More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5597 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5597  beta-lactamase  100 
 
 
406 aa  833    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4644  alkaline D-peptidase  50 
 
 
397 aa  392  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00635481  normal  0.333853 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0467  beta-lactamase  47.35 
 
 
381 aa  337  2.9999999999999997e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.411945  decreased coverage  0.000353045 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2565  beta-lactamase  46.63 
 
 
378 aa  327  2.0000000000000001e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.129252  normal  0.077085 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8159  alkaline D-peptidase  47.22 
 
 
375 aa  308  9e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.533807 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0034  alkaline D-peptidase  38.81 
 
 
392 aa  243  6e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.698522 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3206  beta-lactamase  32.87 
 
 
389 aa  177  4e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0099  D-stereospecific peptide hydrolase  31.94 
 
 
443 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000129924  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2576  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  32.78 
 
 
389 aa  170  4e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.145811 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3018  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  32.22 
 
 
389 aa  170  4e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.470862  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2755  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  32.52 
 
 
388 aa  169  9e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0494186  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3027  alkaline D-peptidase  32.12 
 
 
388 aa  168  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2824  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  31.55 
 
 
388 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.130693  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2381  alkaline D-peptidase  30.92 
 
 
385 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0825231  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2478  alkaline D-peptidase  32.03 
 
 
388 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.431844  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2661  alkaline d-peptidase  32.03 
 
 
388 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3069  alkaline D-peptidase  31.87 
 
 
388 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0417304  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3064  alkaline D-peptidase  32.2 
 
 
388 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0312865  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2440  alkaline D-peptidase (D-stereospecific peptide hydrolase)  31.75 
 
 
388 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00540718  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2677  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  31.75 
 
 
388 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000522854 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2093  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  31.36 
 
 
407 aa  164  3e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2296  alkaline D-peptidase  30.92 
 
 
385 aa  164  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000100431 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2409  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  31.75 
 
 
388 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.37701  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3175  beta-lactamase  30.39 
 
 
375 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.702373  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2819  alkaline D-peptidase  31.61 
 
 
388 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118082  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2769  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  31.61 
 
 
389 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.48212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3033  alkaline d-peptidase  31.61 
 
 
388 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.400662  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2051  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  30.92 
 
 
385 aa  163  6e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.319079  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3147  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  31.27 
 
 
407 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.943509  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3022  alkaline D-peptidase and alkaline D-peptidase fusion  35.91 
 
 
720 aa  162  9e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0802631  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2053  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  30.56 
 
 
385 aa  162  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00880281  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3030  alkaline D-peptidase  31.37 
 
 
388 aa  161  3e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2860  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  30.94 
 
 
385 aa  160  5e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28769  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2217  alkaline D-peptidase  30.83 
 
 
388 aa  158  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  3.66047e-16 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23940  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  35.04 
 
 
378 aa  147  3e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0755223  normal  0.0888544 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0368  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  31.98 
 
 
399 aa  141  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00562308  normal  0.495103 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2896  alkaline D-peptidase  33.03 
 
 
383 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.243898  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4155  beta-lactamase  28.14 
 
 
378 aa  137  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222212  normal  0.15208 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3391  beta-lactamase  28.41 
 
 
420 aa  137  4e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1969  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  32.65 
 
 
414 aa  134  3e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.980127  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0727  alkaline D-peptidase  31.86 
 
 
429 aa  134  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4727  beta-lactamase  29.77 
 
 
366 aa  133  6e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0504  beta-lactamase  31.2 
 
 
409 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.35102  hitchhiker  0.00000257291 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2043  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.42 
 
 
421 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.956781  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3352  beta-lactamase  30.52 
 
 
416 aa  129  7.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.237036  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4691  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  31.76 
 
 
383 aa  129  9.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6210  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  31.85 
 
 
391 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126759  normal  0.402021 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2416  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.95 
 
 
411 aa  127  5e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.758876  normal  0.129808 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4689  beta-lactamase  29.47 
 
