More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_2172 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_2172  beta-lactamase  100 
 
 
428 aa  867    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.65714  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1830  beta-lactamase  99.77 
 
 
452 aa  867    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.162579  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5607  hypothetical protein  50.4 
 
 
784 aa  354  2e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2615  hypothetical protein  51.23 
 
 
793 aa  345  1e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.377093  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0925  beta-lactamase, putative  49.86 
 
 
790 aa  334  2e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4539  hypothetical protein  50.42 
 
 
796 aa  321  9.999999999999999e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00469106 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4406  hypothetical protein  50.42 
 
 
796 aa  321  9.999999999999999e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.343081  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5870  hypothetical protein  47.3 
 
 
785 aa  318  1e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6218  hypothetical protein  46.34 
 
 
792 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1870  beta-lactamase  48.36 
 
 
390 aa  305  8.000000000000001e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.375615 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1797  beta-lactamase  42.12 
 
 
391 aa  266  5.999999999999999e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0148599  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2047  hypothetical protein  42.86 
 
 
395 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0829987  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0714  beta-lactamase  41.18 
 
 
392 aa  246  4e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1692  beta-lactamase  36.6 
 
 
531 aa  243  5e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.499627  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1364  beta-lactamase  41.5 
 
 
574 aa  242  7e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.185265  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3257  beta-lactamase  39.44 
 
 
430 aa  242  7.999999999999999e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1715  beta-lactamase  36.46 
 
 
528 aa  242  9e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102688  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1761  beta-lactamase  36.46 
 
 
528 aa  242  9e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.775747  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  42.03 
 
 
966 aa  242  1e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2487  beta-lactamase  40.58 
 
 
408 aa  241  1e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0495  beta-lactamase  40.45 
 
 
471 aa  240  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2687  beta-lactamase  39.89 
 
 
381 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000287138 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1529  beta-lactamase  41.64 
 
 
381 aa  233  3e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.303701  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0954  Beta-lactamase  41.74 
 
 
416 aa  231  2e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5895  beta-lactamase  37.86 
 
 
496 aa  231  2e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35970  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  40.55 
 
 
582 aa  229  1e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796833  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1790  beta-lactamase  39.62 
 
 
483 aa  228  1e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0797219 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0627  beta-lactamase  42.9 
 
 
566 aa  226  6e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2255  beta-lactamase  36.84 
 
 
379 aa  225  1e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.234898  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0270  beta-lactamase  40.29 
 
 
717 aa  221  1.9999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2426  beta-lactamase  41.18 
 
 
459 aa  219  7.999999999999999e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00208801  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0660  beta-lactamase  36.77 
 
 
395 aa  218  1e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.775643  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1697  beta-lactamase  37.33 
 
 
381 aa  217  4e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.570462  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1740  beta-lactamase  39.4 
 
 
379 aa  208  2e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1874  beta-lactamase  37.43 
 
 
379 aa  206  5e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00999528 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0439  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidease, putative  37.21 
 
 
381 aa  202  7e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.737656  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2113  beta-lactamase  35.56 
 
 
597 aa  202  9.999999999999999e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.226997 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2585  hypothetical protein  35.37 
 
 
433 aa  200  3e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0477  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidease, putative  36.7 
 
 
385 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.765713  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2716  hypothetical protein  35.11 
 
 
434 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2566  hypothetical protein  35.11 
 
 
434 aa  197  3e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1249  hypothetical protein  35.11 
 
 
434 aa  197  3e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.303061 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0479  beta-lactamase  34.92 
 
 
603 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000533746  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1231  beta-lactamase  34.84 
 
 
434 aa  196  7e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3660  hypothetical protein  34.84 
 
 
434 aa  195  1e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1366  beta-lactamase  39.58 
 
 
591 aa  192  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.416084  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3117  beta-lactamase  40.95 
 
 
361 aa  188  1e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.577011  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2711  hypothetical protein  35.11 
 
 
432 aa  188  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.27035  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2671  hypothetical protein  34.84 
 
 
432 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2844  hypothetical protein  34.84 
 
 
432 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2622  hypothetical protein  34.84 
 
 
432 aa  187  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4206  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.53 
 
