More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2881 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2881  beta-lactamase  100 
 
 
338 aa  705    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.74645  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2469  penicillin-binding protein  41.82 
 
 
340 aa  268  1e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.242822  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2650  penicillin-binding protein  41.82 
 
 
340 aa  268  1e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2394  penicillin-binding protein  41.51 
 
 
340 aa  266  4e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.70958  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2668  penicillin-binding protein  41.82 
 
 
348 aa  265  5.999999999999999e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162016 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2433  penicillin-binding protein  41.82 
 
 
340 aa  265  5.999999999999999e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0197006  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2632  penicillin-binding protein  39.52 
 
 
341 aa  265  1e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.149759  decreased coverage  0.000000240236 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2679  penicillin-binding protein  39.51 
 
 
341 aa  263  2e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2721  penicillin-binding protein  40.43 
 
 
340 aa  261  8.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0897232  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1777  beta-lactamase  39.44 
 
 
343 aa  222  7e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00484911  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1551  beta-lactamase  32.43 
 
 
333 aa  188  1e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.345066  normal  0.407276 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37770  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  29.86 
 
 
366 aa  175  9.999999999999999e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.269534  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0502  beta-lactamase  32.45 
 
 
358 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4043  beta-lactamase  33.88 
 
 
361 aa  143  4e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2573  beta-lactamase  30.22 
 
 
476 aa  134  3e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.369136  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.91 
 
 
392 aa  129  7.000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1906  beta-lactamase  28.67 
 
 
369 aa  126  5e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  31.39 
 
 
578 aa  123  6e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0151  beta-lactamase  28.85 
 
 
394 aa  122  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.288429 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3208  beta-lactamase  27.43 
 
 
377 aa  120  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0230735  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3511  putative penicillin-binding protein  27.43 
 
 
377 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3294  penicillin-binding protein  27.43 
 
 
377 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.678008  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3264  beta-lactamase  27.43 
 
 
377 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.664291  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3554  penicillin-binding protein  27.43 
 
 
377 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2294  penicillin-binding protein, putative  26.3 
 
 
434 aa  119  6e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.272122  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3210  beta-lactamase  27.08 
 
 
375 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.767379  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  33.21 
 
 
446 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  28.61 
 
 
487 aa  117  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3507  penicillin-binding protein, putative  27.78 
 
 
375 aa  117  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3518  putative penicillin-binding protein  27.78 
 
 
377 aa  116  6e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0831  beta-lactamase  26.7 
 
 
422 aa  116  6e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146809  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3498  beta-lactamase  26.04 
 
 
375 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.86 
 
 
442 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2742  beta-lactamase  28.14 
 
 
376 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0750006  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1750  beta-lactamase  26.04 
 
 
375 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.339251  normal  0.99151 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4818  putative penicillin-binding protein  26.45 
 
 
416 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.618322  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0473  penicillin-binding protein  26.45 
 
 
421 aa  113  5e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0412  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  26.45 
 
 
422 aa  113  5e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0502  penicillin-binding protein  26.45 
 
 
412 aa  113  5e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0419  beta-lactamase  26.45 
 
 
416 aa  113  5e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0483  putative penicillin-binding protein  26.45 
 
 
412 aa  113  6e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01828  beta-lactamase precursor  29.46 
 
 
366 aa  113  6e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.284204  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0416  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  26.45 
 
 
421 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0430511  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0159  beta-lactamase  27.9 
 
 
410 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3872  beta-lactamase  27.8 
 
 
375 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0505  putative penicillin-binding protein  26.45 
 
 
415 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0859162  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2259  beta-lactamase  30.08 
 
 
416 aa  111  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.296569  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2638  beta-lactamase  30.04 
 
 
445 aa  110  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0558  putative penicillin-binding protein  26.16 
 
 
413 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.622752  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0555  penicillin-binding protein, putative  26.16 
 
 
413 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.389605  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4919  beta-lactamase  29.61 
 
