More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_37770 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_37770  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  100 
 
 		 366 aa  738    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.269534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0502  beta-lactamase  40.06 
 
 		 358 aa  212  7.999999999999999e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2394  penicillin-binding protein  33.43 
 
 		 340 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.70958  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2469  penicillin-binding protein  32.74 
 
 		 340 aa  199  5e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.242822  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2650  penicillin-binding protein  32.74 
 
 		 340 aa  199  5e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2433  penicillin-binding protein  32.84 
 
 		 340 aa  199  6e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0197006  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2668  penicillin-binding protein  32.84 
 
 		 348 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162016 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2721  penicillin-binding protein  32.54 
 
 		 340 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0897232  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2632  penicillin-binding protein  32.73 
 
 		 341 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.149759  decreased coverage  0.000000240236 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2679  penicillin-binding protein  32.42 
 
 		 341 aa  193  3e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1777  beta-lactamase  33.33 
 
 		 343 aa  191  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00484911  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2881  beta-lactamase  29.86 
 
 		 338 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.74645  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1551  beta-lactamase  36.59 
 
 		 333 aa  167  2e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.345066  normal  0.407276 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4043  beta-lactamase  34.13 
 
 		 361 aa  157  3e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2573  beta-lactamase  32.42 
 
 		 476 aa  144  3e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.369136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  31.75 
 
 		 392 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  25.83 
 
 		 487 aa  122  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5150  beta-lactamase  30 
 
 		 369 aa  120  3.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.654906 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0151  beta-lactamase  27.35 
 
 		 394 aa  118  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.288429 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6092  beta-lactamase  32.71 
 
 		 419 aa  116  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.152854 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  26.47 
 
 		 578 aa  115  8.999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0863  beta-lactamase  31.4 
 
 		 363 aa  114  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2259  beta-lactamase  33.68 
 
 		 416 aa  106  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.296569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3615  beta-lactamase  30.51 
 
 		 611 aa  105  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0663146 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3731  beta-lactamase  36.41 
 
 		 603 aa  104  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.227339 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1906  beta-lactamase  28.46 
 
 		 369 aa  104  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2638  beta-lactamase  29.06 
 
 		 445 aa  105  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0831  beta-lactamase  26.72 
 
 		 422 aa  103  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3422  beta-lactamase  34.8 
 
 		 593 aa  104  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.126074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4636  beta-lactamase  26.96 
 
 		 496 aa  103  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2793  beta-lactamase  29.25 
 
 		 510 aa  102  9e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.879811  normal  0.340954 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2294  penicillin-binding protein, putative  27.04 
 
 		 434 aa  102  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.272122  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.06 
 
 		 442 aa  102  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1018  beta-lactamase  29.01 
 
 		 461 aa  102  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.624623 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3512  beta-lactamase  30 
 
 		 364 aa  100  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3018  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.37 
 
 		 389 aa  100  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.470862  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1832  beta-lactamase  25.15 
 
 		 446 aa  100  6e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.29245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0419  beta-lactamase  25.68 
 
 		 416 aa  99.8  6e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2217  alkaline D-peptidase  30.18 
 
 		 388 aa  99.8  6e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.66047e-16 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4689  beta-lactamase  34.07 
 
 		 374 aa  99.4  8e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0791767  normal  0.116144 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3206  beta-lactamase  29.96 
 
 		 389 aa  99  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0505  putative penicillin-binding protein  24.36 
 
 		 415 aa  99  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0859162  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3069  alkaline D-peptidase  29.17 
 
 		 388 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0417304  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2053  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  28.14 
 
 		 385 aa  97.8  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00880281  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3751  beta-lactamase  26.35 
 
 		 395 aa  98.2  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000498352 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2051  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  28.44 
 
 		 385 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.319079  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3030  alkaline D-peptidase  29.82 
 
 		 388 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4697  beta-lactamase  23.89 
 
 		 345 aa  98.6  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.168974  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3175  beta-lactamase  27.84 
 
 		 375 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.702373  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0483  putative penicillin-binding protein  25.68 
 
