More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1876 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1876  beta-lactamase  100 
 
 
493 aa  987    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0863  beta-lactamase  35.26 
 
 
363 aa  171  3e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5150  beta-lactamase  36.86 
 
 
369 aa  162  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.654906 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2080  beta-lactamase  35.03 
 
 
370 aa  154  4e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.16247  normal  0.44675 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3512  beta-lactamase  28.83 
 
 
364 aa  130  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  27.07 
 
 
487 aa  122  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  29.66 
 
 
578 aa  109  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1906  beta-lactamase  27.55 
 
 
369 aa  106  8e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  25 
 
 
446 aa  105  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1832  beta-lactamase  27.61 
 
 
446 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.29245  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2793  beta-lactamase  27.54 
 
 
510 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.879811  normal  0.340954 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2294  penicillin-binding protein, putative  27.12 
 
 
434 aa  102  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.272122  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3751  beta-lactamase  26.02 
 
 
395 aa  101  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000498352 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2736  beta-lactamase  27.48 
 
 
417 aa  99.4  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.416885  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2573  beta-lactamase  29.41 
 
 
476 aa  99.4  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.369136  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  26.15 
 
 
392 aa  99.8  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3615  beta-lactamase  29.88 
 
 
611 aa  98.2  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0663146 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1936  beta-lactamase  26.85 
 
 
848 aa  98.2  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.178754  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27.76 
 
 
442 aa  97.1  7e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4346  Beta-lactamase  26.28 
 
 
547 aa  95.9  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3422  beta-lactamase  29.27 
 
 
593 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.126074  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0603  beta-lactamase  31.15 
 
 
409 aa  95.9  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.875784  normal  0.055059 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3731  beta-lactamase  29.39 
 
 
603 aa  94.7  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.227339 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3175  beta-lactamase  26.46 
 
 
375 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.702373  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3147  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  26.79 
 
 
407 aa  93.6  7e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.943509  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0505  putative penicillin-binding protein  27.65 
 
 
415 aa  93.6  7e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0859162  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1520  Beta-lactamase  28.21 
 
 
537 aa  93.6  8e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000638983  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2053  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  28.4 
 
 
385 aa  93.2  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00880281  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2051  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  28.4 
 
 
385 aa  93.2  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.319079  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2296  alkaline D-peptidase  27.41 
 
 
385 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000100431 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8711  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  31.03 
 
 
383 aa  91.7  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0541056  normal  0.0995944 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4818  putative penicillin-binding protein  27.27 
 
 
416 aa  91.3  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.618322  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4727  beta-lactamase  29.54 
 
 
366 aa  91.3  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2093  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  26.79 
 
 
407 aa  90.5  6e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2638  beta-lactamase  28.05 
 
 
445 aa  90.5  7e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  25.93 
 
 
356 aa  90.1  8e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6092  beta-lactamase  30.74 
 
 
419 aa  89.7  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.152854 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5013  alkaline D-peptidase  29.06 
 
 
374 aa  90.1  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394865  normal  0.0638413 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2415  beta-lactamase  28 
 
 
442 aa  90.1  9e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0834226  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0555  penicillin-binding protein, putative  27.41 
 
 
413 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.389605  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0831  beta-lactamase  24.64 
 
 
422 aa  89.7  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146809  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2860  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  26.48 
 
 
385 aa  89  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28769  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  24.05 
 
 
362 aa  89  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2381  alkaline D-peptidase  28.57 
 
 
385 aa  89  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0825231  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37770  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  28.53 
 
 
366 aa  89  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.269534  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5107  beta-lactamase  23.16 
 
 
338 aa  88.2  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.434559  normal  0.256673 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2394  penicillin-binding protein  23.79 
 
 
340 aa  87.8  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.70958  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5443  putative beta-lactamase  28.9 
 
 
364 aa  87.8  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.65256  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3498  beta-lactamase  25.61 
 
 
375 aa  87.8  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0099  D-stereospecific peptide hydrolase  25.77 
 
 
443 aa  87.4  5e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000129924  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2968  beta-lactamase  23.13 
 
