More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0947 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_1412  D-aminopeptidase  82.24 
 
 
520 aa  906    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0947  D-aminopeptidase  100 
 
 
518 aa  1068    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0889  D-aminopeptidase  99.61 
 
 
518 aa  1063    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3246  D-aminopeptidase  49.33 
 
 
516 aa  484  1e-135  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3981  D-aminopeptidase  49.23 
 
 
516 aa  480  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2198  beta-lactamase  28.96 
 
 
543 aa  135  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.176904  normal  0.0317754 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1520  Beta-lactamase  29.33 
 
 
537 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000638983  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4346  Beta-lactamase  27.87 
 
 
547 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4350  Beta-lactamase  29.1 
 
 
553 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  32.33 
 
 
442 aa  118  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  25.36 
 
 
477 aa  116  7.999999999999999e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2177  beta-lactamase  23.64 
 
 
543 aa  115  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.816506 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3688  beta-lactamase  23.64 
 
 
543 aa  115  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497517  normal  0.011807 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2638  beta-lactamase  31.33 
 
 
445 aa  112  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  23.31 
 
 
559 aa  108  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4213  beta-lactamase  25.67 
 
 
403 aa  107  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.161495  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5985  beta-lactamase  24.2 
 
 
342 aa  106  9e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  29.21 
 
 
356 aa  103  6e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2717  beta-lactamase  25.96 
 
 
470 aa  102  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5264  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  28.43 
 
 
493 aa  96.7  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.0797924 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1936  beta-lactamase  26.4 
 
 
848 aa  95.1  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.178754  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1457  beta-lactamase  24.84 
 
 
325 aa  95.1  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.17461  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0759  putative beta-lactamase class C penicillin binding protein  24.57 
 
 
498 aa  94.7  4e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445171  normal  0.118882 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5443  putative beta-lactamase  28.25 
 
 
364 aa  94  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.65256  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0831  beta-lactamase  25.07 
 
 
422 aa  93.6  7e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146809  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1906  beta-lactamase  25.89 
 
 
369 aa  91.7  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  26.98 
 
 
362 aa  90.9  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8721  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  28.86 
 
 
480 aa  90.1  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3512  beta-lactamase  23.8 
 
 
364 aa  89.4  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3175  beta-lactamase  25.48 
 
 
351 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0119788  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3988  beta-lactamase  25.5 
 
 
503 aa  89  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2793  beta-lactamase  30.39 
 
 
510 aa  88.6  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.879811  normal  0.340954 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2968  beta-lactamase  24.55 
 
 
462 aa  87  7e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  24.23 
 
 
487 aa  87  8e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0140  beta-lactamase  25.36 
 
 
503 aa  85.5  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.877778  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2353  penicillin-binding protein  24.42 
 
 
481 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000218323  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  23.58 
 
 
446 aa  85.1  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2987  beta-lactamase  25.27 
 
 
526 aa  84.7  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.204407  normal  0.639877 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2587  putative penicillin-binding protein  23.34 
 
 
463 aa  84.3  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35213e-17 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4788  beta-lactamase  25.17 
 
 
400 aa  84.3  0.000000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.416977  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2539  beta-lactamase  25 
 
 
567 aa  84  0.000000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.470437  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2921  beta-lactamase class C-like protein  22.12 
 
 
451 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.154271 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11951  lipoprotein  26.38 
 
 
371 aa  82.4  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3698  beta-lactamase  29.6 
 
 
476 aa  82.4  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.884543  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2400  penicillin-binding protein  22.83 
 
 
481 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443561  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2316  penicillin-binding protein  23.05 
 
 
481 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181197  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2575  penicillin-binding protein  22.83 
 
 
481 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  23.87 
 
 
392 aa  81.3  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0999  beta-lactamase  23.48 
 
 
367 aa  80.9  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0117018 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0159  beta-lactamase  20.86 
 
 
410 aa  80.9  0.00000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2579  penicillin-binding protein, putative  23.53 
 
