More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0772 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0772  beta-lactamase  100 
 
 		 431 aa  887    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4257  beta-lactamase  39.82 
 
 		 464 aa  283  3.0000000000000004e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1018  beta-lactamase  42.22 
 
 		 461 aa  278  1e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.624623 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5715  beta-lactamase  38.8 
 
 		 437 aa  253  6e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5714  beta-lactamase  37.3 
 
 		 446 aa  252  8.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0468  beta-lactamase  37.84 
 
 		 455 aa  252  1e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000926021 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5618  beta-lactamase  41.08 
 
 		 456 aa  244  1.9999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357665  normal  0.013094 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3177  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  40.56 
 
 		 484 aa  237  4e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.075148  normal  0.866618 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6467  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  33.64 
 
 		 551 aa  224  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.341842  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6025  beta-lactamase  37.2 
 
 		 460 aa  221  1.9999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.565651 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4688  beta-lactamase  34.93 
 
 		 462 aa  214  2.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.331113  normal  0.125502 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11747  penicillin-binding protein  35.04 
 
 		 539 aa  192  7e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.47398 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0683  Beta-lactamase  32.23 
 
 		 530 aa  152  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.564885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1710  beta-lactamase  32.25 
 
 		 463 aa  135  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.903063 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2036  putative penicillin-binding protein  29.92 
 
 		 691 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4308  beta-lactamase  30.17 
 
 		 459 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0244726  normal  0.721784 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3223  putative penicillin-binding protein  29.41 
 
 		 691 aa  127  5e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2989  penicillin-binding protein  29.62 
 
 		 691 aa  124  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3214  penicillin-binding protein  29.62 
 
 		 691 aa  124  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38843  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5327  beta-lactamase  30.37 
 
 		 440 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.620258 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2916  penicillin-binding protein  29.11 
 
 		 691 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0098  beta-lactamase  30.11 
 
 		 691 aa  117  5e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3205  putative penicillin-binding protein  30.03 
 
 		 694 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1788  beta-lactamase  30.45 
 
 		 560 aa  113  7.000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.358741  normal  0.761746 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1955  beta-lactamase  27.88 
 
 		 694 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.1377  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3742  beta-lactamase  29.38 
 
 		 478 aa  111  3e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.877046  normal  0.0540026 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3017  beta-lactamase  29.84 
 
 		 694 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151965  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  28.49 
 
 		 595 aa  108  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1818  beta-lactamase  29.54 
 
 		 513 aa  107  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2539  beta-lactamase  29.87 
 
 		 567 aa  106  9e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.470437  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  27.35 
 
 		 601 aa  105  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1839  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  28.53 
 
 		 681 aa  106  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000051234  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0335  hypothetical protein  28.35 
 
 		 533 aa  105  1e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3500  beta-lactamase  26.6 
 
 		 600 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.623073  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1946  Beta-lactamase  28.19 
 
 		 588 aa  105  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1514  beta-lactamase  25.51 
 
 		 620 aa  104  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00027695  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3018  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.92 
 
 		 389 aa  103  5e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.470862  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2650  beta-lactamase  31.81 
 
 		 497 aa  102  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0361544  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41280  putative beta-lactamase  26.53 
 
 		 610 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.607486 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9203  beta-lactamase  28.26 
 
 		 635 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.606578 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2991  beta-lactamase  26.46 
 
 		 475 aa  100  5e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2632  beta-lactamase  31.02 
 
 		 503 aa  100  5e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.119708  hitchhiker  0.000636173 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  34.25 
 
 		 487 aa  100  6e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1171  beta-lactamase  24.55 
 
 		 455 aa  99.8  8e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2819  alkaline D-peptidase  37.18 
 
 		 388 aa  99  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118082  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8721  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  30.41 
 
 		 480 aa  99  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2769  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  37.18 
 
 		 389 aa  99  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.48212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3033  alkaline d-peptidase  37.18 
 
 		 388 aa  99  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.400662  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3030  alkaline D-peptidase  30.28 
 
 		 388 aa  99  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0294  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  26.72 
 
 		 834 aa  98.2  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00108534  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3027  alkaline D-peptidase  37.18 
 
