More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2968 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_2968  beta-lactamase  100 
 
 
462 aa  951    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5985  beta-lactamase  36.18 
 
 
342 aa  209  7e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  30.18 
 
 
477 aa  192  1e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  34.66 
 
 
377 aa  179  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  31.92 
 
 
559 aa  171  2e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1520  Beta-lactamase  34.52 
 
 
537 aa  164  3e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000638983  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2198  beta-lactamase  31.67 
 
 
543 aa  161  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.176904  normal  0.0317754 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  31.91 
 
 
442 aa  152  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2638  beta-lactamase  31.51 
 
 
445 aa  151  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3688  beta-lactamase  30.99 
 
 
543 aa  151  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497517  normal  0.011807 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2177  beta-lactamase  30.99 
 
 
543 aa  151  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.816506 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  33.13 
 
 
356 aa  148  3e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  28.82 
 
 
578 aa  146  9e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  30.89 
 
 
362 aa  142  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0939  beta-lactamase  30.89 
 
 
338 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.18746 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3512  beta-lactamase  33.23 
 
 
364 aa  141  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4636  beta-lactamase  29.03 
 
 
496 aa  139  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  27.59 
 
 
446 aa  138  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4159  beta-lactamase  27.86 
 
 
544 aa  134  3e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0453527  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4280  beta-lactamase  31.19 
 
 
330 aa  134  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0863  beta-lactamase  28.61 
 
 
363 aa  133  6.999999999999999e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5119  beta-lactamase  30.69 
 
 
402 aa  133  6.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2717  beta-lactamase  27.57 
 
 
470 aa  132  9e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0999  beta-lactamase  27.57 
 
 
367 aa  130  6e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0117018 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  28 
 
 
487 aa  129  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3175  beta-lactamase  28.9 
 
 
351 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0119788  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1357  beta-lactamase  26.76 
 
 
378 aa  125  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2768  beta-lactamase  26.85 
 
 
483 aa  125  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1936  beta-lactamase  29.83 
 
 
848 aa  125  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.178754  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3817  beta-lactamase  30.12 
 
 
364 aa  125  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5264  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  30.33 
 
 
493 aa  124  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.0797924 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5443  putative beta-lactamase  29.62 
 
 
364 aa  123  8e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.65256  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2736  beta-lactamase  29.15 
 
 
417 aa  121  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.416885  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1906  beta-lactamase  25.49 
 
 
369 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6206  beta-lactamase  30.17 
 
 
321 aa  119  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.324563 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0558  putative penicillin-binding protein  27.68 
 
 
413 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.622752  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0419  beta-lactamase  27.6 
 
 
416 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0467  beta-lactamase  26.95 
 
 
520 aa  118  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5150  beta-lactamase  29 
 
 
369 aa  118  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.654906 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0473  penicillin-binding protein  27.38 
 
 
421 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0412  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  27.38 
 
 
422 aa  118  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0502  penicillin-binding protein  27.38 
 
 
412 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1234  beta-lactamase  23.89 
 
 
519 aa  117  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565811  normal  0.301621 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0416  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  27.38 
 
 
421 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0430511  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04833  beta-lactamase  24.04 
 
 
529 aa  117  3.9999999999999997e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0483  putative penicillin-binding protein  27.38 
 
 
412 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  25.87 
 
 
392 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0505  putative penicillin-binding protein  27.08 
 
 
415 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0859162  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3742  beta-lactamase  24.71 
 
 
478 aa  116  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.877046  normal  0.0540026 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2987  beta-lactamase  27.06 
 
 
526 aa  115  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.204407  normal  0.639877 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2793  beta-lactamase  29.24 
 
 
510 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.879811  normal  0.340954 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0555  penicillin-binding protein, putative  27.38 
 
 
413 aa  114  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.389605  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4818  putative penicillin-binding protein  27.6 
 
 
416 aa  114  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.618322  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3518  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  30.96 
 
 
508 aa  114  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0071  beta-lactamase  27.03 
 
 
373 aa  114  4.0000000000000004e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.902729  normal  0.844307 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2573  beta-lactamase  31.58 
 
 
476 aa  113  7.000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.369136  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5593  beta-lactamase  27.22 
 
 
480 aa  113  8.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3731  beta-lactamase  27.59 
 
 
603 aa  113  8.000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.227339 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3422  beta-lactamase  27.59 
 
 
593 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.126074  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3615  beta-lactamase  26.54 
 
 
611 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0663146 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0116  beta-lactamase  25 
 
 
453 aa  111  2.0000000000000002e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1867  beta-lactamase  25.39 
 
 
517 aa  111  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0109165  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1755  beta-lactamase  27.38 
 
 
450 aa  111  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2587  putative penicillin-binding protein  26.5 
 
 
463 aa  110  5e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35213e-17 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0428  beta-lactamase  28.79 
 
 
404 aa  110  5e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.354595  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0973  beta-lactamase  25.33 
 
 
514 aa  110  7.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4346  Beta-lactamase  28.31 
 
 
547 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2616  beta-lactamase  25.72 
 
 
353 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2294  penicillin-binding protein, putative  29.39 
 
 
434 aa  108  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.272122  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3069  alkaline D-peptidase  30.2 
 
 
388 aa  108  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0417304  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09923  hypothetical protein  23.27 
 
 
591 aa  108  2e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.916627  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4671  alkaline D-peptidase, putative  28.62 
 
 
330 aa  108  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.126225  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2400  penicillin-binding protein  26.5 
 
 
481 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443561  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2755  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  30.07 
 
 
388 aa  108  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0494186  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01828  beta-lactamase precursor  28.77 
 
 
366 aa  108  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.284204  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2575  penicillin-binding protein  26.5 
 
 
481 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0612  beta-lactamase  25.13 
 
 
391 aa  108  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3247  beta-lactamase  26.37 
 
 
513 aa  108  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1832  beta-lactamase  25.82 
 
 
446 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.29245  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1457  beta-lactamase  28.34 
 
 
325 aa  107  3e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.17461  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2353  penicillin-binding protein  26.5 
 
 
481 aa  107  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000218323  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2997  beta-lactamase  26.63 
 
 
513 aa  107  5e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1164  beta-lactamase  27.06 
 
 
501 aa  107  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1638  beta-lactamase  25.72 
 
 
485 aa  107  6e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0331332  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2587  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.86 
 
 
413 aa  107  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.607083  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2384  beta-lactamase  27.15 
 
 
483 aa  107  6e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3517  beta-lactamase  29.44 
 
 
447 aa  106  7e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1230  beta-lactamase  25.14 
 
 
455 aa  106  7e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1263  beta-lactamase-like protein  25.14 
 
 
455 aa  106  8e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0154  beta-lactamase  25.4 
 
 
482 aa  106  9e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1783  cyclic peptide transporter  26.97 
 
 
1055 aa  106  9e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2539  beta-lactamase  25.23 
 
 
567 aa  106  9e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.470437  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2143  beta-lactamase  28.8 
 
 
401 aa  105  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.559529  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2573  fmtA-like protein, putative  25.13 
 
 
482 aa  105  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00911316  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3030  alkaline D-peptidase  29.67 
 
 
388 aa  105  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2316  penicillin-binding protein  26.1 
 
 
481 aa  105  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181197  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4350  Beta-lactamase  25.33 
 
 
553 aa  105  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2080  beta-lactamase  29.61 
 
 
370 aa  105  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.16247  normal  0.44675 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6088  beta-lactamase  27.15 
 
 
406 aa  105  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.496561  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11951  lipoprotein  36.9 
 
 
371 aa  105  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>