More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5264 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_5264  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  100 
 
 
493 aa  970    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.0797924 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1520  Beta-lactamase  34.17 
 
 
537 aa  186  7e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000638983  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  33.33 
 
 
559 aa  184  2.0000000000000003e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3175  beta-lactamase  32.84 
 
 
351 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0119788  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  35.92 
 
 
356 aa  166  1.0000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2177  beta-lactamase  28.49 
 
 
543 aa  164  5.0000000000000005e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.816506 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3688  beta-lactamase  28.49 
 
 
543 aa  164  5.0000000000000005e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497517  normal  0.011807 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  29.51 
 
 
477 aa  145  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2198  beta-lactamase  31.65 
 
 
543 aa  144  4e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.176904  normal  0.0317754 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5443  putative beta-lactamase  30.9 
 
 
364 aa  144  5e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.65256  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2717  beta-lactamase  30.46 
 
 
470 aa  139  7.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  30.03 
 
 
362 aa  138  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11951  lipoprotein  33.02 
 
 
371 aa  137  5e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5119  beta-lactamase  26.4 
 
 
402 aa  131  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4671  alkaline D-peptidase, putative  34.26 
 
 
330 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.126225  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1936  beta-lactamase  29.41 
 
 
848 aa  125  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.178754  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2968  beta-lactamase  30.33 
 
 
462 aa  124  5e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3022  alkaline D-peptidase and alkaline D-peptidase fusion  32.23 
 
 
720 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0802631  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4346  Beta-lactamase  30.09 
 
 
547 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2409  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  29.64 
 
 
388 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.37701  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1439  Beta-lactamase  33 
 
 
330 aa  117  5e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0862025  normal  0.346233 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2587  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27.41 
 
 
413 aa  117  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.607083  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5167  beta-lactamase  31.31 
 
 
713 aa  116  6.9999999999999995e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.619685  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4280  beta-lactamase  29.17 
 
 
330 aa  116  7.999999999999999e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1234  beta-lactamase  30.14 
 
 
519 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565811  normal  0.301621 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2478  alkaline D-peptidase  29.32 
 
 
388 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.431844  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2440  alkaline D-peptidase (D-stereospecific peptide hydrolase)  29.32 
 
 
388 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00540718  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2661  alkaline d-peptidase  29.32 
 
 
388 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3247  beta-lactamase  29.62 
 
 
513 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2677  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  29.32 
 
 
388 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000522854 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3027  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.43 
 
 
406 aa  113  6e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.899556  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0939  beta-lactamase  30.19 
 
 
338 aa  113  9e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.18746 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0099  D-stereospecific peptide hydrolase  28.95 
 
 
443 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000129924  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3018  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.8 
 
 
389 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.470862  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1164  beta-lactamase  28.01 
 
 
501 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3206  beta-lactamase  28.71 
 
 
389 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.93 
 
 
442 aa  111  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2638  beta-lactamase  29.79 
 
 
445 aa  110  5e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2296  alkaline D-peptidase  28.57 
 
 
385 aa  110  5e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000100431 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2053  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  28.57 
 
 
385 aa  110  6e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00880281  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2381  alkaline D-peptidase  28.52 
 
 
385 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0825231  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2051  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  28.01 
 
 
385 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.319079  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2539  beta-lactamase  32.09 
 
 
567 aa  110  7.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.470437  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04833  beta-lactamase  28.99 
 
 
529 aa  109  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2343  beta-lactamase  28.35 
 
 
803 aa  108  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.23617 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4632  beta-lactamase  33.84 
 
 
370 aa  108  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0925307  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13238  penicillin-binding protein, putative  24.92 
 
 
431 aa  108  3e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.652866  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0759  putative beta-lactamase class C penicillin binding protein  28.98 
 
 
498 aa  108  3e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445171  normal  0.118882 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2576  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  28.16 
 
 
389 aa  107  6e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.145811 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1311  beta-lactamase  26.44 
 
