More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8721 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_8721  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  100 
 
 
480 aa  959    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3032  beta-lactamase  51.58 
 
 
507 aa  384  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.436003 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5338  beta-lactamase  55.24 
 
 
525 aa  370  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.271651  normal  0.211898 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5593  beta-lactamase  47.69 
 
 
480 aa  366  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3698  beta-lactamase  42.67 
 
 
476 aa  313  3.9999999999999997e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.884543  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3518  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  39.49 
 
 
508 aa  245  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1788  beta-lactamase  36.09 
 
 
560 aa  149  9e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.358741  normal  0.761746 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2650  beta-lactamase  34.79 
 
 
497 aa  145  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0361544  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2400  penicillin-binding protein  24.45 
 
 
481 aa  140  7e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443561  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2575  penicillin-binding protein  24.45 
 
 
481 aa  140  7e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2384  beta-lactamase  25.82 
 
 
483 aa  138  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2579  penicillin-binding protein, putative  24.23 
 
 
483 aa  137  5e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0220569  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1955  beta-lactamase  32.89 
 
 
694 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.1377  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2353  penicillin-binding protein  24.09 
 
 
481 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000218323  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0294  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  29.86 
 
 
834 aa  135  1.9999999999999998e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00108534  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2587  putative penicillin-binding protein  23.96 
 
 
463 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35213e-17 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  32.04 
 
 
392 aa  134  3e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2717  beta-lactamase  31.46 
 
 
470 aa  133  6e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  28.22 
 
 
505 aa  132  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2316  penicillin-binding protein  22.98 
 
 
481 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181197  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1460  beta-lactamase  30.47 
 
 
523 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0171679  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3223  putative penicillin-binding protein  31.56 
 
 
691 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0098  beta-lactamase  32.59 
 
 
691 aa  131  3e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2036  putative penicillin-binding protein  31.56 
 
 
691 aa  130  6e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0973  beta-lactamase  25.26 
 
 
514 aa  130  7.000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2629  putative penicillin-binding protein  24.86 
 
 
490 aa  130  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0110315  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2987  beta-lactamase  29.89 
 
 
526 aa  129  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.204407  normal  0.639877 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  31.76 
 
 
601 aa  127  6e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3017  beta-lactamase  29.95 
 
 
694 aa  126  7e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151965  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3205  putative penicillin-binding protein  31.73 
 
 
694 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2389  cyclic peptide transporter  26.73 
 
 
1032 aa  126  9e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2468  beta-lactamase  25.88 
 
 
498 aa  126  9e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00176956  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2516  beta-lactamase  25.88 
 
 
498 aa  126  9e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000422279  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2989  penicillin-binding protein  30.9 
 
 
691 aa  125  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2916  penicillin-binding protein  30.9 
 
 
691 aa  125  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1783  cyclic peptide transporter  27.19 
 
 
1055 aa  125  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3214  penicillin-binding protein  30.9 
 
 
691 aa  125  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38843  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2544  putative penicillin-binding protein  23.98 
 
 
483 aa  124  5e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04833  beta-lactamase  30.75 
 
 
529 aa  124  5e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9203  beta-lactamase  33.25 
 
 
635 aa  123  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.606578 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  32.57 
 
 
356 aa  123  8e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2459  beta-lactamase  30.38 
 
 
466 aa  123  9e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0759  putative beta-lactamase class C penicillin binding protein  31.78 
 
 
498 aa  123  9e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445171  normal  0.118882 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  27.02 
 
 
595 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  32.47 
 
 
442 aa  121  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0335  hypothetical protein  32.13 
 
 
533 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2177  beta-lactamase  32.66 
 
 
543 aa  120  6e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.816506 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3688  beta-lactamase  32.66 
 
 
543 aa  120  6e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497517  normal  0.011807 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4257  beta-lactamase  31.32 
 
 
464 aa  120  7.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0934  beta-lactamase  26.63 
 
