More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1439 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_1439  Beta-lactamase  100 
 
 		 330 aa  685    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0862025  normal  0.346233 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4671  alkaline D-peptidase, putative  73.64 
 
 		 330 aa  521  1e-147  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.126225  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3175  beta-lactamase  39.06 
 
 		 351 aa  232  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0119788  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1520  Beta-lactamase  31.97 
 
 		 537 aa  177  3e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000638983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11951  lipoprotein  31.79 
 
 		 371 aa  171  1e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  33.23 
 
 		 559 aa  171  2e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5443  putative beta-lactamase  32.82 
 
 		 364 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.65256  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2177  beta-lactamase  29.61 
 
 		 543 aa  145  6e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.816506 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3688  beta-lactamase  29.61 
 
 		 543 aa  145  6e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497517  normal  0.011807 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  31.86 
 
 		 446 aa  145  7.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  30.25 
 
 		 356 aa  144  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0939  beta-lactamase  32.81 
 
 		 338 aa  142  8e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.18746 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4280  beta-lactamase  31.25 
 
 		 330 aa  141  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5119  beta-lactamase  27.57 
 
 		 402 aa  138  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2198  beta-lactamase  28.66 
 
 		 543 aa  137  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.176904  normal  0.0317754 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5264  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  33 
 
 		 493 aa  136  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.0797924 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  31.43 
 
 		 362 aa  135  9e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2793  beta-lactamase  30.65 
 
 		 510 aa  132  7.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.879811  normal  0.340954 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3512  beta-lactamase  29.56 
 
 		 364 aa  131  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1936  beta-lactamase  29.71 
 
 		 848 aa  130  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.178754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1457  beta-lactamase  29.56 
 
 		 325 aa  129  7.000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.17461  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1832  beta-lactamase  30.16 
 
 		 446 aa  126  5e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.29245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.74 
 
 		 442 aa  125  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5150  beta-lactamase  30.58 
 
 		 369 aa  123  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.654906 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3751  beta-lactamase  28.48 
 
 		 395 aa  122  7e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000498352 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2294  penicillin-binding protein, putative  31.4 
 
 		 434 aa  122  9e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.272122  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2638  beta-lactamase  30.98 
 
 		 445 aa  121  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4213  beta-lactamase  27.55 
 
 		 403 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.161495  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0343  beta-lactamase  28.31 
 
 		 482 aa  117  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1906  beta-lactamase  29.11 
 
 		 369 aa  116  5e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.25 
 
 		 392 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0116  beta-lactamase  28.14 
 
 		 453 aa  112  1.0000000000000001e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  28.47 
 
 		 487 aa  111  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  25.54 
 
 		 477 aa  110  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2968  beta-lactamase  28.33 
 
 		 462 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2573  beta-lactamase  28.11 
 
 		 476 aa  110  5e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.369136  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2991  beta-lactamase  27.54 
 
 		 475 aa  109  5e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  26.11 
 
 		 377 aa  109  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3731  beta-lactamase  28.35 
 
 		 603 aa  108  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.227339 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4043  beta-lactamase  30.52 
 
 		 361 aa  108  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1818  beta-lactamase  28.82 
 
 		 513 aa  108  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3422  beta-lactamase  28.35 
 
 		 593 aa  108  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.126074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0863  beta-lactamase  28.93 
 
 		 363 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2053  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  30.36 
 
 		 385 aa  107  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00880281  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5167  beta-lactamase  30.38 
 
 		 713 aa  107  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.619685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3030  alkaline D-peptidase  29.65 
 
 		 388 aa  106  5e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3615  beta-lactamase  28.96 
 
 		 611 aa  106  5e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0663146 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2051  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  29.14 
 
 		 385 aa  106  6e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.319079  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2576  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  29.71 
 
 		 389 aa  106  6e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.145811 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3018  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30 
 
 		 389 aa  106  7e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.470862  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0831  beta-lactamase  24.78 
 
 		 422 aa  106  7e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146809  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2573  fmtA-like protein, putative  28.08 
 
