More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2987 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_2987  beta-lactamase  100 
 
 
526 aa  1083    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.204407  normal  0.639877 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0467  beta-lactamase  50 
 
 
520 aa  525  1e-148  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4159  beta-lactamase  43.4 
 
 
544 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0453527  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3247  beta-lactamase  43.65 
 
 
513 aa  429  1e-119  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04833  beta-lactamase  44.38 
 
 
529 aa  427  1e-118  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1234  beta-lactamase  44.25 
 
 
519 aa  409  1e-113  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565811  normal  0.301621 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0154  beta-lactamase  42.94 
 
 
526 aa  406  1.0000000000000001e-112  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1460  beta-lactamase  38.39 
 
 
523 aa  358  1.9999999999999998e-97  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0171679  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2343  beta-lactamase  37.76 
 
 
803 aa  346  6e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.23617 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1055  beta-lactamase  40.5 
 
 
547 aa  328  2.0000000000000001e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427639  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0343  beta-lactamase  34.85 
 
 
517 aa  270  2.9999999999999997e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.6779 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4882  beta-lactamase  36.3 
 
 
497 aa  245  9.999999999999999e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1867  beta-lactamase  31.61 
 
 
517 aa  241  2e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0109165  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2539  beta-lactamase  33.81 
 
 
567 aa  229  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.470437  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1638  beta-lactamase  31.48 
 
 
485 aa  226  6e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0331332  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2060  beta-lactamase  32.78 
 
 
485 aa  224  3e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.258254  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09923  hypothetical protein  29.48 
 
 
591 aa  223  4.9999999999999996e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.916627  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2018  penicillin-binding protein  30 
 
 
485 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.225321  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2262  hypothetical protein  29.78 
 
 
485 aa  221  3e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.60427e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2081  hypothetical protein  30 
 
 
485 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.765888  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2235  hypothetical protein  30 
 
 
485 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.336147  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2264  hypothetical protein  30.27 
 
 
485 aa  218  2e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.145649  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2346  hypothetical protein  31.18 
 
 
485 aa  217  4e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0051399  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2218  hypothetical protein  30.53 
 
 
485 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3106  hypothetical protein  29.98 
 
 
485 aa  214  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000134591 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1298  beta-lactamase  31.56 
 
 
566 aa  211  2e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0693  beta-lactamase  31.36 
 
 
530 aa  209  9e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.750269  normal  0.541197 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2018  penicillin-binding protein  29.67 
 
 
485 aa  209  1e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2813  beta-lactamase  28.95 
 
 
499 aa  192  2e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1134  beta-lactamase  31.98 
 
 
603 aa  189  7e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.260461 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0735  beta-lactamase  29.65 
 
 
551 aa  186  1.0000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0653  beta-lactamase  28.78 
 
 
531 aa  186  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2632  beta-lactamase  31.1 
 
 
503 aa  184  3e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.119708  hitchhiker  0.000636173 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4657  beta-lactamase  30.9 
 
 
485 aa  180  4e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3068  beta-lactamase  31.47 
 
 
466 aa  177  3e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.129348 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0822  6Fe-6S prismane cluster-containing protein-like protein  28.51 
 
 
455 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1625  beta-lactamase  29.55 
 
 
533 aa  175  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.170379  normal  0.921213 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4610  beta-lactamase  29.36 
 
 
533 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0702461  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4420  beta-lactamase  26.67 
 
 
519 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01660  beta-lactamase  33.62 
 
 
447 aa  174  3.9999999999999995e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.142612  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1757  beta-lactamase  28.78 
 
 
531 aa  174  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8154  beta-lactamase  33.24 
 
 
550 aa  173  5.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4429  beta-lactamase  29.15 
 
 
533 aa  172  9e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4516  beta-lactamase  29.15 
 
 
533 aa  172  9e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4810  beta-lactamase  29.15 
 
 
533 aa  173  9e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4990  beta-lactamase  27.87 
 
 
531 aa  170  5e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4050  beta-lactamase  26.1 
 
 
519 aa  169  1e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.817302  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6123  beta-lactamase  27.25 
 
