More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0159 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0159  beta-lactamase  100 
 
 		 410 aa  846    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3751  beta-lactamase  36.2 
 
 		 395 aa  253  5.000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000498352 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4213  beta-lactamase  38.56 
 
 		 403 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.161495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4919  beta-lactamase  40.06 
 
 		 415 aa  231  2e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.318437  normal  0.850487 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4788  beta-lactamase  30.32 
 
 		 400 aa  192  6e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.416977  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1936  beta-lactamase  32.17 
 
 		 848 aa  181  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.178754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1031  beta-lactamase  30.66 
 
 		 358 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2793  beta-lactamase  29.13 
 
 		 510 aa  153  5e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.879811  normal  0.340954 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0939  beta-lactamase  30.4 
 
 		 338 aa  152  7e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.18746 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3512  beta-lactamase  30.21 
 
 		 364 aa  152  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0831  beta-lactamase  29.03 
 
 		 422 aa  150  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.97 
 
 		 392 aa  150  4e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  28.85 
 
 		 487 aa  149  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  30.94 
 
 		 356 aa  144  3e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4280  beta-lactamase  30.16 
 
 		 330 aa  144  4e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2357  beta-lactamase  27.6 
 
 		 381 aa  143  6e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1832  beta-lactamase  30.21 
 
 		 446 aa  140  4.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.29245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  30.27 
 
 		 578 aa  138  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  32.24 
 
 		 477 aa  138  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0419  beta-lactamase  27.67 
 
 		 416 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5443  putative beta-lactamase  31.73 
 
 		 364 aa  134  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.65256  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1906  beta-lactamase  29.31 
 
 		 369 aa  134  3e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0473  penicillin-binding protein  29.17 
 
 		 421 aa  133  5e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0416  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  29.17 
 
 		 421 aa  133  5e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0430511  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0502  penicillin-binding protein  29.17 
 
 		 412 aa  133  5e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0412  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  28.77 
 
 		 422 aa  133  6e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0483  putative penicillin-binding protein  29.17 
 
 		 412 aa  133  6e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0428  beta-lactamase  28.77 
 
 		 404 aa  132  9e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.354595  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0505  putative penicillin-binding protein  29.68 
 
 		 415 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0859162  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0555  penicillin-binding protein, putative  29.71 
 
 		 413 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.389605  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3422  beta-lactamase  29.75 
 
 		 593 aa  130  3e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.126074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  31.47 
 
 		 446 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4818  putative penicillin-binding protein  29.35 
 
 		 416 aa  130  6e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.618322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0558  putative penicillin-binding protein  29.71 
 
 		 413 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.622752  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3731  beta-lactamase  30.06 
 
 		 603 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.227339 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2294  penicillin-binding protein, putative  28.8 
 
 		 434 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.272122  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3615  beta-lactamase  29.6 
 
 		 611 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0663146 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13238  penicillin-binding protein, putative  30.38 
 
 		 431 aa  128  2.0000000000000002e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.652866  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1457  beta-lactamase  29.77 
 
 		 325 aa  125  1e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.17461  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0863  beta-lactamase  30 
 
 		 363 aa  124  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.1 
 
 		 442 aa  124  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2736  beta-lactamase  29.51 
 
 		 417 aa  119  7e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.416885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2638  beta-lactamase  28.66 
 
 		 445 aa  119  9e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2679  penicillin-binding protein  30.51 
 
 		 341 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  24.48 
 
 		 362 aa  116  6.9999999999999995e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5150  beta-lactamase  27.85 
 
 		 369 aa  116  8.999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.654906 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1520  Beta-lactamase  27.47 
 
 		 537 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000638983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2573  beta-lactamase  28.93 
 
 		 476 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.369136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2632  penicillin-binding protein  29.83 
 
 		 341 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.149759  decreased coverage  0.000000240236 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01828  beta-lactamase precursor  28.09 
 
 		 366 aa  114  3e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.284204  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1830  beta-lactamase  31.34 
 
