More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4788 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4788  beta-lactamase  100 
 
 		 400 aa  833    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.416977  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3751  beta-lactamase  42.12 
 
 		 395 aa  263  4.999999999999999e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000498352 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0159  beta-lactamase  33.77 
 
 		 410 aa  193  4e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4213  beta-lactamase  32.58 
 
 		 403 aa  186  4e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.161495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4919  beta-lactamase  32.74 
 
 		 415 aa  182  1e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.318437  normal  0.850487 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.57 
 
 		 442 aa  138  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  29.21 
 
 		 356 aa  135  1.9999999999999998e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1936  beta-lactamase  29.93 
 
 		 848 aa  133  3.9999999999999996e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.178754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0831  beta-lactamase  29.97 
 
 		 422 aa  130  6e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146809  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2294  penicillin-binding protein, putative  32.13 
 
 		 434 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.272122  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1031  beta-lactamase  30.6 
 
 		 358 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2793  beta-lactamase  28.24 
 
 		 510 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.879811  normal  0.340954 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2638  beta-lactamase  27.75 
 
 		 445 aa  125  9e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27.18 
 
 		 392 aa  124  4e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3615  beta-lactamase  30.36 
 
 		 611 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0663146 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3512  beta-lactamase  28.62 
 
 		 364 aa  121  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2357  beta-lactamase  27.44 
 
 		 381 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  29.91 
 
 		 446 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  30.16 
 
 		 559 aa  115  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  28.71 
 
 		 477 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3422  beta-lactamase  29.07 
 
 		 593 aa  113  5e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.126074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  29.32 
 
 		 487 aa  113  7.000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5443  putative beta-lactamase  30.42 
 
 		 364 aa  112  8.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.65256  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  27.99 
 
 		 362 aa  112  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0939  beta-lactamase  28 
 
 		 338 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.18746 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1839  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  25.71 
 
 		 681 aa  111  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000051234  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1357  beta-lactamase  27.71 
 
 		 378 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1906  beta-lactamase  27.95 
 
 		 369 aa  110  6e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3731  beta-lactamase  28.71 
 
 		 603 aa  109  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.227339 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2469  penicillin-binding protein  30.16 
 
 		 340 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.242822  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2650  penicillin-binding protein  30.16 
 
 		 340 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4280  beta-lactamase  26.56 
 
 		 330 aa  108  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2433  penicillin-binding protein  30.16 
 
 		 340 aa  107  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0197006  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2668  penicillin-binding protein  30.16 
 
 		 348 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162016 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1832  beta-lactamase  28.53 
 
 		 446 aa  106  7e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.29245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  29.66 
 
 		 578 aa  106  7e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2177  beta-lactamase  27.57 
 
 		 543 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.816506 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3688  beta-lactamase  27.57 
 
 		 543 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497517  normal  0.011807 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2394  penicillin-binding protein  30.16 
 
 		 340 aa  105  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.70958  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0863  beta-lactamase  27.07 
 
 		 363 aa  104  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0291  beta-lactamase class C domain-containing protein  30.13 
 
 		 519 aa  105  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000012653  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5150  beta-lactamase  25.53 
 
 		 369 aa  105  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.654906 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3032  beta-lactamase  35.75 
 
 		 507 aa  105  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.436003 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4346  Beta-lactamase  28.2 
 
 		 547 aa  103  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3391  beta-lactamase  29.5 
 
 		 420 aa  103  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1520  Beta-lactamase  27.99 
 
 		 537 aa  102  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000638983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5985  beta-lactamase  29.8 
 
 		 342 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09928  putative non-ribosomal peptide synthetase  27.48 
 
 		 483 aa  101  2e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.206304  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0368  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  25.6 
 
 		 399 aa  102  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00562308  normal  0.495103 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5715  beta-lactamase  26.97 
 
 		 437 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4257  beta-lactamase  27.13 
 
 		 464 aa  100  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3468  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.87 
 
 		 415 aa  100  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.560934  normal  0.0158413 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6092  beta-lactamase  27.21 
 
 		 419 aa  100  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.152854 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1905  beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins  27.91 
 
