More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2638 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  78.75 
 
 		 442 aa  637    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2638  beta-lactamase  100 
 
 		 445 aa  901    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  47.09 
 
 		 392 aa  344  2e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  38.99 
 
 		 487 aa  241  2e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  41.61 
 
 		 578 aa  233  4.0000000000000004e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2294  penicillin-binding protein, putative  37.38 
 
 		 434 aa  223  7e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.272122  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  34.77 
 
 		 446 aa  216  5e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0343  beta-lactamase  35.31 
 
 		 482 aa  208  1e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  36.09 
 
 		 477 aa  204  3e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3422  beta-lactamase  39.05 
 
 		 593 aa  196  6e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.126074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  40.06 
 
 		 356 aa  196  8.000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3731  beta-lactamase  38.41 
 
 		 603 aa  196  1e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.227339 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3615  beta-lactamase  38.39 
 
 		 611 aa  192  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0663146 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0939  beta-lactamase  38.32 
 
 		 338 aa  189  1e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.18746 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1906  beta-lactamase  35.2 
 
 		 369 aa  181  2e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2736  beta-lactamase  31.35 
 
 		 417 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.416885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1832  beta-lactamase  30.7 
 
 		 446 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.29245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4280  beta-lactamase  36.9 
 
 		 330 aa  172  7.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5985  beta-lactamase  31.15 
 
 		 342 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3751  beta-lactamase  31.78 
 
 		 395 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000498352 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1936  beta-lactamase  34.37 
 
 		 848 aa  165  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.178754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3512  beta-lactamase  35.29 
 
 		 364 aa  165  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1520  Beta-lactamase  35.58 
 
 		 537 aa  164  3e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000638983  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0473  penicillin-binding protein  32.01 
 
 		 421 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0502  penicillin-binding protein  32.01 
 
 		 412 aa  162  9e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0416  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  32.37 
 
 		 421 aa  162  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0430511  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0483  putative penicillin-binding protein  32.37 
 
 		 412 aa  162  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0419  beta-lactamase  30.21 
 
 		 416 aa  160  5e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0505  putative penicillin-binding protein  31.29 
 
 		 415 aa  160  5e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0859162  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1457  beta-lactamase  34.93 
 
 		 325 aa  159  9e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.17461  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  34.67 
 
 		 377 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0412  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  32.14 
 
 		 422 aa  159  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4818  putative penicillin-binding protein  31.58 
 
 		 416 aa  159  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.618322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2717  beta-lactamase  32.68 
 
 		 470 aa  156  8e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  35.08 
 
 		 362 aa  155  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0558  putative penicillin-binding protein  31.79 
 
 		 413 aa  155  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.622752  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0555  penicillin-binding protein, putative  32.14 
 
 		 413 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.389605  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0428  beta-lactamase  26.85 
 
 		 404 aa  153  5e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.354595  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2968  beta-lactamase  31.08 
 
 		 462 aa  150  3e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  30.68 
 
 		 559 aa  149  7e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2177  beta-lactamase  31.25 
 
 		 543 aa  148  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.816506 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3688  beta-lactamase  31.25 
 
 		 543 aa  148  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497517  normal  0.011807 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2357  beta-lactamase  29.28 
 
 		 381 aa  147  3e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6206  beta-lactamase  35.37 
 
 		 321 aa  146  7.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.324563 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2573  beta-lactamase  34.36 
 
 		 476 aa  145  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.369136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4152  beta-lactamase  30.58 
 
 		 378 aa  144  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0848463  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3175  beta-lactamase  32.42 
 
 		 351 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0119788  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4110  beta-lactamase  30.91 
 
 		 379 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1086  beta-lactamase  29.41 
 
 		 378 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6092  beta-lactamase  32.61 
 
 		 419 aa  141  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.152854 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4174  beta-lactamase  30.91 
 
 		 378 aa  141  3e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000652338  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5443  putative beta-lactamase  32.24 
 
 		 364 aa  140  6e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.65256  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0863  beta-lactamase  32.78 
 
