More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1134 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_1134  beta-lactamase  100 
 
 		 459 aa  925    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2896  alkaline D-peptidase  63.96 
 
 		 383 aa  458  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.243898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1263  beta-lactamase  59.62 
 
 		 375 aa  436  1e-121  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0172767 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3986  hypothetical protein  59.02 
 
 		 369 aa  416  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.82683 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2416  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  44.68 
 
 		 411 aa  286  5e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.758876  normal  0.129808 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2043  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  41.91 
 
 		 421 aa  284  2.0000000000000002e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.956781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4689  beta-lactamase  41.55 
 
 		 374 aa  269  8.999999999999999e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0791767  normal  0.116144 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4690  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  41.02 
 
 		 379 aa  213  4.9999999999999996e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00394326  normal  0.37742 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0099  D-stereospecific peptide hydrolase  36.81 
 
 		 443 aa  207  3e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000129924  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0034  alkaline D-peptidase  38.69 
 
 		 392 aa  205  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.698522 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2296  alkaline D-peptidase  33.93 
 
 		 385 aa  204  2e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000100431 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2819  alkaline D-peptidase  37.03 
 
 		 388 aa  204  3e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118082  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2769  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  37.03 
 
 		 389 aa  204  3e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.48212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3033  alkaline d-peptidase  37.03 
 
 		 388 aa  204  3e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.400662  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3018  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  34.78 
 
 		 389 aa  204  3e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.470862  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2381  alkaline D-peptidase  33.94 
 
 		 385 aa  204  3e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0825231  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2576  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  36.08 
 
 		 389 aa  204  4e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.145811 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3206  beta-lactamase  36.64 
 
 		 389 aa  203  5e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3069  alkaline D-peptidase  35.79 
 
 		 388 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0417304  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2478  alkaline D-peptidase  35.39 
 
 		 388 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.431844  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2440  alkaline D-peptidase (D-stereospecific peptide hydrolase)  35.39 
 
 		 388 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00540718  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2051  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  34.02 
 
 		 385 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.319079  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3027  alkaline D-peptidase  36.73 
 
 		 388 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2661  alkaline d-peptidase  35.39 
 
 		 388 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3064  alkaline D-peptidase  34.96 
 
 		 388 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0312865  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2677  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  35.39 
 
 		 388 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000522854 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2053  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  33.67 
 
 		 385 aa  201  3e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00880281  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3030  alkaline D-peptidase  36.31 
 
 		 388 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2093  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  33.97 
 
 		 407 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3175  beta-lactamase  33.24 
 
 		 375 aa  199  7e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.702373  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0570  alkaline D-peptidase  40.71 
 
 		 370 aa  199  7e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3147  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  34.6 
 
 		 407 aa  199  9e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.943509  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23940  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  38.3 
 
 		 378 aa  199  1.0000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0755223  normal  0.0888544 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2409  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  36.99 
 
 		 388 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.37701  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2755  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  39 
 
 		 388 aa  196  6e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0494186  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2217  alkaline D-peptidase  35.45 
 
 		 388 aa  196  6e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.66047e-16 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6205  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  37.8 
 
 		 378 aa  196  8.000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2860  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  33.99 
 
 		 385 aa  196  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28769  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2824  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  37.34 
 
 		 388 aa  195  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.130693  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1969  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  43.17 
 
 		 414 aa  191  2.9999999999999997e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.980127  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3022  alkaline D-peptidase and alkaline D-peptidase fusion  38.85 
 
 		 720 aa  186  6e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0802631  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0368  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  40.25 
 
 		 399 aa  186  8e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00562308  normal  0.495103 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4727  beta-lactamase  38.35 
 
 		 366 aa  185  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3352  beta-lactamase  34.74 
 
 		 416 aa  185  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.237036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0727  alkaline D-peptidase  38.39 
 
 		 429 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3391  beta-lactamase  34.26 
 
 		 420 aa  180  4e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4368  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  35.87 
 
 		 416 aa  176  9e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041515 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3984  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  36 
 
 		 390 aa  173  5e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4691  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  38.39 
 
 		 383 aa  172  9e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1094  beta-lactamase  39.27 
 