 		 389 aa  100  5e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.0068252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1457  beta-lactamase  27.07 
 
 		 325 aa  100  6e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.17461  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2579  penicillin-binding protein, putative  25.97 
 
 		 483 aa  99.8  8e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0220569  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6205  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  25.84 
 
 		 378 aa  99.8  8e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0416  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  27.33 
 
 		 421 aa  99.8  8e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0430511  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2573  beta-lactamase  27.36 
 
 		 476 aa  99.8  8e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.369136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11951  lipoprotein  27.58 
 
 		 371 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0483  putative penicillin-binding protein  26.4 
 
 		 412 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5013  alkaline D-peptidase  29.19 
 
 		 374 aa  98.2  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394865  normal  0.0638413 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0473  penicillin-binding protein  27 
 
 		 421 aa  97.4  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0412  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  27.36 
 
 		 422 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0502  penicillin-binding protein  26.67 
 
 		 412 aa  97.4  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13238  penicillin-binding protein, putative  30.16 
 
 		 431 aa  97.8  3e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.652866  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0505  putative penicillin-binding protein  26.4 
 
 		 415 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0859162  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1777  beta-lactamase  29.24 
 
 		 343 aa  97.1  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00484911  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5714  beta-lactamase  25.25 
 
 		 446 aa  97.4  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3022  alkaline D-peptidase and alkaline D-peptidase fusion  27.67 
 
 		 720 aa  97.1  5e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0802631  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4818  putative penicillin-binding protein  27.97 
 
 		 416 aa  96.7  6e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.618322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1094  beta-lactamase  29.21 
 
 		 349 aa  96.3  8e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3117  beta-lactamase  28.48 
 
 		 361 aa  96.3  8e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.577011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0098  beta-lactamase  31.72 
 
 		 691 aa  96.3  9e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1013  beta-lactamase  29.39 
 
 		 449 aa  96.3  9e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2632  penicillin-binding protein  28.12 
 
 		 341 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.149759  decreased coverage  0.000000240236 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0343  beta-lactamase  25.53 
 
 		 482 aa  95.5  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3177  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  23.84 
 
 		 484 aa  95.5  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.075148  normal  0.866618 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2717  beta-lactamase  24.54 
 
 		 470 aa  95.9  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2921  beta-lactamase class C-like protein  27.46 
 
 		 451 aa  95.9  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.154271 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1955  beta-lactamase  31.84 
 
 		 694 aa  95.5  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.1377  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2989  penicillin-binding protein  27.6 
 
 		 691 aa  94.7  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8721  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  28.79 
 
 		 480 aa  94.7  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3214  penicillin-binding protein  27.6 
 
 		 691 aa  94.7  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38843  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3352  beta-lactamase  26.22 
 
 		 416 aa  94.4  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.237036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2650  beta-lactamase  29.9 
 
 		 497 aa  94.4  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0361544  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2679  penicillin-binding protein  28.43 
 
 		 341 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2721  penicillin-binding protein  30.43 
 
 		 340 aa  94  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0897232  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0555  penicillin-binding protein, putative  26.69 
 
 		 413 aa  94.4  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.389605  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37770  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  26.48 
 
 		 366 aa  94.4  4e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.269534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2060  beta-lactamase  26.39 
 
 		 485 aa  94  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.258254  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1788  beta-lactamase  22.95 
 
 		 560 aa  93.6  6e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.358741  normal  0.761746 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3175  beta-lactamase  27.6 
 
 		 351 aa  93.2  7e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0119788  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2916  penicillin-binding protein  26.84 
 
 		 691 aa  93.2  7e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5338  beta-lactamase  32.2 
 
 		 525 aa  93.2  8e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.271651  normal  0.211898 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3061  beta-lactamase  28.84 
 
 		 351 aa  92.8  9e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.502148  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2353  penicillin-binding protein  25.22 
 
 		 481 aa  92  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000218323  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5618  beta-lactamase  27 
 
 		 456 aa  92.8  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357665  normal  0.013094 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1119  hypothetical protein  29.47 
 
 		 371 aa  92.4  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2043  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27.15 
 
 		 421 aa  92.4  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.956781  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>