More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1551 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1551  beta-lactamase  100 
 
 
333 aa  662    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.345066  normal  0.407276 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2632  penicillin-binding protein  32.4 
 
 
341 aa  203  4e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.149759  decreased coverage  0.000000240236 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2433  penicillin-binding protein  32.11 
 
 
340 aa  202  6e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0197006  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2469  penicillin-binding protein  32.01 
 
 
340 aa  202  7e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.242822  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2668  penicillin-binding protein  32.11 
 
 
348 aa  202  7e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162016 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2650  penicillin-binding protein  32.01 
 
 
340 aa  202  7e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2394  penicillin-binding protein  32.11 
 
 
340 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.70958  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2679  penicillin-binding protein  32.73 
 
 
341 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1777  beta-lactamase  31.68 
 
 
343 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00484911  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2721  penicillin-binding protein  31.8 
 
 
340 aa  191  1e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0897232  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2881  beta-lactamase  32.43 
 
 
338 aa  188  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.74645  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37770  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  36.59 
 
 
366 aa  167  2e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.269534  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0502  beta-lactamase  35.28 
 
 
358 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4043  beta-lactamase  30.89 
 
 
361 aa  135  8e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  32.46 
 
 
392 aa  127  3e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3615  beta-lactamase  35.96 
 
 
611 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0663146 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  27.24 
 
 
578 aa  117  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  26.59 
 
 
487 aa  116  5e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  35.26 
 
 
356 aa  115  6.9999999999999995e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  31.11 
 
 
362 aa  115  8.999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0416  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  29.3 
 
 
421 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0430511  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0483  putative penicillin-binding protein  29.3 
 
 
412 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2573  beta-lactamase  33.11 
 
 
476 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.369136  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0473  penicillin-binding protein  29.3 
 
 
421 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0502  penicillin-binding protein  29.3 
 
 
412 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3731  beta-lactamase  38.3 
 
 
603 aa  112  6e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.227339 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0412  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  29.3 
 
 
422 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0558  putative penicillin-binding protein  28.88 
 
 
413 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.622752  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2080  beta-lactamase  33.22 
 
 
370 aa  112  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.16247  normal  0.44675 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3422  beta-lactamase  34.31 
 
 
593 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.126074  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0419  beta-lactamase  28.52 
 
 
416 aa  110  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3147  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  30.07 
 
 
407 aa  110  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.943509  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0505  putative penicillin-binding protein  28.91 
 
 
415 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0859162  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2294  penicillin-binding protein, putative  29.53 
 
 
434 aa  109  6e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.272122  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0555  penicillin-binding protein, putative  28.52 
 
 
413 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.389605  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4818  putative penicillin-binding protein  28.91 
 
 
416 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.618322  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  33.46 
 
 
442 aa  109  8.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6092  beta-lactamase  29.75 
 
 
419 aa  108  9.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.152854 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2053  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  30.25 
 
 
385 aa  108  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00880281  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2296  alkaline D-peptidase  30.25 
 
 
385 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000100431 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3030  alkaline D-peptidase  29.86 
 
 
388 aa  108  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2051  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  30.25 
 
 
385 aa  107  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.319079  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0116  beta-lactamase  31.58 
 
 
453 aa  108  2e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2638  beta-lactamase  37.31 
 
 
445 aa  108  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0618  beta-lactamase  30.31 
 
 
450 aa  107  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2093  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  30.43 
 
 
407 aa  107  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2381  alkaline D-peptidase  30.25 
 
 
385 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0825231  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2860  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  30.43 
 
 
385 aa  107  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28769  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3206  beta-lactamase  29.3 
 
 
389 aa  107  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2824  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.86 
 
 
388 aa  107  4e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.130693  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6205  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  33.92 
 
 
378 aa  107  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2478  alkaline D-peptidase  29.2 
 
 
388 aa  106  6e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.431844  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2661  alkaline d-peptidase  29.2 
 
 
388 aa  106  6e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4213  beta-lactamase  27.55 
 
 
403 aa  106  6e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.161495  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2440  alkaline D-peptidase (D-stereospecific peptide hydrolase)  29.2 
 
 
388 aa  106  7e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00540718  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2217  alkaline D-peptidase  28.99 
 
 
388 aa  105  7e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  3.66047e-16 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2677  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  29.2 
 
 
388 aa  106  7e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000522854 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1832  beta-lactamase  27.69 
 
 
446 aa  105  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.29245  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2409  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  29.2 
 
 
388 aa  105  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.37701  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2259  beta-lactamase  31.31 
 
 
416 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.296569  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5013  alkaline D-peptidase  30.69 
 
 
374 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394865  normal  0.0638413 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3175  beta-lactamase  29.71 
 
 
375 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.702373  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2755  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  29.5 
 
 
388 aa  103  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0494186  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  28.2 
 
 
559 aa  104  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3069  alkaline D-peptidase  32.11 
 
 
388 aa  103  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0417304  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5107  beta-lactamase  28.48 
 
 
338 aa  103  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.434559  normal  0.256673 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4346  Beta-lactamase  32.96 
 
 
547 aa  103  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2576  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  29.75 
 
 
389 aa  103  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.145811 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1094  beta-lactamase  33.2 
 
 
349 aa  103  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2769  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  32.11 
 
 
389 aa  103  5e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.48212  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1936  beta-lactamase  29.41 
 
 
848 aa  103  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.178754  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2819  alkaline D-peptidase  32.11 
 
 
388 aa  102  7e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118082  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3033  alkaline d-peptidase  32.11 
 
 
388 aa  102  7e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.400662  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0831  beta-lactamase  29.71 
 
 
422 aa  102  8e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146809  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3027  alkaline D-peptidase  32.11 
 
 
388 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1018  beta-lactamase  34.16 
 
 
461 aa  102  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.624623 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  31.88 
 
 
477 aa  102  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3018  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.07 
 
 
389 aa  102  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.470862  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3064  alkaline D-peptidase  32.11 
 
 
388 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0312865  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15810  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  35.22 
 
 
488 aa  101  2e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.091319  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01828  beta-lactamase precursor  32.92 
 
 
366 aa  101  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.284204  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1457  beta-lactamase  28.68 
 
 
325 aa  101  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.17461  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  27.59 
 
 
505 aa  100  3e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3512  beta-lactamase  28.05 
 
 
364 aa  100  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0973  beta-lactamase  26.81 
 
 
514 aa  100  4e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2991  beta-lactamase  33.55 
 
 
475 aa  100  4e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1906  beta-lactamase  27.16 
 
 
369 aa  99.8  7e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3339  beta-lactamase  32.65 
 
 
381 aa  99  9e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2736  beta-lactamase  27.38 
 
 
417 aa  99  9e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.416885  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0939  beta-lactamase  32 
 
 
338 aa  98.6  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.18746 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5169  beta-lactamase  34.96 
 
 
382 aa  99  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1031  beta-lactamase  29.18 
 
 
358 aa  98.2  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1072  Beta-lactamase  31.25 
 
 
412 aa  97.8  2e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0863  beta-lactamase  30.96 
 
 
363 aa  97.8  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1923  beta-lactamase  33.78 
 
 
389 aa  97.8  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4155  beta-lactamase  31.27 
 
 
378 aa  98.6  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222212  normal  0.15208 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1013  beta-lactamase  33.88 
 
 
367 aa  98.2  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0860  beta-lactamase  33.23 
 
 
457 aa  97.8  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.164383  normal  0.834143 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1969  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  33.2 
 
 
414 aa  97.1  4e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.980127  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0428  beta-lactamase  27.05 
 
 
404 aa  96.7  4e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.354595  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>