More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1923 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1923  beta-lactamase  100 
 
 
389 aa  761    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0275  beta-lactamase  56.8 
 
 
400 aa  343  2e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.35061  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3468  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  34.08 
 
 
415 aa  143  6e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.560934  normal  0.0158413 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6205  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  34.07 
 
 
378 aa  135  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2778  beta-lactamase  33.82 
 
 
380 aa  135  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.701087  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1094  beta-lactamase  35.71 
 
 
349 aa  134  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2415  beta-lactamase  27.79 
 
 
442 aa  130  3e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0834226  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0099  D-stereospecific peptide hydrolase  28.91 
 
 
443 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000129924  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0618  beta-lactamase  30.33 
 
 
450 aa  127  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  25.87 
 
 
446 aa  127  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0034  alkaline D-peptidase  34.91 
 
 
392 aa  126  7e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.698522 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1119  hypothetical protein  27.84 
 
 
371 aa  125  2e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1832  beta-lactamase  32.98 
 
 
446 aa  124  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.29245  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0570  alkaline D-peptidase  36.98 
 
 
370 aa  123  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126759  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5142  alkaline D-peptidase  34.83 
 
 
428 aa  123  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00324654  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1123  hypothetical protein  27.32 
 
 
371 aa  123  7e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5167  beta-lactamase  31.55 
 
 
713 aa  122  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.619685  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1357  beta-lactamase  31.55 
 
 
378 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0368  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  33.24 
 
 
399 aa  121  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00562308  normal  0.495103 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5169  beta-lactamase  33.43 
 
 
382 aa  121  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1936  beta-lactamase  31.7 
 
 
848 aa  120  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.178754  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2043  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  32.27 
 
 
421 aa  120  6e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.956781  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3018  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.6 
 
 
389 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.470862  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2538  beta-lactamase  33.11 
 
 
416 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5738  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  31.63 
 
 
447 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.38713 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5306  beta-lactamase  32.39 
 
 
411 aa  117  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  32.36 
 
 
356 aa  117  3.9999999999999997e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3022  alkaline D-peptidase and alkaline D-peptidase fusion  28.13 
 
 
720 aa  116  6e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0802631  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4368  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  33.44 
 
 
416 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041515 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2717  beta-lactamase  28.53 
 
 
470 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3984  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  32.45 
 
 
390 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11951  lipoprotein  36.27 
 
 
371 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5360  twin-arginine translocation pathway signal  31.29 
 
 
447 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5451  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  31.29 
 
 
447 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0503905 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3215  beta-lactamase  31.82 
 
 
405 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000372743  hitchhiker  0.00147977 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2381  alkaline D-peptidase  27.81 
 
 
385 aa  114  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0825231  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0727  alkaline D-peptidase  33.12 
 
 
429 aa  114  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4546  beta-lactamase  33.22 
 
 
740 aa  113  5e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207661  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3206  beta-lactamase  28.93 
 
 
389 aa  113  5e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5013  alkaline D-peptidase  33.14 
 
 
374 aa  113  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394865  normal  0.0638413 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3053  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.49 
 
 
420 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13238  penicillin-binding protein, putative  24.46 
 
 
431 aa  112  9e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.652866  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2576  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  29.97 
 
 
389 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.145811 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3175  beta-lactamase  25.66 
 
 
351 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0119788  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2296  alkaline D-peptidase  27.25 
 
 
385 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000100431 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2409  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  28.33 
 
 
388 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.37701  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2573  beta-lactamase  31.05 
 
 
476 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.369136  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2647  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.26 
 
 
429 aa  112  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.180779  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  27.35 
 
 
377 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2053  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  27.51 
 
 
385 aa  110  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00880281  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2051  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  27.51 
 
 
385 aa  111  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.319079  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  24.13 
 
 
487 aa  110  3e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2105  beta-lactamase  24.84 
 
 
347 aa  110  3e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2991  beta-lactamase  31.21 
 
 
475 aa  110  4.0000000000000004e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2677  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  28.27 
 
 
388 aa  110  5e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000522854 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2440  alkaline D-peptidase (D-stereospecific peptide hydrolase)  28.27 
 
 
388 aa  110  5e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00540718  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3689  beta-lactamase  28.26 
 
 
422 aa  110  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2478  alkaline D-peptidase  28.27 
 
 
388 aa  110  6e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.431844  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2661  alkaline d-peptidase  28.27 
 
 
388 aa  110  6e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3175  beta-lactamase  25.99 
 
 
375 aa  110  6e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.702373  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3391  beta-lactamase  30.62 
 
 
420 aa  109  7.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2093  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  27.08 
 
 
407 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3147  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  26.35 
 
 
407 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.943509  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3027  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.69 
 
 
406 aa  109  8.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.899556  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1263  beta-lactamase  32.1 
 
 
375 aa  108  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0172767 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1013  beta-lactamase  33.33 
 
 
449 aa  108  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2921  beta-lactamase class C-like protein  24.8 
 
 
451 aa  108  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.154271 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  25.55 
 
 
578 aa  108  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1134  beta-lactamase  31.85 
 
 
459 aa  108  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4765  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  32.28 
 
 
514 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.263187 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2316  beta-lactamase  28.08 
 
 
467 aa  108  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0048462  decreased coverage  0.0000015739 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2896  alkaline D-peptidase  29.28 
 
 
383 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.243898  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2860  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  28.03 
 
 
385 aa  107  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28769  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2650  beta-lactamase  29.29 
 
 
497 aa  107  4e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0361544  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2405  beta-lactamase  33.71 
 
 
382 aa  107  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.261903  hitchhiker  0.00562199 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2587  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  26.44 
 
 
413 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.607083  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2217  alkaline D-peptidase  29.06 
 
 
388 aa  107  5e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  3.66047e-16 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2539  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  26.26 
 
 
445 aa  106  6e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  25.99 
 
 
477 aa  106  7e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3030  alkaline D-peptidase  28.09 
 
 
388 aa  106  7e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3510  beta-lactamase  28.97 
 
 
409 aa  105  9e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.143562 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2416  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  33.13 
 
 
411 aa  105  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.758876  normal  0.129808 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  26.33 
 
 
362 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  27.44 
 
 
559 aa  105  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0343  beta-lactamase  29.5 
 
 
482 aa  105  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0471  beta-lactamase  26.58 
 
 
616 aa  105  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5173  putative beta lactamase family protein  32.13 
 
 
462 aa  104  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.694377  normal  0.230482 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3352  beta-lactamase  31.19 
 
 
416 aa  104  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.237036  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5264  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  31.34 
 
 
493 aa  104  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.0797924 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2312  beta-lactamase  32.32 
 
 
406 aa  103  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4094  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  31.46 
 
 
405 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4170  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  31.46 
 
 
405 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2793  beta-lactamase  28.81 
 
 
510 aa  104  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.879811  normal  0.340954 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4325  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  31.46 
 
 
405 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0248121  normal  0.0483573 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1969  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  34.07 
 
 
414 aa  103  4e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.980127  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23940  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  31.58 
 
 
378 aa  103  4e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0755223  normal  0.0888544 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3688  beta-lactamase  24.66 
 
 
543 aa  103  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497517  normal  0.011807 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2177  beta-lactamase  24.66 
 
 
543 aa  103  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.816506 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4213  beta-lactamase  27.02 
 
 
403 aa  103  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.161495  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2143  beta-lactamase  29.66 
 
 
401 aa  103  5e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.559529  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>