More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2996 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2996  beta-lactamase  100 
 
 		 479 aa  957    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.168493 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1357  beta-lactamase  35.69 
 
 		 378 aa  176  9e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0999  beta-lactamase  31.27 
 
 		 367 aa  147  5e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0117018 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0603  beta-lactamase  33.97 
 
 		 409 aa  126  7e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.875784  normal  0.055059 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  29.97 
 
 		 595 aa  125  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  32.33 
 
 		 601 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  33.22 
 
 		 356 aa  114  4.0000000000000004e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0570  alkaline D-peptidase  30.62 
 
 		 370 aa  114  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  25.58 
 
 		 487 aa  112  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2573  fmtA-like protein, putative  25.77 
 
 		 482 aa  111  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00911316  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0154  beta-lactamase  25.49 
 
 		 482 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11951  lipoprotein  36.13 
 
 		 371 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2177  beta-lactamase  24.73 
 
 		 543 aa  110  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.816506 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3688  beta-lactamase  24.73 
 
 		 543 aa  110  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497517  normal  0.011807 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0294  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  26.69 
 
 		 834 aa  110  7.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00108534  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  25.87 
 
 		 559 aa  109  9.000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5167  beta-lactamase  29.91 
 
 		 713 aa  109  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.619685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3512  beta-lactamase  26.56 
 
 		 364 aa  108  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  29.03 
 
 		 377 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0939  beta-lactamase  30.35 
 
 		 338 aa  107  4e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.18746 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0727  alkaline D-peptidase  30.82 
 
 		 429 aa  106  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0934  beta-lactamase  26.33 
 
 		 475 aa  106  9e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000419238  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8721  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  30.4 
 
 		 480 aa  106  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  25.31 
 
 		 578 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2353  penicillin-binding protein  25.15 
 
 		 481 aa  105  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000218323  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1946  Beta-lactamase  27.97 
 
 		 588 aa  105  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3986  hypothetical protein  33.8 
 
 		 369 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.82683 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0831  beta-lactamase  26.13 
 
 		 422 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2768  beta-lactamase  24.81 
 
 		 483 aa  104  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2629  putative penicillin-binding protein  25.37 
 
 		 490 aa  105  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0110315  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1969  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  31.64 
 
 		 414 aa  104  4e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.980127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2389  cyclic peptide transporter  27.03 
 
 		 1032 aa  104  4e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4697  beta-lactamase  24.18 
 
 		 345 aa  103  6e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.168974  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2544  putative penicillin-binding protein  24.85 
 
 		 483 aa  103  7e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2573  beta-lactamase  32.67 
 
 		 476 aa  103  7e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.369136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3391  beta-lactamase  28.27 
 
 		 420 aa  103  7e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2400  penicillin-binding protein  24.56 
 
 		 481 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443561  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0368  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.83 
 
 		 399 aa  102  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00562308  normal  0.495103 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2575  penicillin-binding protein  24.56 
 
 		 481 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2316  penicillin-binding protein  24.85 
 
 		 481 aa  102  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181197  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2579  penicillin-binding protein, putative  24.78 
 
 		 483 aa  101  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0220569  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5985  beta-lactamase  27.53 
 
 		 342 aa  101  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  26.76 
 
 		 392 aa  101  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0059  beta-lactamase  23.35 
 
 		 383 aa  101  3e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0476107  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2587  putative penicillin-binding protein  24.78 
 
 		 463 aa  101  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35213e-17 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2616  beta-lactamase  25.3 
 
 		 353 aa  100  6e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0759  putative beta-lactamase class C penicillin binding protein  32.41 
 
 		 498 aa  100  6e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445171  normal  0.118882 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  23.99 
 
 		 477 aa  100  8e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2525  beta-lactamase  26.98 
 
 		 377 aa  99.8  9e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1263  beta-lactamase  34.94 
 
 		 375 aa  99.8  9e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0172767 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2036  putative penicillin-binding protein  28.52 
 
 		 691 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1936  beta-lactamase  26.76 
 