 
475 aa  119  9e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000419238  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2573  fmtA-like protein, putative  27.24 
 
 
482 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00911316  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1357  beta-lactamase  30.66 
 
 
378 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2638  beta-lactamase  31.31 
 
 
445 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6467  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  30.51 
 
 
551 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.341842  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0116  beta-lactamase  28.83 
 
 
453 aa  118  1.9999999999999998e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0154  beta-lactamase  26.91 
 
 
482 aa  117  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3247  beta-lactamase  29.88 
 
 
513 aa  118  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2060  beta-lactamase  28.66 
 
 
485 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.258254  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0801  beta-lactamase  31.84 
 
 
478 aa  117  3.9999999999999997e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.87828  normal  0.048033 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0468  beta-lactamase  31.13 
 
 
455 aa  117  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000926021 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1946  Beta-lactamase  27.73 
 
 
588 aa  117  5e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1234  beta-lactamase  30.79 
 
 
519 aa  117  6e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565811  normal  0.301621 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2343  beta-lactamase  28.72 
 
 
803 aa  116  8.999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.23617 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  29.25 
 
 
559 aa  116  8.999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1298  beta-lactamase  28.7 
 
 
566 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1710  beta-lactamase  31.63 
 
 
463 aa  115  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.903063 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6025  beta-lactamase  32.5 
 
 
460 aa  115  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.565651 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  27.51 
 
 
362 aa  114  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2068  beta-lactamase  27.16 
 
 
385 aa  114  3e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.567046  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2659  beta-lactamase  26.81 
 
 
662 aa  115  3e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11747  penicillin-binding protein  29.36 
 
 
539 aa  114  3e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.47398 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2218  hypothetical protein  25.92 
 
 
485 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0368  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  34.6 
 
 
399 aa  114  5e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00562308  normal  0.495103 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2539  beta-lactamase  30.15 
 
 
567 aa  113  6e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.470437  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3512  beta-lactamase  26.15 
 
 
364 aa  113  7.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1520  Beta-lactamase  29.57 
 
 
537 aa  113  8.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000638983  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2775  beta-lactamase  34.08 
 
 
472 aa  113  8.000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.987091 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4688  beta-lactamase  29.12 
 
 
462 aa  113  9e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.331113  normal  0.125502 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  28.18 
 
 
487 aa  113  9e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  26.64 
 
 
477 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  28.13 
 
 
578 aa  112  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0201  beta-lactamase  30.84 
 
 
530 aa  112  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.494145 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2018  penicillin-binding protein  26.55 
 
 
485 aa  111  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.225321  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1311  beta-lactamase  27.18 
 
 
669 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1906  beta-lactamase  26.95 
 
 
369 aa  111  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1896  beta-lactamase  31.02 
 
 
425 aa  111  3e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.227365  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4636  beta-lactamase  30.42 
 
 
496 aa  111  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0683  Beta-lactamase  38.27 
 
 
530 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.564885  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1465  beta-lactamase  31.16 
 
 
657 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.16455  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2262  hypothetical protein  26.9 
 
 
485 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.60427e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2346  hypothetical protein  27.08 
 
 
485 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0051399  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0291  beta-lactamase class C domain-containing protein  36.76 
 
 
519 aa  110  5e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000012653  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2616  beta-lactamase  26.06 
 
 
353 aa  110  6e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2264  hypothetical protein  27.58 
 
 
485 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.145649  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2081  hypothetical protein  26.65 
 
 
485 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.765888  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2235  hypothetical protein  26.65 
 
 
485 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.336147  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0467  beta-lactamase  26.37 
 
 
520 aa  110  8.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  30.92 
 
 
377 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3022  alkaline D-peptidase and alkaline D-peptidase fusion  29.9 
 
 
720 aa  109  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0802631  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1514  beta-lactamase  27.16 
 
 
620 aa  109  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00027695  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>