More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_1139 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_1139  beta-lactamase  100 
 
 
397 aa  802    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1116  beta-lactamase  100 
 
 
397 aa  802    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.360266  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0641  fmt protein  57.39 
 
 
400 aa  464  1e-129  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.0000831967  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0412  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  30.91 
 
 
422 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2742  beta-lactamase  31.7 
 
 
376 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0750006  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0473  penicillin-binding protein  30.6 
 
 
421 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0416  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  30.6 
 
 
421 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0430511  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0502  penicillin-binding protein  30.6 
 
 
412 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0483  putative penicillin-binding protein  30.6 
 
 
412 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0558  putative penicillin-binding protein  30.28 
 
 
413 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.622752  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0419  beta-lactamase  31.03 
 
 
416 aa  124  3e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4818  putative penicillin-binding protein  30.72 
 
 
416 aa  123  6e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.618322  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3210  beta-lactamase  28.24 
 
 
375 aa  122  8e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.767379  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3294  penicillin-binding protein  30.7 
 
 
377 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.678008  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3264  beta-lactamase  29.94 
 
 
377 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.664291  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3511  putative penicillin-binding protein  30.7 
 
 
377 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3554  penicillin-binding protein  30.7 
 
 
377 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0505  putative penicillin-binding protein  30.72 
 
 
415 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0859162  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3498  beta-lactamase  30.48 
 
 
375 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0555  penicillin-binding protein, putative  29.65 
 
 
413 aa  121  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.389605  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0428  beta-lactamase  29.61 
 
 
404 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.354595  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3208  beta-lactamase  31.11 
 
 
377 aa  120  6e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0230735  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1750  beta-lactamase  30.16 
 
 
375 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.339251  normal  0.99151 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4152  beta-lactamase  30.19 
 
 
378 aa  117  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0848463  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3872  beta-lactamase  32.21 
 
 
375 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1086  beta-lactamase  31.2 
 
 
378 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4174  beta-lactamase  30.53 
 
 
378 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000652338  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4110  beta-lactamase  30.53 
 
 
379 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3518  putative penicillin-binding protein  29.64 
 
 
377 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3507  penicillin-binding protein, putative  29.52 
 
 
375 aa  114  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  29.21 
 
 
446 aa  113  5e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  29.75 
 
 
487 aa  112  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27.65 
 
 
392 aa  101  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2468  beta-lactamase  31.03 
 
 
498 aa  99.4  9e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00176956  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2516  beta-lactamase  31.03 
 
 
498 aa  99.4  9e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000422279  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0831  beta-lactamase  33.66 
 
 
422 aa  99  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146809  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1814  Beta-lactamase class C related penicillin binding protein  26.6 
 
 
308 aa  99.4  1e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000499701  hitchhiker  0.00000206424 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2294  penicillin-binding protein, putative  26.33 
 
 
434 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.272122  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  28.25 
 
 
578 aa  96.7  7e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2881  beta-lactamase  26.75 
 
 
338 aa  94.7  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.74645  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1832  beta-lactamase  28.01 
 
 
446 aa  94.4  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.29245  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3688  beta-lactamase  28.94 
 
 
543 aa  94  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497517  normal  0.011807 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2177  beta-lactamase  28.94 
 
 
543 aa  94  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.816506 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2921  beta-lactamase class C-like protein  25.69 
 
 
451 aa  93.6  5e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.154271 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1906  beta-lactamase  27.88 
 
 
369 aa  92.4  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  25.54 
 
 
505 aa  92  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0973  beta-lactamase  32.72 
 
 
514 aa  91.7  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  28.05 
 
 
477 aa  91.3  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1457  beta-lactamase  30.33 
 
 
325 aa  90.9  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.17461  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2353  penicillin-binding protein  32.51 
 
 
481 aa  90.9  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000218323  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  26.22 
 
 
559 aa  90.9  4e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2579  penicillin-binding protein, putative  32.11 
 
 
483 aa  90.1  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0220569  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2587  putative penicillin-binding protein  32.84 
 