 		 848 aa  99.8  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.178754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0098  beta-lactamase  29.91 
 
 		 691 aa  99.8  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0099  D-stereospecific peptide hydrolase  27.02 
 
 		 443 aa  99  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000129924  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4636  beta-lactamase  28.61 
 
 		 496 aa  99.4  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3205  putative penicillin-binding protein  26.53 
 
 		 694 aa  99.8  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2194  beta-lactamase  33.46 
 
 		 334 aa  99  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.724545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4213  beta-lactamase  25.52 
 
 		 403 aa  99  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.161495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3223  putative penicillin-binding protein  28.17 
 
 		 691 aa  97.8  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3206  beta-lactamase  26.67 
 
 		 389 aa  97.8  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3018  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  26.73 
 
 		 389 aa  97.8  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.470862  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1018  beta-lactamase  30.86 
 
 		 461 aa  97.4  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.624623 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2357  beta-lactamase  23.95 
 
 		 381 aa  97.4  5e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2727  beta-lactamase  26.47 
 
 		 486 aa  97.1  7e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2991  beta-lactamase  34.87 
 
 		 475 aa  96.7  8e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3027  alkaline D-peptidase  26.55 
 
 		 388 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4671  alkaline D-peptidase, putative  29.13 
 
 		 330 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.126225  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2819  alkaline D-peptidase  26.55 
 
 		 388 aa  95.9  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118082  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2989  penicillin-binding protein  27.82 
 
 		 691 aa  95.9  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2916  penicillin-binding protein  27.82 
 
 		 691 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3033  alkaline d-peptidase  26.55 
 
 		 388 aa  95.9  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.400662  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3214  penicillin-binding protein  27.82 
 
 		 691 aa  95.9  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38843  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3817  beta-lactamase  24.92 
 
 		 364 aa  95.9  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3069  alkaline D-peptidase  26.9 
 
 		 388 aa  95.9  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0417304  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2769  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  26.55 
 
 		 389 aa  95.9  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.48212  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2409  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  24.76 
 
 		 388 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.37701  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1818  beta-lactamase  30.39 
 
 		 513 aa  95.1  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2553  beta-lactamase  28.47 
 
 		 478 aa  95.1  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1164  beta-lactamase  26.87 
 
 		 501 aa  95.1  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2778  beta-lactamase  29.87 
 
 		 380 aa  95.5  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.701087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1923  beta-lactamase  32.71 
 
 		 389 aa  94.7  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4591  beta-lactamase  26.12 
 
 		 675 aa  94.7  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.434255  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4308  beta-lactamase  35.86 
 
 		 459 aa  94.7  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0244726  normal  0.721784 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3352  beta-lactamase  28 
 
 		 416 aa  94.7  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.237036  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  28.37 
 
 		 505 aa  94.4  4e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0973  beta-lactamase  27.18 
 
 		 514 aa  94  5e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3064  alkaline D-peptidase  26.9 
 
 		 388 aa  93.6  7e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0312865  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0116  beta-lactamase  26.82 
 
 		 453 aa  93.2  8e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37770  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  28.03 
 
 		 366 aa  93.6  8e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.269534  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2755  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  26.25 
 
 		 388 aa  93.2  9e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0494186  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4280  beta-lactamase  27.39 
 
 		 330 aa  93.2  9e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4257  beta-lactamase  30.15 
 
 		 464 aa  92.8  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0772  beta-lactamase  34.91 
 
 		 431 aa  92.8  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4406  hypothetical protein  29.92 
 
 		 796 aa  92.8  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.343081  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4539  hypothetical protein  29.92 
 
 		 796 aa  92.8  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00469106 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0291  beta-lactamase class C domain-containing protein  26.25 
 
 		 519 aa  92.8  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000012653  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2921  beta-lactamase class C-like protein  21.89 
 
 		 451 aa  92.8  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.154271 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2824  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27.14 
 
 		 388 aa  92  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.130693  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3751  beta-lactamase  23.48 
 
 		 395 aa  91.7  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000498352 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2384  beta-lactamase  24.55 
 
 		 483 aa  92  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>