More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0471 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0471  beta-lactamase  100 
 
 		 616 aa  1259    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3062  beta-lactamase  25.81 
 
 		 614 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.367625  hitchhiker  0.002383 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5771  beta-lactamase  27 
 
 		 711 aa  159  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3002  TonB-dependent receptor  25.74 
 
 		 630 aa  152  2e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398528 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  28.12 
 
 		 595 aa  139  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1311  beta-lactamase  27.41 
 
 		 669 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3830  beta-lactamase  30.41 
 
 		 658 aa  134  6.999999999999999e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223137  normal  0.372687 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0759  putative beta-lactamase class C penicillin binding protein  30.03 
 
 		 498 aa  127  5e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445171  normal  0.118882 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  28.44 
 
 		 601 aa  123  8e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4257  beta-lactamase  29.31 
 
 		 464 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4308  beta-lactamase  31.4 
 
 		 650 aa  122  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.805936  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1818  beta-lactamase  28.29 
 
 		 513 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3362  beta-lactamase  25.93 
 
 		 717 aa  121  4.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.450789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0116  beta-lactamase  26.71 
 
 		 453 aa  120  7.999999999999999e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0201  beta-lactamase  30.28 
 
 		 530 aa  115  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.494145 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  29.79 
 
 		 487 aa  115  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0570  alkaline D-peptidase  30.4 
 
 		 370 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0335  hypothetical protein  28.4 
 
 		 533 aa  116  2.0000000000000002e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3177  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  26.62 
 
 		 484 aa  115  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.075148  normal  0.866618 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2576  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  28.41 
 
 		 389 aa  115  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.145811 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5348  beta-lactamase  31.69 
 
 		 414 aa  114  6e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.635001  normal  0.0848814 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4612  beta-lactamase  32.95 
 
 		 677 aa  114  8.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3030  alkaline D-peptidase  27.55 
 
 		 388 aa  114  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2217  alkaline D-peptidase  27.55 
 
 		 388 aa  114  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.66047e-16 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2400  penicillin-binding protein  25.15 
 
 		 481 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443561  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2602  beta-lactamase  26.05 
 
 		 778 aa  112  1.0000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2575  penicillin-binding protein  25.15 
 
 		 481 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5715  beta-lactamase  25.85 
 
 		 437 aa  113  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2824  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.05 
 
 		 388 aa  111  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.130693  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3500  beta-lactamase  27.93 
 
 		 600 aa  111  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.623073  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2384  beta-lactamase  25.96 
 
 		 483 aa  112  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0467  beta-lactamase  28.53 
 
 		 637 aa  111  4.0000000000000004e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0468  beta-lactamase  28.13 
 
 		 455 aa  110  6e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000926021 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2353  penicillin-binding protein  24.77 
 
 		 481 aa  110  8.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000218323  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2316  penicillin-binding protein  24.85 
 
 		 481 aa  110  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181197  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2587  putative penicillin-binding protein  25.4 
 
 		 463 aa  109  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35213e-17 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4159  beta-lactamase  26.61 
 
 		 544 aa  109  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0453527  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3069  alkaline D-peptidase  27.24 
 
 		 388 aa  109  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0417304  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0099  D-stereospecific peptide hydrolase  27.13 
 
 		 443 aa  108  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000129924  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0318  beta-lactamase  26.72 
 
 		 365 aa  108  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.180634 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5714  beta-lactamase  29.45 
 
 		 446 aa  108  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3018  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.37 
 
 		 389 aa  108  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.470862  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1788  beta-lactamase  28.62 
 
 		 560 aa  108  4e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.358741  normal  0.761746 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2755  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  27.24 
 
 		 388 aa  108  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0494186  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4191  beta-lactamase  25.71 
 
 		 386 aa  108  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.249358 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  27.98 
 
 		 578 aa  107  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3027  alkaline D-peptidase  27.24 
 
 		 388 aa  106  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2819  alkaline D-peptidase  27.24 
 
 		 388 aa  106  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118082  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2769  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  27.24 
 
 		 389 aa  106  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.48212  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0683  Beta-lactamase  29.02 
 
 		 530 aa  106  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.564885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3033  alkaline d-peptidase  27.24 
 