 		 363 aa  138  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3872  beta-lactamase  30.25 
 
 		 375 aa  138  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0831  beta-lactamase  28.65 
 
 		 422 aa  137  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2587  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  33.44 
 
 		 413 aa  137  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.607083  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0151  beta-lactamase  36.7 
 
 		 394 aa  136  7.000000000000001e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.288429 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2793  beta-lactamase  31.79 
 
 		 510 aa  136  9e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.879811  normal  0.340954 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2080  beta-lactamase  33 
 
 		 370 aa  135  9.999999999999999e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.16247  normal  0.44675 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4213  beta-lactamase  32.12 
 
 		 403 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.161495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2198  beta-lactamase  31.12 
 
 		 543 aa  134  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.176904  normal  0.0317754 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1777  beta-lactamase  31.93 
 
 		 343 aa  133  6e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00484911  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2394  penicillin-binding protein  30.48 
 
 		 340 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.70958  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2469  penicillin-binding protein  30.48 
 
 		 340 aa  132  9e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.242822  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2650  penicillin-binding protein  30.48 
 
 		 340 aa  132  9e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2433  penicillin-binding protein  30.79 
 
 		 340 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0197006  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0999  beta-lactamase  29.73 
 
 		 367 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0117018 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2668  penicillin-binding protein  30.79 
 
 		 348 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162016 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5150  beta-lactamase  30.19 
 
 		 369 aa  130  5.0000000000000004e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.654906 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2742  beta-lactamase  29.73 
 
 		 376 aa  130  6e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0750006  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2679  penicillin-binding protein  30.7 
 
 		 341 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2632  penicillin-binding protein  29.48 
 
 		 341 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.149759  decreased coverage  0.000000240236 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2415  beta-lactamase  29.12 
 
 		 442 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0834226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3210  beta-lactamase  31.29 
 
 		 375 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.767379  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13238  penicillin-binding protein, putative  32.59 
 
 		 431 aa  128  2.0000000000000002e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.652866  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0618  beta-lactamase  29.93 
 
 		 450 aa  127  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4546  beta-lactamase  29.1 
 
 		 740 aa  128  3e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2721  penicillin-binding protein  29.52 
 
 		 340 aa  127  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0897232  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4636  beta-lactamase  29.7 
 
 		 496 aa  127  5e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4043  beta-lactamase  32.5 
 
 		 361 aa  127  6e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3498  beta-lactamase  30.49 
 
 		 375 aa  127  6e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4919  beta-lactamase  32.05 
 
 		 415 aa  126  8.000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.318437  normal  0.850487 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5169  beta-lactamase  33.8 
 
 		 382 aa  125  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3264  beta-lactamase  29.97 
 
 		 377 aa  125  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.664291  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3208  beta-lactamase  31.01 
 
 		 377 aa  126  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0230735  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3027  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  33.22 
 
 		 406 aa  126  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.899556  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3175  beta-lactamase  32.46 
 
 		 375 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.702373  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3294  penicillin-binding protein  30.3 
 
 		 377 aa  124  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.678008  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3511  putative penicillin-binding protein  30.3 
 
 		 377 aa  124  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3554  penicillin-binding protein  30.3 
 
 		 377 aa  124  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2768  beta-lactamase  28.27 
 
 		 483 aa  124  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5119  beta-lactamase  27.73 
 
 		 402 aa  123  5e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4788  beta-lactamase  27.75 
 
 		 400 aa  123  6e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.416977  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2381  alkaline D-peptidase  32.12 
 
 		 385 aa  123  7e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0825231  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2053  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  32.12 
 
 		 385 aa  123  7e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00880281  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1119  hypothetical protein  30.5 
 
 		 371 aa  123  7e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1357  beta-lactamase  28.8 
 
 		 378 aa  123  7e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2296  alkaline D-peptidase  32.12 
 
 		 385 aa  123  8e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000100431 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1123  hypothetical protein  30.19 
 
 		 371 aa  123  8e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0099  D-stereospecific peptide hydrolase  34.19 
 
 		 443 aa  123  8e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000129924  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>