More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3512 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3512  beta-lactamase  100 
 
 		 364 aa  754    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1936  beta-lactamase  37.18 
 
 		 848 aa  224  1e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.178754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2357  beta-lactamase  35.74 
 
 		 381 aa  218  1e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0831  beta-lactamase  33.6 
 
 		 422 aa  202  9e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3751  beta-lactamase  36.31 
 
 		 395 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000498352 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1031  beta-lactamase  38.15 
 
 		 358 aa  197  3e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  37.94 
 
 		 356 aa  196  7e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5443  putative beta-lactamase  36.6 
 
 		 364 aa  193  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.65256  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2793  beta-lactamase  34.64 
 
 		 510 aa  181  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.879811  normal  0.340954 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1457  beta-lactamase  33.03 
 
 		 325 aa  174  2.9999999999999996e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.17461  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1520  Beta-lactamase  32.16 
 
 		 537 aa  169  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000638983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2638  beta-lactamase  35.29 
 
 		 445 aa  165  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  32.02 
 
 		 446 aa  158  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  34.47 
 
 		 442 aa  159  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4919  beta-lactamase  33.94 
 
 		 415 aa  158  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.318437  normal  0.850487 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  32.78 
 
 		 362 aa  157  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0939  beta-lactamase  32.46 
 
 		 338 aa  153  5e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.18746 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  33.15 
 
 		 487 aa  153  5e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0159  beta-lactamase  30.21 
 
 		 410 aa  152  8e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  30.53 
 
 		 477 aa  152  8.999999999999999e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1832  beta-lactamase  30.59 
 
 		 446 aa  152  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.29245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  32.13 
 
 		 578 aa  148  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4280  beta-lactamase  32.1 
 
 		 330 aa  148  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4213  beta-lactamase  28.83 
 
 		 403 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.161495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  29.36 
 
 		 559 aa  147  4.0000000000000006e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2294  penicillin-binding protein, putative  29.3 
 
 		 434 aa  146  6e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.272122  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.05 
 
 		 392 aa  143  4e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2177  beta-lactamase  29.86 
 
 		 543 aa  142  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.816506 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3688  beta-lactamase  29.86 
 
 		 543 aa  142  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497517  normal  0.011807 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2968  beta-lactamase  33.23 
 
 		 462 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5985  beta-lactamase  30.94 
 
 		 342 aa  140  4.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0863  beta-lactamase  30.28 
 
 		 363 aa  139  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3175  beta-lactamase  30.82 
 
 		 351 aa  137  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0119788  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1906  beta-lactamase  31.13 
 
 		 369 aa  138  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  29.33 
 
 		 377 aa  137  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3422  beta-lactamase  30.21 
 
 		 593 aa  136  5e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.126074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3615  beta-lactamase  30.36 
 
 		 611 aa  135  9e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0663146 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2736  beta-lactamase  28.32 
 
 		 417 aa  132  6e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.416885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0428  beta-lactamase  30.18 
 
 		 404 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.354595  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4671  alkaline D-peptidase, putative  29.56 
 
 		 330 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.126225  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3731  beta-lactamase  29.61 
 
 		 603 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.227339 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0412  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  31.08 
 
 		 422 aa  130  3e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1876  beta-lactamase  28.83 
 
 		 493 aa  130  3e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0473  penicillin-binding protein  31.08 
 
 		 421 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0502  penicillin-binding protein  30.88 
 
 		 412 aa  129  6e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0558  putative penicillin-binding protein  30.41 
 
 		 413 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.622752  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0416  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  31.08 
 
 		 421 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0430511  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5150  beta-lactamase  30.06 
 
 		 369 aa  129  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.654906 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0555  penicillin-binding protein, putative  30.41 
 
 		 413 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.389605  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0483  putative penicillin-binding protein  30.74 
 
 		 412 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4818  putative penicillin-binding protein  30.04 
 