 		 482 aa  105  9e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00911316  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0099  D-stereospecific peptide hydrolase  30.74 
 
 		 443 aa  105  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000129924  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4346  Beta-lactamase  30.92 
 
 		 547 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4350  Beta-lactamase  27.51 
 
 		 553 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2381  alkaline D-peptidase  29.49 
 
 		 385 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0825231  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2296  alkaline D-peptidase  30.03 
 
 		 385 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000100431 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2217  alkaline D-peptidase  29.34 
 
 		 388 aa  105  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.66047e-16 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1710  beta-lactamase  29.39 
 
 		 463 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.903063 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2860  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  29.71 
 
 		 385 aa  104  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28769  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0759  putative beta-lactamase class C penicillin binding protein  32.04 
 
 		 498 aa  104  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445171  normal  0.118882 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5738  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27.54 
 
 		 447 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.38713 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0154  beta-lactamase  27.76 
 
 		 482 aa  103  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2409  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  28.57 
 
 		 388 aa  103  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.37701  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0375  beta-lactamase  29.28 
 
 		 381 aa  104  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  29.81 
 
 		 578 aa  103  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3175  beta-lactamase  29.74 
 
 		 375 aa  103  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.702373  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  25.82 
 
 		 505 aa  103  5e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0973  beta-lactamase  25.94 
 
 		 514 aa  103  6e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0368  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.62 
 
 		 399 aa  102  7e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00562308  normal  0.495103 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4191  beta-lactamase  30.05 
 
 		 386 aa  102  7e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.249358 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3206  beta-lactamase  29.77 
 
 		 389 aa  102  9e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2433  penicillin-binding protein  27.73 
 
 		 340 aa  102  9e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0197006  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2093  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  29.71 
 
 		 407 aa  102  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2080  beta-lactamase  26.01 
 
 		 370 aa  102  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.16247  normal  0.44675 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3147  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  29.71 
 
 		 407 aa  102  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.943509  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2668  penicillin-binding protein  27.73 
 
 		 348 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162016 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5360  twin-arginine translocation pathway signal  27.16 
 
 		 447 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5451  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27.16 
 
 		 447 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0503905 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2357  beta-lactamase  26.2 
 
 		 381 aa  101  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2440  alkaline D-peptidase (D-stereospecific peptide hydrolase)  28.25 
 
 		 388 aa  100  5e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00540718  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2677  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  28.25 
 
 		 388 aa  100  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000522854 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0159  beta-lactamase  23.89 
 
 		 410 aa  99.8  6e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2556  beta-lactamase  25.83 
 
 		 328 aa  99.4  7e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.400267 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0467  beta-lactamase  25.55 
 
 		 520 aa  99  9e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1164  beta-lactamase  31.69 
 
 		 501 aa  98.6  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2478  alkaline D-peptidase  27.92 
 
 		 388 aa  98.6  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.431844  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2736  beta-lactamase  27.62 
 
 		 417 aa  99  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.416885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2661  alkaline d-peptidase  27.92 
 
 		 388 aa  98.6  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2615  hypothetical protein  27.14 
 
 		 793 aa  98.6  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.377093  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0502  beta-lactamase  28.21 
 
 		 358 aa  99  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2137  beta-lactamase  27.58 
 
 		 366 aa  99  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.113996 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3027  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.57 
 
 		 406 aa  99  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.899556  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2469  penicillin-binding protein  27.41 
 
 		 340 aa  97.8  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.242822  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0963  beta-lactamase  32.78 
 
 		 423 aa  97.8  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.146357  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0934  beta-lactamase  26.86 
 
 		 475 aa  97.8  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000419238  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2650  penicillin-binding protein  27.41 
 
 		 340 aa  97.8  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0606  serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  26.89 
 
 		 438 aa  98.2  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0675  beta-lactamase  30.16 
 
 		 377 aa  97.1  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2394  penicillin-binding protein  26.79 
 
 		 340 aa  96.7  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.70958  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>