
 		 348 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162016 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4346  Beta-lactamase  27.97 
 
 		 547 aa  97.4  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4350  Beta-lactamase  26.56 
 
 		 553 aa  96.7  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13238  penicillin-binding protein, putative  27.78 
 
 		 431 aa  96.7  7e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.652866  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1783  cyclic peptide transporter  25.98 
 
 		 1055 aa  95.9  9e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2469  penicillin-binding protein  27.23 
 
 		 340 aa  95.5  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.242822  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2679  penicillin-binding protein  27.13 
 
 		 341 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2650  penicillin-binding protein  27.23 
 
 		 340 aa  95.5  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3534  amino acid adenylation  30.58 
 
 		 2457 aa  95.5  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2573  beta-lactamase  30.56 
 
 		 476 aa  95.1  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.369136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0831  beta-lactamase  27.59 
 
 		 422 aa  94  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4213  beta-lactamase  26.62 
 
 		 403 aa  94  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.161495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1134  beta-lactamase  29.14 
 
 		 459 aa  93.6  5e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3206  beta-lactamase  28.77 
 
 		 389 aa  93.2  6e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2357  beta-lactamase  28.16 
 
 		 381 aa  93.2  7e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5264  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  30.9 
 
 		 493 aa  92.8  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.0797924 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5119  beta-lactamase  31.14 
 
 		 402 aa  92  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1072  Beta-lactamase  30.49 
 
 		 412 aa  92  1e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4636  beta-lactamase  27.85 
 
 		 496 aa  91.7  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11951  lipoprotein  28 
 
 		 371 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5985  beta-lactamase  29.24 
 
 		 342 aa  91.3  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3512  beta-lactamase  26.06 
 
 		 364 aa  91.7  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>