 
536 aa  167  4e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.299024  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1230  beta-lactamase  30.99 
 
 
455 aa  166  9e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4076  beta-lactamase  31.19 
 
 
566 aa  166  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1263  beta-lactamase-like protein  30.99 
 
 
455 aa  166  1.0000000000000001e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1064  beta-lactamase  31.42 
 
 
544 aa  162  1e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10925  hypothetical protein  28.7 
 
 
562 aa  157  3e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1514  beta-lactamase  25.23 
 
 
620 aa  156  7e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00027695  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0805  beta-lactamase  26.41 
 
 
519 aa  152  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1621  beta-lactamase  28.99 
 
 
426 aa  152  2e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.193235  normal  0.330681 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4133  beta-lactamase  30.7 
 
 
822 aa  146  8.000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.668063  normal  0.0496796 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2498  beta-lactamase  28.31 
 
 
385 aa  145  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0428857  normal  0.830123 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2118  beta-lactamase  26.87 
 
 
389 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.146261  normal  0.0898893 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5338  beta-lactamase  30.86 
 
 
525 aa  137  6.0000000000000005e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.271651  normal  0.211898 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5715  beta-lactamase  29.97 
 
 
437 aa  136  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1968  beta-lactamase  27.76 
 
 
380 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.103464 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  27.65 
 
 
595 aa  134  6e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2068  beta-lactamase  26.33 
 
 
385 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.567046  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1414  putative beta-lactamase  26.14 
 
 
399 aa  130  4.0000000000000003e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.182511  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2177  beta-lactamase  31.08 
 
 
543 aa  129  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.816506 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3688  beta-lactamase  31.08 
 
 
543 aa  129  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497517  normal  0.011807 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8721  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  29.89 
 
 
480 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1018  beta-lactamase  27.86 
 
 
461 aa  129  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.624623 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2979  beta-lactamase  28.53 
 
 
655 aa  125  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2459  beta-lactamase  26.72 
 
 
466 aa  125  3e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2727  beta-lactamase  27.08 
 
 
486 aa  124  4e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  26.91 
 
 
477 aa  123  7e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3274  beta-lactamase  31.27 
 
 
524 aa  123  9e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.847415 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  27.11 
 
 
505 aa  123  9.999999999999999e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2968  beta-lactamase  27.54 
 
 
462 aa  122  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2198  beta-lactamase  28.88 
 
 
543 aa  121  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.176904  normal  0.0317754 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  29.32 
 
 
356 aa  120  4.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1311  beta-lactamase  26.02 
 
 
669 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1164  beta-lactamase  30.42 
 
 
501 aa  120  7.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  29.17 
 
 
362 aa  120  7.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0675  beta-lactamase  25.81 
 
 
377 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  29.65 
 
 
559 aa  117  3e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0999  beta-lactamase  27.61 
 
 
367 aa  118  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0117018 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1839  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  26.65 
 
 
681 aa  116  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000051234  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4706  beta-lactamase  24.93 
 
 
444 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3032  beta-lactamase  29.56 
 
 
507 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.436003 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11747  penicillin-binding protein  27.3 
 
 
539 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.47398 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2650  beta-lactamase  27.2 
 
 
497 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0361544  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3830  beta-lactamase  27.72 
 
 
658 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223137  normal  0.372687 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  28.29 
 
 
601 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0563  beta-lactamase  27.33 
 
 
506 aa  115  3e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000636485 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  28.02 
 
 
446 aa  113  9e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2779  beta-lactamase  25.61 
 
 
445 aa  113  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000737728  hitchhiker  0.0000305116 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0201  beta-lactamase  26.87 
 
 
530 aa  113  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.494145 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.06 
 
 
442 aa  112  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0759  putative beta-lactamase class C penicillin binding protein  30.22 
 
 
498 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445171  normal  0.118882 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1955  beta-lactamase  26.13 
 
 
694 aa  111  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.1377  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1936  beta-lactamase  25.81 
 
 
848 aa  111  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.178754  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0335  hypothetical protein  26 
 
 
533 aa  111  3e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>