More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11951 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_11951  lipoprotein  100 
 
 		 371 aa  755    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1520  Beta-lactamase  35.42 
 
 		 537 aa  183  5.0000000000000004e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000638983  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3175  beta-lactamase  33.93 
 
 		 351 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0119788  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  36.3 
 
 		 559 aa  173  3.9999999999999995e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2177  beta-lactamase  33.64 
 
 		 543 aa  168  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.816506 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3688  beta-lactamase  33.64 
 
 		 543 aa  168  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497517  normal  0.011807 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4671  alkaline D-peptidase, putative  31.88 
 
 		 330 aa  161  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.126225  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1439  Beta-lactamase  31.79 
 
 		 330 aa  162  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0862025  normal  0.346233 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  35.37 
 
 		 356 aa  156  4e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  36.88 
 
 		 362 aa  153  4e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  29.35 
 
 		 477 aa  141  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5264  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  33.02 
 
 		 493 aa  139  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.0797924 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5119  beta-lactamase  29.38 
 
 		 402 aa  139  7.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2198  beta-lactamase  29.87 
 
 		 543 aa  134  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.176904  normal  0.0317754 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5443  putative beta-lactamase  34.98 
 
 		 364 aa  130  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.65256  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1936  beta-lactamase  29.73 
 
 		 848 aa  128  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.178754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1906  beta-lactamase  32.44 
 
 		 369 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4280  beta-lactamase  30.7 
 
 		 330 aa  128  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0939  beta-lactamase  31.63 
 
 		 338 aa  128  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.18746 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0368  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  33.63 
 
 		 399 aa  125  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00562308  normal  0.495103 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4346  Beta-lactamase  32.34 
 
 		 547 aa  124  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3751  beta-lactamase  28.66 
 
 		 395 aa  124  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000498352 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2717  beta-lactamase  31.7 
 
 		 470 aa  122  9e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0275  beta-lactamase  31.71 
 
 		 400 aa  121  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.35061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4919  beta-lactamase  26.74 
 
 		 415 aa  120  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.318437  normal  0.850487 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0863  beta-lactamase  33.57 
 
 		 363 aa  118  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4213  beta-lactamase  25.84 
 
 		 403 aa  118  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.161495  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2556  beta-lactamase  33.96 
 
 		 328 aa  119  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.400267 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  26.89 
 
 		 505 aa  118  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2573  beta-lactamase  32.76 
 
 		 476 aa  117  3.9999999999999997e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.369136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  28.73 
 
 		 578 aa  116  6e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1923  beta-lactamase  37.5 
 
 		 389 aa  116  6.9999999999999995e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2996  beta-lactamase  36.13 
 
 		 479 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.168493 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5167  beta-lactamase  32.04 
 
 		 713 aa  112  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.619685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3702  beta-lactamase  29.17 
 
 		 430 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  30.29 
 
 		 487 aa  111  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1457  beta-lactamase  26.97 
 
 		 325 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.17461  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2736  beta-lactamase  29.02 
 
 		 417 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.416885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4636  beta-lactamase  31.3 
 
 		 496 aa  110  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4350  Beta-lactamase  35.42 
 
 		 553 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3512  beta-lactamase  35.26 
 
 		 364 aa  110  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0159  beta-lactamase  26.24 
 
 		 410 aa  110  5e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.59 
 
 		 442 aa  110  5e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8711  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  31.49 
 
 		 383 aa  109  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0541056  normal  0.0995944 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3027  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.65 
 
 		 406 aa  109  8.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.899556  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2638  beta-lactamase  31.19 
 
 		 445 aa  108  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2587  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.83 
 
 		 413 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.607083  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2968  beta-lactamase  36.9 
 
 		 462 aa  108  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1798  beta-lactamase  29.75 
 
 		 426 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.491739  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3984  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.77 
 
 		 390 aa  108  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5985  beta-lactamase  26.61 
 
 		 342 aa  107  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5173  putative beta lactamase family protein  39.66 
 