 
463 aa  90.5  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35213e-17 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01828  beta-lactamase precursor  25.11 
 
 
366 aa  89.7  7e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.284204  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27.31 
 
 
442 aa  89.7  8e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2400  penicillin-binding protein  32.34 
 
 
481 aa  89.7  8e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443561  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2575  penicillin-binding protein  32.34 
 
 
481 aa  89.7  8e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2316  penicillin-binding protein  32.51 
 
 
481 aa  89  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181197  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04833  beta-lactamase  29.22 
 
 
529 aa  88.6  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13238  penicillin-binding protein, putative  29.02 
 
 
431 aa  87.4  4e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.652866  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  24.26 
 
 
377 aa  87.4  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2259  beta-lactamase  27.27 
 
 
416 aa  87.4  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.296569  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2539  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  26.36 
 
 
445 aa  87  5e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2629  putative penicillin-binding protein  33.16 
 
 
490 aa  86.3  8e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0110315  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3615  beta-lactamase  28.34 
 
 
611 aa  86.3  9e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0663146 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  27.11 
 
 
362 aa  85.5  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1134  beta-lactamase  33.33 
 
 
603 aa  86.3  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.260461 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2060  beta-lactamase  28.83 
 
 
485 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.258254  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2018  penicillin-binding protein  27.7 
 
 
485 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2346  hypothetical protein  27.93 
 
 
485 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0051399  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0660  beta-lactamase  26.83 
 
 
395 aa  84.3  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.775643  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4636  beta-lactamase  25.91 
 
 
496 aa  84  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2218  hypothetical protein  27.93 
 
 
485 aa  84  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3422  beta-lactamase  28.34 
 
 
593 aa  83.2  0.000000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.126074  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1740  beta-lactamase  24.9 
 
 
379 aa  83.2  0.000000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1638  beta-lactamase  27.48 
 
 
485 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0331332  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3731  beta-lactamase  28.34 
 
 
603 aa  82.8  0.000000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.227339 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2264  hypothetical protein  27.93 
 
 
485 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.145649  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1520  Beta-lactamase  27.06 
 
 
537 aa  82.4  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000638983  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11747  penicillin-binding protein  26.61 
 
 
539 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.47398 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2638  beta-lactamase  26.78 
 
 
445 aa  81.6  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4043  beta-lactamase  25.28 
 
 
361 aa  81.6  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2262  hypothetical protein  27.48 
 
 
485 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.60427e-26 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2717  beta-lactamase  24.76 
 
 
470 aa  81.3  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1839  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  28.81 
 
 
681 aa  81.3  0.00000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000051234  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3106  hypothetical protein  27.48 
 
 
485 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000134591 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0034  alkaline D-peptidase  26.1 
 
 
392 aa  80.1  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.698522 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1697  beta-lactamase  26.19 
 
 
381 aa  80.1  0.00000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.570462  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2996  beta-lactamase  25 
 
 
479 aa  80.1  0.00000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.168493 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2987  beta-lactamase  27.87 
 
 
526 aa  80.1  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.204407  normal  0.639877 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3032  beta-lactamase  25.53 
 
 
507 aa  80.1  0.00000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.436003 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2573  fmtA-like protein, putative  31.21 
 
 
482 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00911316  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0618  beta-lactamase  29.65 
 
 
450 aa  79  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4788  beta-lactamase  26.38 
 
 
400 aa  79  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.416977  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2198  beta-lactamase  28.44 
 
 
543 aa  79.3  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.176904  normal  0.0317754 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2255  beta-lactamase  27.57 
 
 
379 aa  79.3  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.234898  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2389  cyclic peptide transporter  27.31 
 
 
1032 aa  79  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0759  putative beta-lactamase class C penicillin binding protein  27.68 
 
 
498 aa  79  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445171  normal  0.118882 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0059  beta-lactamase  24.26 
 
 
383 aa  78.2  0.0000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0476107  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0154  beta-lactamase  31.21 
 
 
482 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>