More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2198 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2198  beta-lactamase  100 
 
 		 543 aa  1123    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.176904  normal  0.0317754 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3688  beta-lactamase  29.38 
 
 		 543 aa  261  2e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497517  normal  0.011807 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2177  beta-lactamase  29.38 
 
 		 543 aa  261  2e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.816506 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1520  Beta-lactamase  31.34 
 
 		 537 aa  252  1e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000638983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  29.6 
 
 		 559 aa  248  2e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  35.91 
 
 		 477 aa  187  6e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5443  putative beta-lactamase  31.74 
 
 		 364 aa  172  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.65256  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5119  beta-lactamase  30.68 
 
 		 402 aa  169  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  31.46 
 
 		 362 aa  162  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  31.32 
 
 		 356 aa  162  2e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2968  beta-lactamase  31.67 
 
 		 462 aa  161  3e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4346  Beta-lactamase  30.33 
 
 		 547 aa  154  5e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3175  beta-lactamase  28.57 
 
 		 351 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0119788  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  31.98 
 
 		 487 aa  146  8.000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5264  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  31.65 
 
 		 493 aa  143  6e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.0797924 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  32.7 
 
 		 442 aa  142  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4636  beta-lactamase  29.67 
 
 		 496 aa  139  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4671  alkaline D-peptidase, putative  28.99 
 
 		 330 aa  137  7.000000000000001e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.126225  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4350  Beta-lactamase  28.44 
 
 		 553 aa  137  7.000000000000001e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0947  D-aminopeptidase  28.96 
 
 		 518 aa  135  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0889  D-aminopeptidase  28.96 
 
 		 518 aa  135  3e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11951  lipoprotein  29.87 
 
 		 371 aa  133  7.999999999999999e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2638  beta-lactamase  31.75 
 
 		 445 aa  132  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  27.46 
 
 		 578 aa  130  5.0000000000000004e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  31.82 
 
 		 377 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1412  D-aminopeptidase  26 
 
 		 520 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1936  beta-lactamase  28.93 
 
 		 848 aa  126  8.000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.178754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1832  beta-lactamase  26.23 
 
 		 446 aa  125  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.29245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  24.65 
 
 		 446 aa  124  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3068  beta-lactamase  28.17 
 
 		 466 aa  123  9e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.129348 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5985  beta-lactamase  26.96 
 
 		 342 aa  123  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0467  beta-lactamase  29.02 
 
 		 520 aa  122  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2987  beta-lactamase  28.88 
 
 		 526 aa  121  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.204407  normal  0.639877 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1439  Beta-lactamase  28.66 
 
 		 330 aa  121  3e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0862025  normal  0.346233 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2294  penicillin-binding protein, putative  26.37 
 
 		 434 aa  121  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.272122  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2717  beta-lactamase  27.65 
 
 		 470 aa  119  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4280  beta-lactamase  28.48 
 
 		 330 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0116  beta-lactamase  26.18 
 
 		 453 aa  118  1.9999999999999998e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2736  beta-lactamase  27.09 
 
 		 417 aa  117  6.9999999999999995e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.416885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3512  beta-lactamase  27.97 
 
 		 364 aa  114  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1906  beta-lactamase  28.05 
 
 		 369 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3246  D-aminopeptidase  26.76 
 
 		 516 aa  113  7.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3981  D-aminopeptidase  26.42 
 
 		 516 aa  113  7.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2516  beta-lactamase  27.91 
 
 		 498 aa  113  9e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000422279  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2468  beta-lactamase  27.91 
 
 		 498 aa  113  9e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00176956  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.74 
 
 		 392 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2556  beta-lactamase  30.18 
 
 		 328 aa  112  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.400267 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01660  beta-lactamase  28.53 
 
 		 447 aa  112  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.142612  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2075  beta-lactamase  26.55 
 
 		 511 aa  111  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0939  beta-lactamase  28.26 
 
 		 338 aa  111  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.18746 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0140  beta-lactamase  26.6 
 
 		 503 aa  110  5e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.877778  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13238  penicillin-binding protein, putative  28.72 
 