 		 388 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4159  beta-lactamase  27.6 
 
 		 544 aa  97.8  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0453527  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3069  alkaline D-peptidase  37.01 
 
 		 388 aa  97.4  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0417304  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2217  alkaline D-peptidase  29.93 
 
 		 388 aa  97.4  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.66047e-16 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3615  beta-lactamase  39.07 
 
 		 611 aa  97.1  5e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0663146 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5338  beta-lactamase  30.66 
 
 		 525 aa  97.1  5e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.271651  normal  0.211898 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3064  alkaline D-peptidase  36.54 
 
 		 388 aa  97.1  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0312865  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3206  beta-lactamase  28.67 
 
 		 389 aa  97.4  5e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3147  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  29.46 
 
 		 407 aa  97.1  6e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.943509  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35970  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  37.97 
 
 		 582 aa  96.7  8e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796833  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2813  beta-lactamase  30.61 
 
 		 499 aa  96.3  9e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  33.33 
 
 		 578 aa  96.3  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2755  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  36.36 
 
 		 388 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0494186  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2896  alkaline D-peptidase  27.88 
 
 		 383 aa  95.5  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.243898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3731  beta-lactamase  38.41 
 
 		 603 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.227339 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0291  beta-lactamase class C domain-containing protein  27.14 
 
 		 519 aa  95.1  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000012653  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4308  beta-lactamase  28.57 
 
 		 650 aa  95.1  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.805936  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5348  beta-lactamase  30.94 
 
 		 414 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.635001  normal  0.0848814 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0822  6Fe-6S prismane cluster-containing protein-like protein  26.88 
 
 		 455 aa  95.5  2e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2860  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  29.46 
 
 		 385 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28769  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2093  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  29.02 
 
 		 407 aa  94.4  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3144  beta-lactamase  31.45 
 
 		 590 aa  94.4  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1055  beta-lactamase  29.28 
 
 		 547 aa  94  5e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2576  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  27.53 
 
 		 389 aa  93.6  6e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.145811 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3032  beta-lactamase  30.68 
 
 		 507 aa  93.6  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.436003 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3422  beta-lactamase  37.09 
 
 		 593 aa  93.6  7e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.126074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2381  alkaline D-peptidase  28.89 
 
 		 385 aa  93.2  7e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0825231  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2389  cyclic peptide transporter  25.24 
 
 		 1032 aa  93.2  8e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3830  beta-lactamase  26.44 
 
 		 658 aa  93.2  8e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223137  normal  0.372687 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4043  beta-lactamase  35.23 
 
 		 361 aa  93.2  8e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0471  beta-lactamase  26.88 
 
 		 616 aa  92.8  9e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0456  beta-lactamase  32.85 
 
 		 395 aa  92.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2996  beta-lactamase  34.91 
 
 		 479 aa  92.4  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.168493 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0570  alkaline D-peptidase  34.55 
 
 		 370 aa  92.4  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0467  beta-lactamase  25.23 
 
 		 637 aa  92.8  1e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2053  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  28.57 
 
 		 385 aa  91.7  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00880281  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2051  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  28.57 
 
 		 385 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.319079  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2409  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  33.33 
 
 		 388 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.37701  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37770  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  27.38 
 
 		 366 aa  91.7  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.269534  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1790  beta-lactamase  26.47 
 
 		 483 aa  92.4  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0797219 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2296  alkaline D-peptidase  28.57 
 
 		 385 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000100431 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2824  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  35.71 
 
 		 388 aa  91.7  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.130693  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3247  beta-lactamase  26.11 
 
 		 513 aa  92  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1460  beta-lactamase  25.33 
 
 		 523 aa  92  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0171679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1798  beta-lactamase  28.26 
 
 		 426 aa  91.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.491739  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1311  beta-lactamase  25.14 
 
 		 669 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5895  beta-lactamase  37.13 
 
 		 496 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3175  beta-lactamase  32.5 
 
 		 375 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.702373  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2104  beta-lactamase  31.88 
 
 		 396 aa  91.3  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1762  beta-lactamase  28.46 
 
 		 431 aa  90.1  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178293  normal  0.700473 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>