 		 416 aa  127  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.618322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0505  putative penicillin-binding protein  30.04 
 
 		 415 aa  127  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0859162  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0419  beta-lactamase  30.04 
 
 		 416 aa  125  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0099  D-stereospecific peptide hydrolase  29.05 
 
 		 443 aa  125  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000129924  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2576  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  28.48 
 
 		 389 aa  125  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.145811 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1357  beta-lactamase  29.7 
 
 		 378 aa  125  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2717  beta-lactamase  28.86 
 
 		 470 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3147  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  30.07 
 
 		 407 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.943509  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2093  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  30.41 
 
 		 407 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3175  beta-lactamase  28.53 
 
 		 375 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.702373  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4788  beta-lactamase  28.89 
 
 		 400 aa  120  3e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.416977  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3018  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.39 
 
 		 389 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.470862  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6206  beta-lactamase  30.19 
 
 		 321 aa  120  3.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.324563 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2381  alkaline D-peptidase  29.14 
 
 		 385 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0825231  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3206  beta-lactamase  30.1 
 
 		 389 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2296  alkaline D-peptidase  28.22 
 
 		 385 aa  119  9e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000100431 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2053  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  28.22 
 
 		 385 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00880281  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2860  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  29.22 
 
 		 385 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28769  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2433  penicillin-binding protein  30.18 
 
 		 340 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0197006  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2051  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  28.22 
 
 		 385 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.319079  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4636  beta-lactamase  26.61 
 
 		 496 aa  117  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2668  penicillin-binding protein  30.18 
 
 		 348 aa  117  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162016 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2409  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  28.39 
 
 		 388 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.37701  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2394  penicillin-binding protein  29.46 
 
 		 340 aa  117  5e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.70958  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2469  penicillin-binding protein  29.88 
 
 		 340 aa  116  6e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.242822  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2650  penicillin-binding protein  29.88 
 
 		 340 aa  116  6e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1439  Beta-lactamase  29.56 
 
 		 330 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0862025  normal  0.346233 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1818  beta-lactamase  29.85 
 
 		 513 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2198  beta-lactamase  27.97 
 
 		 543 aa  115  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.176904  normal  0.0317754 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  27.95 
 
 		 505 aa  114  3e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2478  alkaline D-peptidase  28.08 
 
 		 388 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.431844  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2661  alkaline d-peptidase  28.08 
 
 		 388 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8721  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  26.15 
 
 		 480 aa  114  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3215  beta-lactamase  29.62 
 
 		 405 aa  114  3e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000372743  hitchhiker  0.00147977 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2587  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  26.53 
 
 		 413 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.607083  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2819  alkaline D-peptidase  29.13 
 
 		 388 aa  113  5e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118082  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2440  alkaline D-peptidase (D-stereospecific peptide hydrolase)  28.08 
 
 		 388 aa  113  5e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00540718  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2677  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  28.08 
 
 		 388 aa  113  5e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000522854 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3033  alkaline d-peptidase  29.13 
 
 		 388 aa  113  5e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.400662  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2769  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  29.13 
 
 		 389 aa  113  6e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.48212  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2755  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  28.75 
 
 		 388 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0494186  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4043  beta-lactamase  30.77 
 
 		 361 aa  112  7.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0343  beta-lactamase  28.45 
 
 		 482 aa  112  9e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3030  alkaline D-peptidase  30.74 
 
 		 388 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3210  beta-lactamase  28.94 
 
 		 375 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.767379  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3027  alkaline D-peptidase  29.13 
 
 		 388 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2573  beta-lactamase  29.97 
 
 		 476 aa  111  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.369136  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3069  alkaline D-peptidase  29.45 
 
 		 388 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0417304  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2259  beta-lactamase  34.18 
 
 		 416 aa  111  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.296569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2217  alkaline D-peptidase  30.41 
 
 		 388 aa  110  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.66047e-16 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>