 		 431 aa  110  8.000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.652866  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04833  beta-lactamase  25.2 
 
 		 529 aa  110  8.000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2793  beta-lactamase  28.15 
 
 		 510 aa  109  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.879811  normal  0.340954 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2415  beta-lactamase  27.03 
 
 		 442 aa  109  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0834226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3247  beta-lactamase  27.47 
 
 		 513 aa  108  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1230  beta-lactamase  26.9 
 
 		 455 aa  108  3e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3817  beta-lactamase  26.8 
 
 		 364 aa  108  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1263  beta-lactamase-like protein  26.9 
 
 		 455 aa  108  4e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3615  beta-lactamase  28.96 
 
 		 611 aa  107  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0663146 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2343  beta-lactamase  26.11 
 
 		 803 aa  107  6e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.23617 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2727  beta-lactamase  27.03 
 
 		 486 aa  106  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3731  beta-lactamase  29.43 
 
 		 603 aa  105  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.227339 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2353  penicillin-binding protein  24.94 
 
 		 481 aa  105  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000218323  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0863  beta-lactamase  27.98 
 
 		 363 aa  105  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2459  beta-lactamase  25.62 
 
 		 466 aa  105  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  26.9 
 
 		 505 aa  104  4e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  25.76 
 
 		 595 aa  103  6e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3294  penicillin-binding protein  25.55 
 
 		 377 aa  103  7e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.678008  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3511  putative penicillin-binding protein  25.55 
 
 		 377 aa  103  7e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3210  beta-lactamase  26.01 
 
 		 375 aa  103  7e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.767379  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3554  penicillin-binding protein  25.55 
 
 		 377 aa  103  7e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0999  beta-lactamase  24.68 
 
 		 367 aa  103  7e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0117018 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3208  beta-lactamase  25.23 
 
 		 377 aa  102  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0230735  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2616  beta-lactamase  26.45 
 
 		 353 aa  102  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2587  putative penicillin-binding protein  24.62 
 
 		 463 aa  102  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35213e-17 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3422  beta-lactamase  28.8 
 
 		 593 aa  102  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.126074  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2539  beta-lactamase  25.73 
 
 		 567 aa  102  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.470437  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2357  beta-lactamase  24.85 
 
 		 381 aa  102  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2400  penicillin-binding protein  24.43 
 
 		 481 aa  101  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443561  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1357  beta-lactamase  26.28 
 
 		 378 aa  102  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2575  penicillin-binding protein  24.43 
 
 		 481 aa  101  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2316  penicillin-binding protein  24.74 
 
 		 481 aa  100  6e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181197  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2433  penicillin-binding protein  24.85 
 
 		 340 aa  100  7e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0197006  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3264  beta-lactamase  24.77 
 
 		 377 aa  100  7e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.664291  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1750  beta-lactamase  26.32 
 
 		 375 aa  100  7e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.339251  normal  0.99151 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2668  penicillin-binding protein  24.85 
 
 		 348 aa  100  8e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162016 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3988  beta-lactamase  25.51 
 
 		 503 aa  100  9e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8721  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  30.14 
 
 		 480 aa  99.8  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2394  penicillin-binding protein  24.85 
 
 		 340 aa  99.8  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.70958  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3498  beta-lactamase  26.32 
 
 		 375 aa  99.8  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3751  beta-lactamase  30.2 
 
 		 395 aa  100  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000498352 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1311  beta-lactamase  26.73 
 
 		 669 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4159  beta-lactamase  25.85 
 
 		 544 aa  99  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0453527  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01828  beta-lactamase precursor  28.69 
 
 		 366 aa  98.6  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.284204  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4546  beta-lactamase  28.17 
 
 		 740 aa  97.8  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2768  beta-lactamase  25.57 
 
 		 483 aa  97.8  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4213  beta-lactamase  28.15 
 
 		 403 aa  98.2  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.161495  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2469  penicillin-binding protein  25 
 
 		 340 aa  97.4  6e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.242822  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0428  beta-lactamase  26.84 
 
 		 404 aa  97.4  6e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.354595  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>