 		 452 aa  114  3e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.162579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2172  beta-lactamase  31.34 
 
 		 428 aa  114  3e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.65714  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1357  beta-lactamase  28.31 
 
 		 378 aa  113  5e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  26.71 
 
 		 377 aa  113  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5985  beta-lactamase  27.69 
 
 		 342 aa  112  8.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2650  beta-lactamase  27.61 
 
 		 497 aa  113  8.000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0361544  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2881  beta-lactamase  27.9 
 
 		 338 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.74645  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2394  penicillin-binding protein  28.23 
 
 		 340 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.70958  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6092  beta-lactamase  29.52 
 
 		 419 aa  110  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.152854 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2177  beta-lactamase  26.67 
 
 		 543 aa  110  6e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.816506 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3688  beta-lactamase  26.67 
 
 		 543 aa  110  6e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497517  normal  0.011807 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5607  hypothetical protein  29.63 
 
 		 784 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2469  penicillin-binding protein  27.8 
 
 		 340 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.242822  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1713  beta-lactamase  28.46 
 
 		 347 aa  108  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2650  penicillin-binding protein  27.8 
 
 		 340 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2433  penicillin-binding protein  28.14 
 
 		 340 aa  107  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0197006  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2668  penicillin-binding protein  28.22 
 
 		 348 aa  107  4e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162016 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2259  beta-lactamase  30.48 
 
 		 416 aa  107  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.296569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2468  beta-lactamase  26.54 
 
 		 498 aa  107  5e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00176956  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2516  beta-lactamase  26.54 
 
 		 498 aa  107  5e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000422279  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11951  lipoprotein  26.06 
 
 		 371 aa  107  5e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1777  beta-lactamase  30.66 
 
 		 343 aa  105  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00484911  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8721  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  26.8 
 
 		 480 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2768  beta-lactamase  28.52 
 
 		 483 aa  105  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  28.86 
 
 		 505 aa  105  2e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5167  beta-lactamase  26.71 
 
 		 713 aa  105  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.619685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  25.99 
 
 		 559 aa  105  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4191  beta-lactamase  25.8 
 
 		 386 aa  105  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.249358 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0606  serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  24.36 
 
 		 438 aa  104  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2717  beta-lactamase  25.51 
 
 		 470 aa  104  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0343  beta-lactamase  26.27 
 
 		 482 aa  103  4e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2721  penicillin-binding protein  27.97 
 
 		 340 aa  103  7e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0897232  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2415  beta-lactamase  27.33 
 
 		 442 aa  102  9e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0834226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0618  beta-lactamase  28.9 
 
 		 450 aa  102  9e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3507  penicillin-binding protein, putative  29.76 
 
 		 375 aa  102  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4671  alkaline D-peptidase, putative  23.73 
 
 		 330 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.126225  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4430  beta-lactamase  25.73 
 
 		 434 aa  102  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.134179 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2968  beta-lactamase  26.82 
 
 		 462 aa  102  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2400  penicillin-binding protein  26.03 
 
 		 481 aa  102  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443561  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2575  penicillin-binding protein  26.03 
 
 		 481 aa  102  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1364  beta-lactamase  26.75 
 
 		 574 aa  101  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.185265  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3518  putative penicillin-binding protein  29.76 
 
 		 377 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2353  penicillin-binding protein  25.08 
 
 		 481 aa  100  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000218323  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2579  penicillin-binding protein, putative  25 
 
 		 483 aa  100  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0220569  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2316  beta-lactamase  27.04 
 
 		 467 aa  100  5e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0048462  decreased coverage  0.0000015739 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2539  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27.71 
 
 		 445 aa  100  5e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2316  penicillin-binding protein  25 
 
 		 481 aa  100  6e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181197  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2587  putative penicillin-binding protein  25 
 
 		 463 aa  99.8  8e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35213e-17 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2778  beta-lactamase  27.05 
 
 		 380 aa  99.8  9e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.701087  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3208  beta-lactamase  27.12 
 
 		 377 aa  99.8  9e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0230735  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>