 
462 aa  87.4  5e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2433  penicillin-binding protein  23.79 
 
 
340 aa  87.4  6e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0197006  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2668  penicillin-binding protein  23.79 
 
 
348 aa  87.4  6e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162016 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1094  beta-lactamase  30.07 
 
 
349 aa  86.7  9e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2632  penicillin-binding protein  24.16 
 
 
341 aa  86.7  9e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.149759  decreased coverage  0.000000240236 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4919  beta-lactamase  23.85 
 
 
415 aa  85.9  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.318437  normal  0.850487 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3210  beta-lactamase  26.23 
 
 
375 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.767379  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10400  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  29.07 
 
 
421 aa  86.3  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.15445  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2469  penicillin-binding protein  23.79 
 
 
340 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.242822  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0416  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  26.67 
 
 
421 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0430511  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0412  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  26.67 
 
 
422 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4350  Beta-lactamase  30.88 
 
 
553 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2650  penicillin-binding protein  23.79 
 
 
340 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0473  penicillin-binding protein  26.67 
 
 
421 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6206  beta-lactamase  28.15 
 
 
321 aa  85.1  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.324563 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4280  beta-lactamase  26.6 
 
 
330 aa  85.5  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0502  penicillin-binding protein  26.67 
 
 
412 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0483  putative penicillin-binding protein  26.67 
 
 
412 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0558  putative penicillin-binding protein  26.3 
 
 
413 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.622752  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4788  beta-lactamase  23.16 
 
 
400 aa  84.7  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.416977  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0343  beta-lactamase  27.42 
 
 
482 aa  84.7  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12878  beta-lactamase, putative  25.59 
 
 
504 aa  85.1  0.000000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0618  beta-lactamase  27.66 
 
 
450 aa  84.7  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0419  beta-lactamase  25.27 
 
 
416 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3352  beta-lactamase  29.52 
 
 
416 aa  84.3  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.237036  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  22.41 
 
 
477 aa  84.7  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3507  penicillin-binding protein, putative  26.38 
 
 
375 aa  84.3  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04833  beta-lactamase  26.8 
 
 
529 aa  84  0.000000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0034  alkaline D-peptidase  28.3 
 
 
392 aa  84  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.698522 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3163  beta-lactamase  28.79 
 
 
862 aa  84  0.000000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111664  normal  0.813914 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3518  putative penicillin-binding protein  26.3 
 
 
377 aa  83.6  0.000000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13238  penicillin-binding protein, putative  25.23 
 
 
431 aa  83.6  0.000000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.652866  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2679  penicillin-binding protein  25.28 
 
 
341 aa  83.2  0.000000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3872  beta-lactamase  26.69 
 
 
375 aa  83.2  0.000000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3264  beta-lactamase  25.77 
 
 
377 aa  83.2  0.000000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.664291  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1750  beta-lactamase  25.68 
 
 
375 aa  83.2  0.000000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.339251  normal  0.99151 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4644  alkaline D-peptidase  28.99 
 
 
397 aa  83.2  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00635481  normal  0.333853 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1818  beta-lactamase  30.82 
 
 
513 aa  82.8  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  26.18 
 
 
377 aa  82.8  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3339  beta-lactamase  26.77 
 
 
381 aa  82  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1551  beta-lactamase  27.92 
 
 
333 aa  82.4  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.345066  normal  0.407276 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4257  beta-lactamase  28.57 
 
 
464 aa  82  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1301  beta-lactamase  29.01 
 
 
417 aa  82  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207216  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2539  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  23.96 
 
 
445 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  23.74 
 
 
559 aa  82  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1234  beta-lactamase  26.67 
 
 
519 aa  82.4  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565811  normal  0.301621 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4213  beta-lactamase  23.17 
 
 
403 aa  82  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.161495  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5167  beta-lactamase  28.53 
 
 
713 aa  81.6  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.619685  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3144  beta-lactamase  26.58 
 
 
590 aa  81.3  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0428  beta-lactamase  24.52 
 
 
404 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.354595  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>