More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0375 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0375  beta-lactamase  100 
 
 
381 aa  773    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4546  beta-lactamase  69.67 
 
 
740 aa  523  1e-147  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207661  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0606  serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  53.31 
 
 
438 aa  399  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4094  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  53.59 
 
 
405 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4170  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  53.59 
 
 
405 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4325  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  53.59 
 
 
405 aa  391  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0248121  normal  0.0483573 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2647  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  47.59 
 
 
429 aa  295  7e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.180779  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3053  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  42.54 
 
 
420 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2316  beta-lactamase  42.97 
 
 
467 aa  266  2.9999999999999995e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0048462  decreased coverage  0.0000015739 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6008  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  44.58 
 
 
420 aa  264  2e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.960624  normal  0.883146 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6304  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  43.67 
 
 
420 aa  260  3e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.397924  normal  0.258712 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7182  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  42.94 
 
 
420 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0226696 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2538  beta-lactamase  41.59 
 
 
416 aa  249  5e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5738  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  41.8 
 
 
447 aa  247  3e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.38713 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5360  twin-arginine translocation pathway signal  41.53 
 
 
447 aa  243  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5451  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  41.53 
 
 
447 aa  243  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0503905 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3027  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  34.26 
 
 
406 aa  187  3e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.899556  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5167  beta-lactamase  33.14 
 
 
713 aa  175  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.619685  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3468  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  37.67 
 
 
415 aa  170  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.560934  normal  0.0158413 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6205  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  33.91 
 
 
378 aa  170  4e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3215  beta-lactamase  31.94 
 
 
405 aa  169  7e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000372743  hitchhiker  0.00147977 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0368  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  33.71 
 
 
399 aa  169  1e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00562308  normal  0.495103 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1094  beta-lactamase  34.98 
 
 
349 aa  160  5e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2587  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  32.67 
 
 
413 aa  159  6e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.607083  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0570  alkaline D-peptidase  33.67 
 
 
370 aa  154  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126759  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1119  hypothetical protein  30.72 
 
 
371 aa  151  2e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0727  alkaline D-peptidase  30.46 
 
 
429 aa  149  7e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1123  hypothetical protein  30.14 
 
 
371 aa  149  8e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2537  beta-lactamase  34.19 
 
 
393 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630976  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4430  beta-lactamase  30.5 
 
 
434 aa  148  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.134179 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1771  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  32.6 
 
 
380 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.1791 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4765  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  33.03 
 
 
514 aa  147  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.263187 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5013  alkaline D-peptidase  34.34 
 
 
374 aa  147  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394865  normal  0.0638413 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5169  beta-lactamase  31.34 
 
 
382 aa  143  4e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1013  beta-lactamase  31.65 
 
 
449 aa  143  5e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3206  beta-lactamase  32.62 
 
 
389 aa  143  5e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3022  alkaline D-peptidase and alkaline D-peptidase fusion  32.33 
 
 
720 aa  140  3e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0802631  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3984  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.83 
 
 
390 aa  140  3e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0504  beta-lactamase  28.42 
 
 
409 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.35102  hitchhiker  0.00000257291 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2043  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  32.26 
 
 
421 aa  136  7.000000000000001e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.956781  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1969  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  31.1 
 
 
414 aa  135  9.999999999999999e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.980127  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2093  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  31.35 
 
 
407 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3018  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  31.01 
 
 
389 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.470862  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2860  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  31.68 
 
 
385 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28769  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3281  beta-lactamase  32.24 
 
 
414 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.916487  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2053  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  31.02 
 
 
385 aa  134  3e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00880281  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2051  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  31.02 
 
 
385 aa  133  5e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.319079  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2217  alkaline D-peptidase  31.87 
 
 
388 aa  133  5e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  3.66047e-16 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3147  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  31.02 
 
 
407 aa  133  6e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.943509  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3030  alkaline D-peptidase  32.5 
 
 
388 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0099  D-stereospecific peptide hydrolase  31.91 
 
 
443 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000129924  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4368  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.75 
 
 
416 aa  132  9e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041515 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4691  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.7 
 
 
383 aa  132  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2296  alkaline D-peptidase  31.35 
 
 
385 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000100431 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5142  alkaline D-peptidase  34.17 
 
 
428 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00324654  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6210  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  29.41 
 
 
391 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126759  normal  0.402021 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2755  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  30.6 
 
 
388 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0494186  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0034  alkaline D-peptidase  31.33 
 
 
392 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.698522 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2576  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  30.72 
 
 
389 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.145811 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3175  beta-lactamase  30.69 
 
 
375 aa  129  6e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.702373  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8711  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  26.37 
 
 
383 aa  128  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0541056  normal  0.0995944 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2824  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  32.05 
 
 
388 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.130693  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3069  alkaline D-peptidase  30.82 
 
 
388 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0417304  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3534  amino acid adenylation  31.6 
 
 
2457 aa  127  3e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2381  alkaline D-peptidase  29.52 
 
 
385 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0825231  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2819  alkaline D-peptidase  32.29 
 
 
388 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118082  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3033  alkaline d-peptidase  32.29 
 
 
388 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.400662  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2769  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  31.76 
 
 
389 aa  126  5e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.48212  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3689  beta-lactamase  33.6 
 
 
422 aa  126  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4644  alkaline D-peptidase  29.43 
 
 
397 aa  126  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00635481  normal  0.333853 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3027  alkaline D-peptidase  31.45 
 
 
388 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8159  alkaline D-peptidase  33.45 
 
 
375 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.533807 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3064  alkaline D-peptidase  30.28 
 
 
388 aa  125  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0312865  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4155  beta-lactamase  30.23 
 
 
378 aa  124  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222212  normal  0.15208 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  30.25 
 
 
446 aa  124  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4687  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.61 
 
 
373 aa  122  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0398  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.61 
 
 
366 aa  122  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2312  beta-lactamase  29.52 
 
 
406 aa  121  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23940  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  34.14 
 
 
378 aa  120  3.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0755223  normal  0.0888544 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  31.62 
 
 
377 aa  119  9e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2409  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  29.58 
 
 
388 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.37701  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2315  beta-lactamase  30.53 
 
 
440 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00477679  hitchhiker  0.0000358597 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.99 
 
 
392 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1906  beta-lactamase  27.73 
 
 
369 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2625  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  36.09 
 
 
417 aa  117  3e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2416  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  32.97 
 
 
411 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.758876  normal  0.129808 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2478  alkaline D-peptidase  29.23 
 
 
388 aa  116  6e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.431844  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2440  alkaline D-peptidase (D-stereospecific peptide hydrolase)  29.23 
 
 
388 aa  116  6e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00540718  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2661  alkaline d-peptidase  29.23 
 
 
388 aa  116  6e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1013  beta-lactamase  29.24 
 
 
367 aa  116  6e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2677  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  29.23 
 
 
388 aa  116  6e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000522854 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2080  beta-lactamase  31.31 
 
 
370 aa  115  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.16247  normal  0.44675 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  31.08 
 
 
442 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3751  beta-lactamase  33.94 
 
 
395 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000498352 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4727  beta-lactamase  29.12 
 
 
366 aa  115  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  29.01 
 
 
578 aa  114  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2896  alkaline D-peptidase  31.62 
 
 
383 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.243898  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3339  beta-lactamase  29.34 
 
 
381 aa  114  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2638  beta-lactamase  30.46 
 
 
445 aa  114  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1134  beta-lactamase  32 
 
 
459 aa  114  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>