More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3615 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3422  beta-lactamase  86.31 
 
 		 593 aa  931    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.126074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3731  beta-lactamase  83.58 
 
 		 603 aa  935    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.227339 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3615  beta-lactamase  100 
 
 		 611 aa  1213    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0663146 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  31.94 
 
 		 578 aa  295  2e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  40.22 
 
 		 487 aa  260  5.0000000000000005e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  40.06 
 
 		 392 aa  216  9e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  38.89 
 
 		 442 aa  215  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2638  beta-lactamase  38.7 
 
 		 445 aa  211  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  29.53 
 
 		 446 aa  212  2e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1906  beta-lactamase  33.06 
 
 		 369 aa  204  3e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2294  penicillin-binding protein, putative  35.19 
 
 		 434 aa  203  7e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.272122  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  34.78 
 
 		 477 aa  201  3e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  39.56 
 
 		 356 aa  197  3e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2736  beta-lactamase  27.59 
 
 		 417 aa  180  4.999999999999999e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.416885  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0343  beta-lactamase  35.4 
 
 		 482 aa  177  4e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2415  beta-lactamase  30.86 
 
 		 442 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0834226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0505  putative penicillin-binding protein  28.44 
 
 		 415 aa  170  6e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0859162  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0558  putative penicillin-binding protein  28.31 
 
 		 413 aa  169  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.622752  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0416  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  28.01 
 
 		 421 aa  168  2.9999999999999998e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0430511  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0412  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  28.01 
 
 		 422 aa  168  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0419  beta-lactamase  28.8 
 
 		 416 aa  168  2.9999999999999998e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4818  putative penicillin-binding protein  28.1 
 
 		 416 aa  168  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.618322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0483  putative penicillin-binding protein  28.71 
 
 		 412 aa  167  5e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0473  penicillin-binding protein  28.01 
 
 		 421 aa  167  5.9999999999999996e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0502  penicillin-binding protein  28.01 
 
 		 412 aa  167  6.9999999999999995e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0555  penicillin-binding protein, putative  27.71 
 
 		 413 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.389605  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1936  beta-lactamase  32.43 
 
 		 848 aa  166  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.178754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1832  beta-lactamase  28.54 
 
 		 446 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.29245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0428  beta-lactamase  28.53 
 
 		 404 aa  164  6e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.354595  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2539  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.02 
 
 		 445 aa  163  9e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0618  beta-lactamase  30.96 
 
 		 450 aa  162  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5985  beta-lactamase  30.18 
 
 		 342 aa  162  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2717  beta-lactamase  32.8 
 
 		 470 aa  162  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  31.46 
 
 		 377 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1520  Beta-lactamase  26.88 
 
 		 537 aa  157  4e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000638983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0939  beta-lactamase  34.37 
 
 		 338 aa  158  4e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.18746 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0831  beta-lactamase  31.88 
 
 		 422 aa  155  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4043  beta-lactamase  35.24 
 
 		 361 aa  154  2.9999999999999998e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13238  penicillin-binding protein, putative  28.94 
 
 		 431 aa  154  5.9999999999999996e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.652866  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5167  beta-lactamase  33.97 
 
 		 713 aa  150  5e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.619685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  28.99 
 
 		 362 aa  150  6e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  25.78 
 
 		 559 aa  149  2.0000000000000003e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2573  beta-lactamase  34.74 
 
 		 476 aa  148  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.369136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1457  beta-lactamase  28.11 
 
 		 325 aa  148  3e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.17461  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5443  putative beta-lactamase  32.65 
 
 		 364 aa  147  6e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.65256  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4280  beta-lactamase  32.01 
 
 		 330 aa  147  6e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2316  beta-lactamase  30.56 
 
 		 467 aa  146  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0048462  decreased coverage  0.0000015739 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4152  beta-lactamase  32.2 
 
 		 378 aa  146  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0848463  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3027  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  33.88 
 
 		 406 aa  146  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.899556  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2742  beta-lactamase  29.24 
 
 		 376 aa  145  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0750006  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1086  beta-lactamase  32.2 
 