 
483 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0220569  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2384  beta-lactamase  22.1 
 
 
483 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1123  hypothetical protein  24.4 
 
 
371 aa  79.7  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3422  beta-lactamase  26.1 
 
 
593 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.126074  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1119  hypothetical protein  25 
 
 
371 aa  79  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3731  beta-lactamase  25.87 
 
 
603 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.227339 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2544  putative penicillin-binding protein  24.31 
 
 
483 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0603  beta-lactamase  27.41 
 
 
409 aa  79  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.875784  normal  0.055059 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1357  beta-lactamase  22.58 
 
 
378 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0412  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  23.2 
 
 
422 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0483  putative penicillin-binding protein  23.2 
 
 
412 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0473  penicillin-binding protein  22.88 
 
 
421 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0368  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.57 
 
 
399 aa  78.2  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00562308  normal  0.495103 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0502  penicillin-binding protein  22.88 
 
 
412 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4280  beta-lactamase  24.53 
 
 
330 aa  77.4  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0416  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  22.88 
 
 
421 aa  77  0.0000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0430511  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0098  beta-lactamase  25.42 
 
 
691 aa  77  0.0000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2736  beta-lactamase  20.95 
 
 
417 aa  77  0.0000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.416885  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0505  putative penicillin-binding protein  23.53 
 
 
415 aa  77  0.0000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0859162  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2629  putative penicillin-binding protein  23.53 
 
 
490 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0110315  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2060  beta-lactamase  23.32 
 
 
485 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.258254  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13238  penicillin-binding protein, putative  21.53 
 
 
431 aa  76.3  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.652866  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3032  beta-lactamase  33.33 
 
 
507 aa  76.3  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.436003 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5915  penicillin binding protein  23.97 
 
 
502 aa  76.6  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0555  penicillin-binding protein, putative  23.2 
 
 
413 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.389605  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2991  beta-lactamase  24.64 
 
 
475 aa  75.9  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0939  beta-lactamase  26.37 
 
 
338 aa  75.9  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.18746 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04833  beta-lactamase  23.74 
 
 
529 aa  75.5  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1818  beta-lactamase  27.27 
 
 
513 aa  75.1  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1234  beta-lactamase  25.47 
 
 
519 aa  75.1  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565811  normal  0.301621 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1955  beta-lactamase  24.58 
 
 
694 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.1377  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0294  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  25.53 
 
 
834 aa  75.1  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00108534  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3498  beta-lactamase  23.29 
 
 
375 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1551  beta-lactamase  27.02 
 
 
333 aa  74.7  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.345066  normal  0.407276 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3751  beta-lactamase  25.33 
 
 
395 aa  74.7  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000498352 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5338  beta-lactamase  32.09 
 
 
525 aa  74.3  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.271651  normal  0.211898 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5167  beta-lactamase  25.32 
 
 
713 aa  73.9  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.619685  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3264  beta-lactamase  23.91 
 
 
377 aa  73.9  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.664291  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3210  beta-lactamase  23.91 
 
 
375 aa  73.9  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.767379  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1832  beta-lactamase  21.71 
 
 
446 aa  73.9  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.29245  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1867  beta-lactamase  24.16 
 
 
517 aa  73.9  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0109165  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4818  putative penicillin-binding protein  22.55 
 
 
416 aa  73.9  0.000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.618322  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2343  beta-lactamase  24.2 
 
 
803 aa  73.9  0.000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.23617 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0675  beta-lactamase  26.99 
 
 
377 aa  73.6  0.000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3247  beta-lactamase  24.23 
 
 
513 aa  73.6  0.000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2953  beta-lactamase  24.2 
 
 
513 aa  73.6  0.000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3243  beta-lactamase family protein  24.6 
 
 
513 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  21.28 
 
 
578 aa  73.2  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3391  beta-lactamase  28.51 
 
 
420 aa  72.8  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2616  beta-lactamase  21.4 
 
 
353 aa  73.2  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>