 		 349 aa  171  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5306  beta-lactamase  33.33 
 
 		 411 aa  169  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6210  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  35.25 
 
 		 391 aa  168  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126759  normal  0.402021 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3339  beta-lactamase  34.97 
 
 		 381 aa  167  4e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1013  beta-lactamase  34.79 
 
 		 449 aa  164  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5142  alkaline D-peptidase  36.78 
 
 		 428 aa  164  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00324654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4687  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  39.52 
 
 		 373 aa  161  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0504  beta-lactamase  36.47 
 
 		 409 aa  162  2e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.35102  hitchhiker  0.00000257291 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2312  beta-lactamase  35.41 
 
 		 406 aa  161  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4155  beta-lactamase  32.64 
 
 		 378 aa  157  5.0000000000000005e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222212  normal  0.15208 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5013  alkaline D-peptidase  34.02 
 
 		 374 aa  152  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394865  normal  0.0638413 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4644  alkaline D-peptidase  32.05 
 
 		 397 aa  148  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00635481  normal  0.333853 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3468  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  35.46 
 
 		 415 aa  144  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.560934  normal  0.0158413 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1771  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  32.25 
 
 		 380 aa  143  6e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.1791 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4765  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  31.05 
 
 		 514 aa  143  8e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.263187 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3215  beta-lactamase  33.73 
 
 		 405 aa  139  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000372743  hitchhiker  0.00147977 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5167  beta-lactamase  32.12 
 
 		 713 aa  138  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.619685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0398  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  35.24 
 
 		 366 aa  138  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2538  beta-lactamase  31.15 
 
 		 416 aa  138  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2587  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.11 
 
 		 413 aa  137  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.607083  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3027  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  34.8 
 
 		 406 aa  137  5e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.899556  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3436  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  32.35 
 
 		 381 aa  137  6.0000000000000005e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2625  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  35.06 
 
 		 417 aa  135  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8159  alkaline D-peptidase  34.69 
 
 		 375 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.533807 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2316  beta-lactamase  29.33 
 
 		 467 aa  125  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0048462  decreased coverage  0.0000015739 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2565  beta-lactamase  29.32 
 
 		 378 aa  124  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.129252  normal  0.077085 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0467  beta-lactamase  32.37 
 
 		 381 aa  124  4e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.411945  decreased coverage  0.000353045 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2537  beta-lactamase  32.62 
 
 		 393 aa  124  4e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630976  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10400  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  32.65 
 
 		 421 aa  124  5e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.15445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5169  beta-lactamase  31.45 
 
 		 382 aa  122  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5597  beta-lactamase  28.96 
 
 		 406 aa  119  9e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2114  hypothetical protein  33.33 
 
 		 213 aa  119  9e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.321684  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  29.32 
 
 		 487 aa  119  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2415  beta-lactamase  30.27 
 
 		 442 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0834226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10390  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  33.11 
 
 		 426 aa  118  1.9999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0550455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2793  beta-lactamase  29.27 
 
 		 510 aa  116  6.9999999999999995e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.879811  normal  0.340954 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4430  beta-lactamase  29.07 
 
 		 434 aa  115  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.134179 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0606  serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.44 
 
 		 438 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3281  beta-lactamase  30.74 
 
 		 414 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.916487  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8711  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  32.23 
 
 		 383 aa  114  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0541056  normal  0.0995944 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0375  beta-lactamase  31.87 
 
 		 381 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13238  penicillin-binding protein, putative  28.57 
 
 		 431 aa  114  5e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.652866  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0618  beta-lactamase  30.74 
 
 		 450 aa  114  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3215  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.82 
 
 		 386 aa  113  9e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2539  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  26.99 
 
 		 445 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1885  hypothetical protein  30.25 
 
 		 420 aa  112  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4325  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27.86 
 
 		 405 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0248121  normal  0.0483573 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4818  putative penicillin-binding protein  28.21 
 
 		 416 aa  111  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.618322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2647  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.38 
 
 		 429 aa  111  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.180779  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0505  putative penicillin-binding protein  28.57 
 
 		 415 aa  111  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0859162  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5738  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27.7 
 
 		 447 aa  111  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.38713 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>