 		 378 aa  145  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3512  beta-lactamase  30.95 
 
 		 364 aa  144  5e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3206  beta-lactamase  32 
 
 		 389 aa  144  5e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5169  beta-lactamase  33.53 
 
 		 382 aa  143  9e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4174  beta-lactamase  27.17 
 
 		 378 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000652338  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3498  beta-lactamase  28.87 
 
 		 375 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3294  penicillin-binding protein  30.33 
 
 		 377 aa  141  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.678008  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3511  putative penicillin-binding protein  30.33 
 
 		 377 aa  141  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3554  penicillin-binding protein  30.33 
 
 		 377 aa  141  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3872  beta-lactamase  30.83 
 
 		 375 aa  141  3.9999999999999997e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4110  beta-lactamase  26.9 
 
 		 379 aa  140  6e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8711  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  31.48 
 
 		 383 aa  139  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0541056  normal  0.0995944 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3507  penicillin-binding protein, putative  30.33 
 
 		 375 aa  138  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3264  beta-lactamase  30.03 
 
 		 377 aa  139  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.664291  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3518  putative penicillin-binding protein  30.33 
 
 		 377 aa  138  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3208  beta-lactamase  30.03 
 
 		 377 aa  138  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0230735  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2991  beta-lactamase  34.44 
 
 		 475 aa  139  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1750  beta-lactamase  28.57 
 
 		 375 aa  139  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.339251  normal  0.99151 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2177  beta-lactamase  24.04 
 
 		 543 aa  138  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.816506 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2755  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  31.77 
 
 		 388 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0494186  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3688  beta-lactamase  24.04 
 
 		 543 aa  138  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497517  normal  0.011807 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4919  beta-lactamase  30 
 
 		 415 aa  138  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.318437  normal  0.850487 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7182  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.38 
 
 		 420 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0226696 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3210  beta-lactamase  29.04 
 
 		 375 aa  137  6.0000000000000005e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.767379  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0159  beta-lactamase  30.34 
 
 		 410 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2824  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30 
 
 		 388 aa  134  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.130693  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0570  alkaline D-peptidase  32.83 
 
 		 370 aa  134  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126759  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3022  alkaline D-peptidase and alkaline D-peptidase fusion  33.68 
 
 		 720 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0802631  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0863  beta-lactamase  32.09 
 
 		 363 aa  134  3.9999999999999996e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3069  alkaline D-peptidase  32.62 
 
 		 388 aa  134  5e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0417304  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3030  alkaline D-peptidase  31.76 
 
 		 388 aa  134  5e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2793  beta-lactamase  31.21 
 
 		 510 aa  134  5e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.879811  normal  0.340954 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6206  beta-lactamase  33.01 
 
 		 321 aa  134  6e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.324563 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4094  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.9 
 
 		 405 aa  134  6e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2143  beta-lactamase  33.42 
 
 		 401 aa  134  6e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.559529  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2217  alkaline D-peptidase  31.76 
 
 		 388 aa  134  6e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.66047e-16 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4170  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.9 
 
 		 405 aa  134  6e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0999  beta-lactamase  30.41 
 
 		 367 aa  133  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0117018 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4546  beta-lactamase  32.93 
 
 		 740 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207661  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2819  alkaline D-peptidase  32.38 
 
 		 388 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118082  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3147  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  30.07 
 
 		 407 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.943509  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2769  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  32.38 
 
 		 389 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.48212  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0973  beta-lactamase  27.46 
 
 		 514 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3033  alkaline d-peptidase  32.38 
 
 		 388 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.400662  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0034  alkaline D-peptidase  35.06 
 
 		 392 aa  132  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.698522 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4325  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.61 
 
 		 405 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0248121  normal  0.0483573 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3027  alkaline D-peptidase  32.38 
 
 		 388 aa  131  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2053  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  30.74 
 
 		 385 aa  131  3e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00880281  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2587  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.38 
 
 		 413 aa  132  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.607083  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2576  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  31 
 
 		 389 aa  131  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.145811 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>