 		 388 aa  106  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.400662  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0812  beta-lactamase  30.5 
 
 		 408 aa  106  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.623448  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2579  penicillin-binding protein, putative  25.7 
 
 		 483 aa  106  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0220569  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0954  Beta-lactamase  27.36 
 
 		 416 aa  105  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3702  beta-lactamase  30.4 
 
 		 430 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5423  beta-lactamase  32.17 
 
 		 636 aa  105  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.251471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2629  putative penicillin-binding protein  24.77 
 
 		 490 aa  105  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0110315  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1946  Beta-lactamase  27.62 
 
 		 588 aa  105  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2459  beta-lactamase  25.27 
 
 		 466 aa  105  3e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2813  beta-lactamase  28.05 
 
 		 499 aa  105  3e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3247  beta-lactamase  29.8 
 
 		 513 aa  105  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  23.7 
 
 		 446 aa  105  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2043  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27.22 
 
 		 421 aa  105  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.956781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9203  beta-lactamase  27.34 
 
 		 635 aa  105  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.606578 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5618  beta-lactamase  30.47 
 
 		 456 aa  104  5e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357665  normal  0.013094 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3064  alkaline D-peptidase  26.63 
 
 		 388 aa  103  7e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0312865  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2717  beta-lactamase  26.56 
 
 		 470 aa  103  9e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4262  beta-lactamase  27.48 
 
 		 695 aa  103  9e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11747  penicillin-binding protein  29.88 
 
 		 539 aa  103  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.47398 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2053  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  27.65 
 
 		 385 aa  103  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00880281  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2896  alkaline D-peptidase  29.24 
 
 		 383 aa  103  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.243898  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3022  alkaline D-peptidase and alkaline D-peptidase fusion  28.34 
 
 		 720 aa  103  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0802631  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0618  beta-lactamase  25.43 
 
 		 450 aa  102  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1936  beta-lactamase  28.85 
 
 		 848 aa  103  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.178754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3144  beta-lactamase  26.48 
 
 		 590 aa  103  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2544  putative penicillin-binding protein  24.69 
 
 		 483 aa  103  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2296  alkaline D-peptidase  26.71 
 
 		 385 aa  103  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000100431 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2051  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  26.9 
 
 		 385 aa  102  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.319079  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13238  penicillin-binding protein, putative  25.71 
 
 		 431 aa  102  2e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.652866  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3147  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  26.37 
 
 		 407 aa  102  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.943509  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4402  beta-lactamase  32.17 
 
 		 405 aa  102  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1762  beta-lactamase  30.11 
 
 		 431 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178293  normal  0.700473 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4865  beta-lactamase  31.78 
 
 		 405 aa  102  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00560097 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1018  beta-lactamase  29.45 
 
 		 461 aa  102  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.624623 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4133  beta-lactamase  24.07 
 
 		 822 aa  102  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.668063  normal  0.0496796 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3206  beta-lactamase  27.69 
 
 		 389 aa  102  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6025  beta-lactamase  29.56 
 
 		 460 aa  101  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.565651 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0368  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  26.92 
 
 		 399 aa  101  4e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00562308  normal  0.495103 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1692  Beta-lactamase  30.77 
 
 		 414 aa  101  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0446405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4820  beta-lactamase  30.41 
 
 		 420 aa  101  5e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.85681  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3743  beta-lactamase  30.41 
 
 		 420 aa  101  5e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3006  beta-lactamase  28.84 
 
 		 423 aa  101  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1798  beta-lactamase  30.32 
 
 		 426 aa  100  5e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.491739  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3032  beta-lactamase  34.86 
 
 		 507 aa  100  6e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.436003 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2416  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  31.25 
 
 		 411 aa  100  7e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.758876  normal  0.129808 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2209  beta-lactamase  27.62 
 
 		 420 aa  100  7e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.683727  normal  0.729907 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2359  beta-lactamase  26.23 
 
 		 411 aa  100  8e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0634  beta-lactamase  25.76 
 
 		 661 aa  100  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.232968 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3256  beta-lactamase  27.62 
 
 		 420 aa  100  9e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.748817  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2860  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  26.03 
 
 		 385 aa  99.8  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28769  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>