More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_5167 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_5167  beta-lactamase  100 
 
 
713 aa  1412    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.619685  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3027  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  53.52 
 
 
406 aa  366  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.899556  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2587  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  39.5 
 
 
413 aa  242  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.607083  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2316  beta-lactamase  36.1 
 
 
467 aa  239  1e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0048462  decreased coverage  0.0000015739 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3053  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  36.27 
 
 
420 aa  222  1.9999999999999999e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7182  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  38.98 
 
 
420 aa  218  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0226696 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6008  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  36.98 
 
 
420 aa  216  8e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.960624  normal  0.883146 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6304  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  37.82 
 
 
420 aa  212  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.397924  normal  0.258712 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2647  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  35.83 
 
 
429 aa  204  4e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.180779  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2538  beta-lactamase  34.95 
 
 
416 aa  197  5.000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5738  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  33.78 
 
 
447 aa  191  4e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.38713 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0570  alkaline D-peptidase  38.74 
 
 
370 aa  188  4e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126759  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5360  twin-arginine translocation pathway signal  33.51 
 
 
447 aa  187  8e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5451  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  33.51 
 
 
447 aa  187  8e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0503905 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1094  beta-lactamase  39.03 
 
 
349 aa  177  7e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0375  beta-lactamase  33.14 
 
 
381 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2537  beta-lactamase  33.92 
 
 
393 aa  174  5e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630976  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4430  beta-lactamase  32.36 
 
 
434 aa  174  5e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.134179 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3215  beta-lactamase  32.77 
 
 
405 aa  172  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000372743  hitchhiker  0.00147977 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0099  D-stereospecific peptide hydrolase  32.45 
 
 
443 aa  169  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000129924  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2769  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  33.02 
 
 
389 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.48212  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3069  alkaline D-peptidase  33.01 
 
 
388 aa  165  3e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0417304  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2819  alkaline D-peptidase  33.02 
 
 
388 aa  165  3e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118082  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3033  alkaline d-peptidase  33.02 
 
 
388 aa  165  3e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.400662  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3018  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  33.93 
 
 
389 aa  165  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.470862  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2315  beta-lactamase  34.33 
 
 
440 aa  164  4.0000000000000004e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00477679  hitchhiker  0.0000358597 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3027  alkaline D-peptidase  32.91 
 
 
388 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4546  beta-lactamase  41.56 
 
 
740 aa  163  9e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207661  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0368  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  35.26 
 
 
399 aa  163  9e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00562308  normal  0.495103 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4325  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  33.73 
 
 
405 aa  161  4e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0248121  normal  0.0483573 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2824  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  32.13 
 
 
388 aa  161  4e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.130693  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2755  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  34.42 
 
 
388 aa  159  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0494186  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3022  alkaline D-peptidase and alkaline D-peptidase fusion  31 
 
 
720 aa  159  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0802631  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3984  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  34.24 
 
 
390 aa  159  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3064  alkaline D-peptidase  31.45 
 
 
388 aa  158  4e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0312865  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4368  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  33.92 
 
 
416 aa  158  4e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041515 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4094  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  33.13 
 
 
405 aa  158  4e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4170  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  33.13 
 
 
405 aa  158  4e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3030  alkaline D-peptidase  31.19 
 
 
388 aa  156  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0727  alkaline D-peptidase  32.25 
 
 
429 aa  155  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3206  beta-lactamase  32.11 
 
 
389 aa  155  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6205  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  34.43 
 
 
378 aa  155  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2043  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  34.06 
 
 
421 aa  154  4e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.956781  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3534  amino acid adenylation  31.98 
 
 
2457 aa  154  5e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2217  alkaline D-peptidase  30.58 
 
 
388 aa  154  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  3.66047e-16 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1119  hypothetical protein  29.23 
 
 
371 aa  154  8e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2896  alkaline D-peptidase  34.56 
 
 
383 aa  154  8e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.243898  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2576  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  32.59 
 
 
389 aa  153  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.145811 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3175  beta-lactamase  30.26 
 
 
375 aa  151  4e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.702373  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4155  beta-lactamase  30.79 
 