 
374 aa  126  6e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0791767  normal  0.116144 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0570  alkaline D-peptidase  30.75 
 
 
370 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126759  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1134  beta-lactamase  28.96 
 
 
459 aa  120  6e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5142  alkaline D-peptidase  34 
 
 
428 aa  119  7.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00324654  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3984  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.56 
 
 
390 aa  119  7.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4687  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  32.6 
 
 
373 aa  114  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4765  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  29.35 
 
 
514 aa  112  9e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.263187 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2538  beta-lactamase  30 
 
 
416 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2316  beta-lactamase  26.5 
 
 
467 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0048462  decreased coverage  0.0000015739 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4690  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.53 
 
 
379 aa  112  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00394326  normal  0.37742 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5013  alkaline D-peptidase  28.69 
 
 
374 aa  111  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394865  normal  0.0638413 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0398  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.68 
 
 
366 aa  110  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3215  beta-lactamase  31.76 
 
 
405 aa  110  6e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000372743  hitchhiker  0.00147977 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4368  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.19 
 
 
416 aa  109  9.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041515 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1094  beta-lactamase  29.84 
 
 
349 aa  109  9.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6205  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.01 
 
 
378 aa  108  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7182  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27.39 
 
 
420 aa  107  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0226696 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5306  beta-lactamase  27.91 
 
 
411 aa  106  7e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1263  beta-lactamase  28.45 
 
 
375 aa  106  7e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0172767 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3468  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  31.6 
 
 
415 aa  106  8e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.560934  normal  0.0158413 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2647  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  31.85 
 
 
429 aa  105  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.180779  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1013  beta-lactamase  27.56 
 
 
449 aa  105  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0375  beta-lactamase  28.27 
 
 
381 aa  104  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2114  hypothetical protein  39.66 
 
 
213 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.321684  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2312  beta-lactamase  29.11 
 
 
406 aa  102  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6304  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27.9 
 
 
420 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.397924  normal  0.258712 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3027  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27.81 
 
 
406 aa  102  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.899556  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5738  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27.65 
 
 
447 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.38713 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0606  serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  25.98 
 
 
438 aa  99  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5360  twin-arginine translocation pathway signal  27.65 
 
 
447 aa  99  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5451  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27.65 
 
 
447 aa  99  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0503905 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1771  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.35 
 
 
380 aa  98.6  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.1791 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3986  hypothetical protein  27.17 
 
 
369 aa  97.8  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.82683 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4325  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  25.72 
 
 
405 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0248121  normal  0.0483573 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2778  beta-lactamase  29.33 
 
 
380 aa  97.4  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.701087  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4094  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  25.43 
 
 
405 aa  96.3  8e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4170  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  25.43 
 
 
405 aa  96.3  8e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6008  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  26.98 
 
 
420 aa  95.9  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.960624  normal  0.883146 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4546  beta-lactamase  28.08 
 
 
740 aa  94.7  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207661  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2587  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27.97 
 
 
413 aa  93.6  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.607083  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3281  beta-lactamase  29.93 
 
 
414 aa  91.7  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.916487  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8711  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27.78 
 
 
383 aa  90.5  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0541056  normal  0.0995944 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  30.81 
 
 
559 aa  89.4  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2537  beta-lactamase  27.04 
 
 
393 aa  88.2  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630976  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3061  beta-lactamase  26.56 
 
 
351 aa  88.2  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.502148  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5167  beta-lactamase  34.13 
 
 
713 aa  87  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.619685  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  26.78 
 
 
487 aa  86.7  6e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0294  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  35.82 
 
 
834 aa  86.3  9e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00108534  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3436  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27.05 
 
 
381 aa  85.5  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2415  beta-lactamase  28.38 
 
 
442 aa  84.3  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0834226  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3615  beta-lactamase  36.84 
 
 
611 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0663146 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0116  beta-lactamase  31.41 
 
 
453 aa  84.3  0.000000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>