More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5243 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  100 
 
 		 362 aa  752    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  44.65 
 
 		 356 aa  273  3e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0939  beta-lactamase  40.18 
 
 		 338 aa  244  9.999999999999999e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.18746 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4280  beta-lactamase  38.46 
 
 		 330 aa  236  6e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1520  Beta-lactamase  35.54 
 
 		 537 aa  193  3e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000638983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5443  putative beta-lactamase  35.67 
 
 		 364 aa  192  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.65256  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  33.16 
 
 		 487 aa  189  5.999999999999999e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3688  beta-lactamase  33.52 
 
 		 543 aa  183  3e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497517  normal  0.011807 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2177  beta-lactamase  33.52 
 
 		 543 aa  183  3e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.816506 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  32.88 
 
 		 578 aa  179  5.999999999999999e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  34.23 
 
 		 559 aa  171  1e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1936  beta-lactamase  33.05 
 
 		 848 aa  165  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.178754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  36.72 
 
 		 442 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  30.89 
 
 		 477 aa  162  7e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3175  beta-lactamase  33.87 
 
 		 351 aa  162  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0119788  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2198  beta-lactamase  31.74 
 
 		 543 aa  160  4e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.176904  normal  0.0317754 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3512  beta-lactamase  32.78 
 
 		 364 aa  157  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2638  beta-lactamase  35.08 
 
 		 445 aa  156  6e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.79 
 
 		 392 aa  150  4e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11951  lipoprotein  36.88 
 
 		 371 aa  149  6e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5985  beta-lactamase  30.61 
 
 		 342 aa  145  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1832  beta-lactamase  30.11 
 
 		 446 aa  144  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.29245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  28.57 
 
 		 446 aa  144  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2968  beta-lactamase  30.89 
 
 		 462 aa  142  8e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1457  beta-lactamase  31.96 
 
 		 325 aa  141  9.999999999999999e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.17461  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5150  beta-lactamase  29.38 
 
 		 369 aa  142  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.654906 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2468  beta-lactamase  27.9 
 
 		 498 aa  140  3e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00176956  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3751  beta-lactamase  31.52 
 
 		 395 aa  140  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000498352 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2516  beta-lactamase  27.9 
 
 		 498 aa  140  3e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000422279  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0419  beta-lactamase  32.82 
 
 		 416 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2717  beta-lactamase  30.53 
 
 		 470 aa  140  3.9999999999999997e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6206  beta-lactamase  32.35 
 
 		 321 aa  139  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.324563 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4346  Beta-lactamase  30.57 
 
 		 547 aa  137  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5264  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  30.03 
 
 		 493 aa  138  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.0797924 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2294  penicillin-binding protein, putative  29.47 
 
 		 434 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.272122  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0416  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  32.04 
 
 		 421 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0430511  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0505  putative penicillin-binding protein  32.91 
 
 		 415 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0859162  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3274  beta-lactamase  30.4 
 
 		 524 aa  136  7.000000000000001e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.847415 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2573  beta-lactamase  29.62 
 
 		 476 aa  135  9e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.369136  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0473  penicillin-binding protein  31.74 
 
 		 421 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0483  putative penicillin-binding protein  31.74 
 
 		 412 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0502  penicillin-binding protein  31.74 
 
 		 412 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0412  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  32.58 
 
 		 422 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5119  beta-lactamase  29.81 
 
 		 402 aa  135  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4818  putative penicillin-binding protein  32.58 
 
 		 416 aa  134  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.618322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1906  beta-lactamase  28.9 
 
 		 369 aa  134  3e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0558  putative penicillin-binding protein  32.47 
 
 		 413 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.622752  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3422  beta-lactamase  29.82 
 
 		 593 aa  132  9e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.126074  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4671  alkaline D-peptidase, putative  30.16 
 
 		 330 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.126225  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2793  beta-lactamase  42.51 
 
 		 510 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.879811  normal  0.340954 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3731  beta-lactamase  29.22 
 