 		 462 aa  107  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.694377  normal  0.230482 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3422  beta-lactamase  30.27 
 
 		 593 aa  107  4e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.126074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3731  beta-lactamase  31.21 
 
 		 603 aa  106  5e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.227339 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1839  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  32.22 
 
 		 681 aa  106  6e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000051234  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4788  beta-lactamase  27.64 
 
 		 400 aa  106  8e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.416977  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1762  beta-lactamase  30.13 
 
 		 431 aa  106  8e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178293  normal  0.700473 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1134  beta-lactamase  31.68 
 
 		 459 aa  106  8e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2080  beta-lactamase  31.14 
 
 		 370 aa  105  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.16247  normal  0.44675 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2478  alkaline D-peptidase  28.88 
 
 		 388 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.431844  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3817  beta-lactamase  28.72 
 
 		 364 aa  105  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2793  beta-lactamase  37.2 
 
 		 510 aa  105  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.879811  normal  0.340954 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  35.76 
 
 		 446 aa  105  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2661  alkaline d-peptidase  28.88 
 
 		 388 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3615  beta-lactamase  38.65 
 
 		 611 aa  105  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0663146 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2440  alkaline D-peptidase (D-stereospecific peptide hydrolase)  28.57 
 
 		 388 aa  105  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00540718  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2409  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  28.57 
 
 		 388 aa  104  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.37701  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4697  beta-lactamase  30.77 
 
 		 345 aa  104  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.168974  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2677  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  28.57 
 
 		 388 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000522854 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1832  beta-lactamase  33.47 
 
 		 446 aa  104  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.29245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0570  alkaline D-peptidase  29.61 
 
 		 370 aa  104  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4191  beta-lactamase  27.58 
 
 		 386 aa  103  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.249358 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10404  lipoprotein lpqK  28.9 
 
 		 409 aa  103  3e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1357  beta-lactamase  30.08 
 
 		 378 aa  103  4e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2768  beta-lactamase  23.84 
 
 		 483 aa  103  4e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3069  alkaline D-peptidase  28.57 
 
 		 388 aa  103  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0417304  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2217  alkaline D-peptidase  30.61 
 
 		 388 aa  103  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.66047e-16 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4689  beta-lactamase  29.29 
 
 		 374 aa  103  6e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0791767  normal  0.116144 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2755  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  28.31 
 
 		 388 aa  103  7e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0494186  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3030  alkaline D-peptidase  30.61 
 
 		 388 aa  102  7e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0278  beta-lactamase  31.8 
 
 		 406 aa  102  9e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3206  beta-lactamase  27.25 
 
 		 389 aa  102  9e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3689  beta-lactamase  28.78 
 
 		 422 aa  102  9e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2824  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.57 
 
 		 388 aa  102  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.130693  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6205  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.26 
 
 		 378 aa  102  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1969  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.49 
 
 		 414 aa  102  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.980127  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2819  alkaline D-peptidase  28.45 
 
 		 388 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118082  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2769  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  28.45 
 
 		 389 aa  101  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.48212  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  37.5 
 
 		 377 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3033  alkaline d-peptidase  28.45 
 
 		 388 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.400662  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8721  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  34.21 
 
 		 480 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1364  beta-lactamase  35.19 
 
 		 574 aa  101  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.185265  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2778  beta-lactamase  28.4 
 
 		 380 aa  101  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.701087  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2573  fmtA-like protein, putative  28.14 
 
 		 482 aa  100  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00911316  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0934  beta-lactamase  28.1 
 
 		 475 aa  100  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000419238  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2525  beta-lactamase  33.33 
 
 		 377 aa  100  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2426  beta-lactamase  32.93 
 
 		 459 aa  100  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00208801  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2921  beta-lactamase class C-like protein  28.29 
 
 		 451 aa  100  3e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.154271 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1164  beta-lactamase  29.44 
 
 		 501 aa  100  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2315  beta-lactamase  29.43 
 
 		 440 aa  101  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00477679  hitchhiker  0.0000358597 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>