 
378 aa  151  4e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222212  normal  0.15208 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3510  beta-lactamase  30.95 
 
 
409 aa  151  4e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.143562 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1123  hypothetical protein  28.65 
 
 
371 aa  151  5e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3689  beta-lactamase  29.43 
 
 
422 aa  151  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2381  alkaline D-peptidase  32.4 
 
 
385 aa  150  6e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0825231  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2053  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  31.15 
 
 
385 aa  150  7e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00880281  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2296  alkaline D-peptidase  31.46 
 
 
385 aa  150  8e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000100431 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2093  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  31.46 
 
 
407 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0606  serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  31.36 
 
 
438 aa  148  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2051  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  31.15 
 
 
385 aa  148  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.319079  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3147  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  31.7 
 
 
407 aa  147  5e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.943509  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2409  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  31.5 
 
 
388 aa  147  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.37701  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0034  alkaline D-peptidase  31.16 
 
 
392 aa  147  8.000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.698522 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2860  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  31.7 
 
 
385 aa  146  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28769  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1969  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  33.33 
 
 
414 aa  145  2e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.980127  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2478  alkaline D-peptidase  31.58 
 
 
388 aa  145  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.431844  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5013  alkaline D-peptidase  33.88 
 
 
374 aa  145  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394865  normal  0.0638413 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2440  alkaline D-peptidase (D-stereospecific peptide hydrolase)  31.29 
 
 
388 aa  145  3e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00540718  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2661  alkaline d-peptidase  31.58 
 
 
388 aa  145  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2677  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  31.29 
 
 
388 aa  145  3e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000522854 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0459  beta-lactamase  31.59 
 
 
415 aa  144  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8711  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  31.65 
 
 
383 aa  144  8e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0541056  normal  0.0995944 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10404  lipoprotein lpqK  30.09 
 
 
409 aa  141  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3422  beta-lactamase  33.87 
 
 
593 aa  139  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.126074  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5142  alkaline D-peptidase  32.94 
 
 
428 aa  139  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00324654  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1013  beta-lactamase  35.82 
 
 
449 aa  138  4e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3731  beta-lactamase  33.55 
 
 
603 aa  138  5e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.227339 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4691  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  31.86 
 
 
383 aa  136  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3615  beta-lactamase  33.97 
 
 
611 aa  136  9.999999999999999e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0663146 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3254  beta-lactamase  30.09 
 
 
403 aa  136  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.655061 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3243  beta-lactamase  30.82 
 
 
387 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3305  beta-lactamase  30.09 
 
 
403 aa  136  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0079678 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5169  beta-lactamase  30.51 
 
 
382 aa  135  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  28.96 
 
 
487 aa  135  3e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1134  beta-lactamase  33.44 
 
 
459 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3468  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  32.56 
 
 
415 aa  134  6.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.560934  normal  0.0158413 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2416  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.68 
 
 
411 aa  133  9e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.758876  normal  0.129808 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3339  beta-lactamase  32.63 
 
 
381 aa  133  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4727  beta-lactamase  28.92 
 
 
366 aa  133  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4689  beta-lactamase  29.89 
 
 
374 aa  132  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0791767  normal  0.116144 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4765  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  31.1 
 
 
514 aa  131  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.263187 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0504  beta-lactamase  30.41 
 
 
409 aa  131  5.0000000000000004e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.35102  hitchhiker  0.00000257291 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2793  beta-lactamase  32.2 
 
 
510 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.879811  normal  0.340954 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6210  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  31.9 
 
 
391 aa  130  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126759  normal  0.402021 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1771  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  32.31 
 
 
380 aa  128  4.0000000000000003e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.1791 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3391  beta-lactamase  33.01 
 
 
420 aa  127  5e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  33.13 
 
 
442 aa  127  8.000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3986  hypothetical protein  32.83 
 
 
369 aa  127  9e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.82683 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  27.99 
 
 
578 aa  127  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13238  penicillin-binding protein, putative  26.87 
 
 
431 aa  125  3e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.652866  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0278  beta-lactamase  32 
 
 
406 aa  125  4e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>