 		 603 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.227339 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0555  penicillin-binding protein, putative  32.26 
 
 		 413 aa  130  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.389605  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1357  beta-lactamase  26.83 
 
 		 378 aa  130  3e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4213  beta-lactamase  29 
 
 		 403 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.161495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3615  beta-lactamase  29.08 
 
 		 611 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0663146 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2573  fmtA-like protein, putative  28.74 
 
 		 482 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00911316  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  28.57 
 
 		 377 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0863  beta-lactamase  28.96 
 
 		 363 aa  129  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  26.63 
 
 		 505 aa  128  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3498  beta-lactamase  29.84 
 
 		 375 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0154  beta-lactamase  28.44 
 
 		 482 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4919  beta-lactamase  30.28 
 
 		 415 aa  127  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.318437  normal  0.850487 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0428  beta-lactamase  33.11 
 
 		 404 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.354595  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2415  beta-lactamase  28.7 
 
 		 442 aa  126  5e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0834226  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3294  penicillin-binding protein  29.02 
 
 		 377 aa  126  6e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.678008  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3554  penicillin-binding protein  29.02 
 
 		 377 aa  126  6e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3511  putative penicillin-binding protein  29.02 
 
 		 377 aa  126  6e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3264  beta-lactamase  28.8 
 
 		 377 aa  124  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.664291  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3208  beta-lactamase  28.71 
 
 		 377 aa  124  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0230735  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1164  beta-lactamase  29.27 
 
 		 501 aa  125  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1750  beta-lactamase  29.52 
 
 		 375 aa  125  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.339251  normal  0.99151 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0934  beta-lactamase  27.69 
 
 		 475 aa  123  4e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000419238  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3210  beta-lactamase  29.1 
 
 		 375 aa  123  5e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.767379  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2742  beta-lactamase  29.56 
 
 		 376 aa  123  5e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0750006  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0467  beta-lactamase  28.21 
 
 		 520 aa  122  7e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2650  beta-lactamase  28.89 
 
 		 497 aa  122  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0361544  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1086  beta-lactamase  28.93 
 
 		 378 aa  120  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3247  beta-lactamase  28.61 
 
 		 513 aa  120  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3507  penicillin-binding protein, putative  28.71 
 
 		 375 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1777  beta-lactamase  34.17 
 
 		 343 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00484911  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4152  beta-lactamase  28.93 
 
 		 378 aa  119  6e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0848463  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0831  beta-lactamase  27.25 
 
 		 422 aa  119  6e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3518  putative penicillin-binding protein  28.71 
 
 		 377 aa  119  6e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2778  beta-lactamase  28.44 
 
 		 380 aa  119  7.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.701087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2587  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  26.85 
 
 		 413 aa  119  9e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.607083  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1671  beta-lactamase  28.78 
 
 		 633 aa  118  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4110  beta-lactamase  28.62 
 
 		 379 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2357  beta-lactamase  26.42 
 
 		 381 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1439  Beta-lactamase  30.48 
 
 		 330 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0862025  normal  0.346233 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4174  beta-lactamase  28.62 
 
 		 378 aa  117  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000652338  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2539  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.09 
 
 		 445 aa  117  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0116  beta-lactamase  28.45 
 
 		 453 aa  117  3.9999999999999997e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1783  cyclic peptide transporter  26.92 
 
 		 1055 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0343  beta-lactamase  28.66 
 
 		 482 aa  116  5e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3872  beta-lactamase  27.99 
 
 		 375 aa  116  6e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2668  penicillin-binding protein  27.61 
 
 		 348 aa  116  6e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162016 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2539  beta-lactamase  28.49 
 
 		 567 aa  116  6e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.470437  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2987  beta-lactamase  29.3 
 
 		 526 aa  116  6e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.204407  normal  0.639877 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0159  beta-lactamase  24.48 
 
 		 410 aa  116  6e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2433  penicillin-binding protein  27.61 
 
 		 340 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0197006  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>