 
415 aa  108  9.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.318437  normal  0.850487 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1086  beta-lactamase  28.08 
 
 
378 aa  108  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10400  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  30.6 
 
 
421 aa  107  2e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.15445  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0428  beta-lactamase  26.51 
 
 
404 aa  108  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.354595  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2793  beta-lactamase  28.47 
 
 
510 aa  107  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.879811  normal  0.340954 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4174  beta-lactamase  26.92 
 
 
378 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000652338  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4110  beta-lactamase  26.92 
 
 
379 aa  107  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3422  beta-lactamase  31.25 
 
 
593 aa  107  4e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.126074  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3731  beta-lactamase  30.73 
 
 
603 aa  106  4e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.227339 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  29.47 
 
 
362 aa  107  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4152  beta-lactamase  27.03 
 
 
378 aa  106  6e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0848463  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1357  beta-lactamase  27.72 
 
 
378 aa  105  8e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  24.92 
 
 
356 aa  105  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3615  beta-lactamase  29.69 
 
 
611 aa  103  6e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0663146 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3512  beta-lactamase  26.09 
 
 
364 aa  102  8e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5443  putative beta-lactamase  30.19 
 
 
364 aa  102  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.65256  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1936  beta-lactamase  29.6 
 
 
848 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.178754  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1031  beta-lactamase  30.61 
 
 
358 aa  102  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0759  putative beta-lactamase class C penicillin binding protein  27 
 
 
498 aa  101  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445171  normal  0.118882 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2778  beta-lactamase  29.1 
 
 
380 aa  100  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.701087  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3511  beta-lactamase  28.14 
 
 
364 aa  100  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.700919  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4213  beta-lactamase  27.73 
 
 
403 aa  99.8  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.161495  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5150  beta-lactamase  28.85 
 
 
369 aa  99.8  7e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.654906 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4280  beta-lactamase  30.27 
 
 
330 aa  99  9e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3751  beta-lactamase  29.17 
 
 
395 aa  99  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000498352 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13238  penicillin-binding protein, putative  25.4 
 
 
431 aa  98.6  1e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.652866  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1832  beta-lactamase  26.69 
 
 
446 aa  99  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.29245  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  28.78 
 
 
477 aa  99  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6092  beta-lactamase  27.64 
 
 
419 aa  98.2  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.152854 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0618  beta-lactamase  27.54 
 
 
450 aa  97.8  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2736  beta-lactamase  26.69 
 
 
417 aa  97.4  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.416885  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2415  beta-lactamase  27.63 
 
 
442 aa  97.4  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0834226  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1123  hypothetical protein  27.36 
 
 
371 aa  96.7  5e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2659  beta-lactamase  29.83 
 
 
662 aa  96.3  6e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3817  beta-lactamase  25.6 
 
 
364 aa  95.9  8e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1457  beta-lactamase  26.54 
 
 
325 aa  95.5  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.17461  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3064  alkaline D-peptidase  27.42 
 
 
388 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0312865  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1119  hypothetical protein  26.75 
 
 
371 aa  94.7  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  25.86 
 
 
595 aa  94.7  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1116  beta-lactamase  26.75 
 
 
397 aa  94.7  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.360266  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1139  beta-lactamase  26.75 
 
 
397 aa  94.7  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  27.13 
 
 
559 aa  94  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2819  alkaline D-peptidase  27.65 
 
 
388 aa  93.6  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118082  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2769  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  27.65 
 
 
389 aa  94  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.48212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3033  alkaline d-peptidase  27.65 
 
 
388 aa  93.6  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.400662  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3027  alkaline D-peptidase  27.65 
 
 
388 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0343  beta-lactamase  26.89 
 
 
482 aa  92.8  7e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2755  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  27.65 
 
 
388 aa  92.4  9e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0494186  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3069  alkaline D-peptidase  27.65 
 
 
388 aa  92  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0417304  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3339  beta-lactamase  27.27 
 
 
381 aa  92  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>