 
1018 aa  187  3e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2737  hypothetical protein  34.84 
 
 
432 aa  186  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0839  beta-lactamase  32.98 
 
 
1012 aa  186  7e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2616  beta-lactamase  38.72 
 
 
366 aa  183  4.0000000000000006e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.763267 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2604  beta-lactamase  39.58 
 
 
354 aa  182  1e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.928872  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0301  beta-lactamase  37.65 
 
 
351 aa  179  7e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4196  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.6 
 
 
1002 aa  177  4e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.690171 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2362  beta-lactamase  38.72 
 
 
357 aa  176  5e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4160  hypothetical protein  37.12 
 
 
818 aa  176  8e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000766166  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5392  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.74 
 
 
953 aa  173  5e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1439  hypothetical protein  31.35 
 
 
1007 aa  172  9e-42  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00938781 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1543  beta-lactamase  31.1 
 
 
651 aa  172  1e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0383  Beta-lactamase class C related penicillin binding protein  38.18 
 
 
337 aa  170  4e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11048  putative hydrolase/beta lactamase fusion protein  30.77 
 
 
971 aa  169  8e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.199531  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1664  beta-lactamase  37.61 
 
 
348 aa  168  1e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.15284 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1850  Beta-lactamase class C or other penicillin binding protein  35.38 
 
 
338 aa  167  2.9999999999999998e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000532294  hitchhiker  0.000116253 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0591  beta-lactamase  34.12 
 
 
360 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000780172  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1238  beta-lactamase  36.68 
 
 
361 aa  164  3e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0242548 
 
 
-
 
NC_002950  PG0011  glycosy hydrolase family protein  31.36 
 
 
1003 aa  160  3e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.417282 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5693  beta-lactamase  37.31 
 
 
415 aa  160  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.21234  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0013  b-glucosidase  30.97 
 
 
990 aa  159  7e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0471  beta-lactamase  34.64 
 
 
336 aa  158  2e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4515  beta-lactamase  38.66 
 
 
369 aa  157  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.942067 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1201  beta-lactamase  31.02 
 
 
665 aa  154  4e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4819  glycoside hydrolase family 3 protein  29.32 
 
 
997 aa  150  6e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2708  beta-lactamase  28.91 
 
 
992 aa  149  7e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3459  beta-lactamase  34.69 
 
 
394 aa  149  7e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0213623 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2334  hypothetical protein  32.95 
 
 
318 aa  148  1.0000000000000001e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000883594  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2095  hypothetical protein  29.63 
 
 
484 aa  147  3e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.187143  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0444  beta-lactamase  32.42 
 
 
339 aa  147  4.0000000000000006e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1251  Beta-lactamase class C related penicillin binding protein  33.05 
 
 
377 aa  147  4.0000000000000006e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000000000135632  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0579  beta-lactamase  32.28 
 
 
395 aa  146  9e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.521189  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1713  beta-lactamase  33.24 
 
 
347 aa  142  8e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2194  beta-lactamase  32.76 
 
 
334 aa  140  3.9999999999999997e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.724545  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4807  beta-lactamase  27.94 
 
 
434 aa  140  3.9999999999999997e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0814  beta-lactamase  34.49 
 
 
422 aa  137  5e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0590  beta-lactamase  34.47 
 
 
452 aa  133  5e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0253  beta-lactamase  29.71 
 
 
395 aa  133  6e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0538  beta-lactamase  31.17 
 
 
433 aa  132  9e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3205  beta-lactamase  31.5 
 
 
407 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5348  beta-lactamase  30.48 
 
 
414 aa  130  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.635001  normal  0.0848814 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6918  putative penicillin binding protein  30.73 
 
 
422 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.457647 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0463  beta-lactamase  30.79 
 
 
395 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0456  beta-lactamase  31.93 
 
 
395 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1881  beta-lactamase  32.31 
 
 
613 aa  130  7.000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.234575  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0812  beta-lactamase  28.82 
 
 
408 aa  129  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.623448  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5391  putative beta-lactamase  31.73 
 
 
414 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6088  beta-lactamase  29.63 
 
 
406 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.496561  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0011  beta-lactamase  29.13 
 
 
427 aa  128  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000120746  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>