 		 412 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0473  penicillin-binding protein  25.09 
 
 		 421 aa  97.8  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2896  alkaline D-peptidase  32.76 
 
 		 383 aa  97.8  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.243898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0558  putative penicillin-binding protein  25 
 
 		 413 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.622752  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0468  beta-lactamase  28.69 
 
 		 455 aa  97.4  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000926021 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0502  penicillin-binding protein  25.09 
 
 		 412 aa  97.8  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2093  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  28.9 
 
 		 407 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0416  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  25.09 
 
 		 421 aa  97.1  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0430511  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2755  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  28.82 
 
 		 388 aa  97.4  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0494186  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4818  putative penicillin-binding protein  24.36 
 
 		 416 aa  97.1  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.618322  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2080  beta-lactamase  28 
 
 		 370 aa  96.7  5e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.16247  normal  0.44675 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2296  alkaline D-peptidase  28.44 
 
 		 385 aa  97.1  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000100431 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3147  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  28.24 
 
 		 407 aa  96.7  6e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.943509  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3080  beta-lactamase  30.25 
 
 		 440 aa  96.7  6e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3064  alkaline D-peptidase  29.17 
 
 		 388 aa  96.3  7e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0312865  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2860  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  28.9 
 
 		 385 aa  95.9  9e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28769  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0555  penicillin-binding protein, putative  25 
 
 		 413 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.389605  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0412  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  24.63 
 
 		 422 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2409  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  27.51 
 
 		 388 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.37701  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2824  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27.14 
 
 		 388 aa  95.9  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.130693  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2381  alkaline D-peptidase  28.3 
 
 		 385 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0825231  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2231  beta-lactamase  27.94 
 
 		 384 aa  94.7  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3534  amino acid adenylation  26.32 
 
 		 2457 aa  95.1  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2736  beta-lactamase  30.86 
 
 		 417 aa  95.1  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.416885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1839  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  32.79 
 
 		 681 aa  94.7  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000051234  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  30.6 
 
 		 356 aa  95.1  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  24.86 
 
 		 446 aa  94  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2478  alkaline D-peptidase  27.22 
 
 		 388 aa  93.6  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.431844  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2661  alkaline d-peptidase  27.22 
 
 		 388 aa  93.6  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1969  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  32.18 
 
 		 414 aa  94  4e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.980127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0099  D-stereospecific peptide hydrolase  27.47 
 
 		 443 aa  93.6  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000129924  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2576  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  28.94 
 
 		 389 aa  93.6  5e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.145811 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3027  alkaline D-peptidase  28.12 
 
 		 388 aa  93.2  6e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4280  beta-lactamase  30.89 
 
 		 330 aa  93.2  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3175  beta-lactamase  27.76 
 
 		 351 aa  92.8  8e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0119788  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0294  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  27.97 
 
 		 834 aa  92.8  9e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00108534  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0335  hypothetical protein  28.63 
 
 		 533 aa  92.8  9e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0343  beta-lactamase  28.53 
 
 		 482 aa  92.4  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2440  alkaline D-peptidase (D-stereospecific peptide hydrolase)  27.22 
 
 		 388 aa  92.4  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00540718  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2677  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  27.22 
 
 		 388 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000522854 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1134  beta-lactamase  36.87 
 
 		 459 aa  92.4  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  26.29 
 
 		 595 aa  92.4  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  25.42 
 
 		 601 aa  92  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3830  beta-lactamase  29.18 
 
 		 658 aa  92.4  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223137  normal  0.372687 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4257  beta-lactamase  28.94 
 
 		 464 aa  91.7  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6206  beta-lactamase  27.61 
 
 		 321 aa  91.7  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.324563 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0727  alkaline D-peptidase  30.74 
 
 		 429 aa  91.7  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2650  beta-lactamase  29.68 
 
 		 497 aa  91.7  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0361544  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0772  beta-lactamase  27.38 
 
 		 431 aa  91.7  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0939  beta-lactamase  31.09 
 
 		 338 aa  90.9  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.18746 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0428  beta-lactamase  23.85 
 
 		 404 aa  90.5  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.354595  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>