 
669 aa  107  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2093  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  28.87 
 
 
407 aa  107  6e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3518  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  32.29 
 
 
508 aa  107  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5985  beta-lactamase  24.62 
 
 
342 aa  106  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0275  beta-lactamase  33.33 
 
 
400 aa  106  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.35061  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3731  beta-lactamase  32.84 
 
 
603 aa  105  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.227339 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4350  Beta-lactamase  29.94 
 
 
553 aa  105  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0973  beta-lactamase  25.97 
 
 
514 aa  105  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5338  beta-lactamase  33.44 
 
 
525 aa  105  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.271651  normal  0.211898 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2294  penicillin-binding protein, putative  24.92 
 
 
434 aa  105  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.272122  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1094  beta-lactamase  31.48 
 
 
349 aa  104  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1923  beta-lactamase  31.34 
 
 
389 aa  104  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2573  beta-lactamase  29.47 
 
 
476 aa  105  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.369136  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3175  beta-lactamase  28.52 
 
 
375 aa  104  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.702373  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2217  alkaline D-peptidase  28.52 
 
 
388 aa  104  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  3.66047e-16 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3436  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  31.07 
 
 
381 aa  104  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2860  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  28.52 
 
 
385 aa  104  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28769  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3512  beta-lactamase  28.57 
 
 
364 aa  104  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3030  alkaline D-peptidase  28.52 
 
 
388 aa  103  5e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3422  beta-lactamase  32.74 
 
 
593 aa  103  6e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.126074  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3032  beta-lactamase  33.53 
 
 
507 aa  103  6e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.436003 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3274  beta-lactamase  26.41 
 
 
524 aa  103  6e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.847415 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3147  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  28.18 
 
 
407 aa  103  9e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.943509  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2769  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  27.72 
 
 
389 aa  102  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.48212  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1412  D-aminopeptidase  28.43 
 
 
520 aa  102  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2727  beta-lactamase  26.32 
 
 
486 aa  102  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3027  alkaline D-peptidase  27.53 
 
 
388 aa  102  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3751  beta-lactamase  28.85 
 
 
395 aa  102  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000498352 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2819  alkaline D-peptidase  27.34 
 
 
388 aa  102  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118082  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3264  beta-lactamase  26.12 
 
 
377 aa  102  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.664291  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2987  beta-lactamase  28.19 
 
 
526 aa  102  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.204407  normal  0.639877 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3033  alkaline d-peptidase  27.34 
 
 
388 aa  102  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.400662  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3615  beta-lactamase  33.04 
 
 
611 aa  102  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0663146 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3210  beta-lactamase  27.8 
 
 
375 aa  101  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.767379  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4094  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.87 
 
 
405 aa  101  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4170  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.87 
 
 
405 aa  101  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4325  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.12 
 
 
405 aa  101  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0248121  normal  0.0483573 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27.93 
 
 
392 aa  101  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1457  beta-lactamase  25.61 
 
 
325 aa  100  5e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.17461  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3498  beta-lactamase  26.12 
 
 
375 aa  100  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1906  beta-lactamase  25.97 
 
 
369 aa  100  6e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3507  penicillin-binding protein, putative  26.87 
 
 
375 aa  100  7e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3518  putative penicillin-binding protein  26.46 
 
 
377 aa  100  7e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1072  Beta-lactamase  27.96 
 
 
412 aa  100  7e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3281  beta-lactamase  30.23 
 
 
414 aa  100  8e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.916487  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4546  beta-lactamase  33.33 
 
 
740 aa  100  9e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207661  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3208  beta-lactamase  26.12 
 
 
377 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0230735  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1832  beta-lactamase  28.97 
 
 
446 aa  99.8  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.29245  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  24.04 
 
 
446 aa  99  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3554  penicillin-binding protein  25.77 
 
 
377 aa  98.6  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2647  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.86 
 
 
429 aa  99  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.180779  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>