More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3688 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2177  beta-lactamase  100 
 
 		 543 aa  1127    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.816506 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3688  beta-lactamase  100 
 
 		 543 aa  1127    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497517  normal  0.011807 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  35.57 
 
 		 559 aa  323  5e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1520  Beta-lactamase  33.83 
 
 		 537 aa  279  9e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000638983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2198  beta-lactamase  29.39 
 
 		 543 aa  260  5.0000000000000005e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.176904  normal  0.0317754 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5119  beta-lactamase  32.39 
 
 		 402 aa  183  6e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  33.52 
 
 		 362 aa  183  6e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  33.55 
 
 		 477 aa  174  2.9999999999999996e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  33.97 
 
 		 356 aa  172  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5443  putative beta-lactamase  29.23 
 
 		 364 aa  171  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.65256  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3175  beta-lactamase  31.68 
 
 		 351 aa  168  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0119788  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11951  lipoprotein  33.64 
 
 		 371 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  31.19 
 
 		 578 aa  165  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5264  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  28.49 
 
 		 493 aa  164  5.0000000000000005e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.0797924 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  27.44 
 
 		 446 aa  159  8e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4346  Beta-lactamase  25.36 
 
 		 547 aa  153  7e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2717  beta-lactamase  28.69 
 
 		 470 aa  153  8e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  33.23 
 
 		 442 aa  152  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5985  beta-lactamase  32.67 
 
 		 342 aa  151  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2968  beta-lactamase  30.99 
 
 		 462 aa  151  3e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4350  Beta-lactamase  25.97 
 
 		 553 aa  148  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2415  beta-lactamase  26.68 
 
 		 442 aa  147  6e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0834226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  30.31 
 
 		 487 aa  146  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  32.79 
 
 		 377 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2638  beta-lactamase  32.29 
 
 		 445 aa  145  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4280  beta-lactamase  30 
 
 		 330 aa  145  3e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4636  beta-lactamase  33.54 
 
 		 496 aa  145  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1832  beta-lactamase  26.65 
 
 		 446 aa  144  4e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.29245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3512  beta-lactamase  29.86 
 
 		 364 aa  142  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0939  beta-lactamase  28.3 
 
 		 338 aa  139  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.18746 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1936  beta-lactamase  27.27 
 
 		 848 aa  137  6.0000000000000005e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.178754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1439  Beta-lactamase  29.61 
 
 		 330 aa  134  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0862025  normal  0.346233 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2736  beta-lactamase  28.61 
 
 		 417 aa  134  5e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.416885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0618  beta-lactamase  26.96 
 
 		 450 aa  133  6.999999999999999e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0999  beta-lactamase  29.39 
 
 		 367 aa  133  7.999999999999999e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0117018 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1311  beta-lactamase  30.33 
 
 		 669 aa  133  9e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.24 
 
 		 392 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4671  alkaline D-peptidase, putative  26.4 
 
 		 330 aa  130  8.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.126225  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1906  beta-lactamase  29.86 
 
 		 369 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2987  beta-lactamase  31.08 
 
 		 526 aa  129  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.204407  normal  0.639877 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0473  penicillin-binding protein  28.92 
 
 		 421 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2294  penicillin-binding protein, putative  29.53 
 
 		 434 aa  128  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.272122  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0416  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  28.92 
 
 		 421 aa  128  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0430511  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0483  putative penicillin-binding protein  28.92 
 
 		 412 aa  128  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0502  penicillin-binding protein  28.92 
 
 		 412 aa  128  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4818  putative penicillin-binding protein  28.66 
 
 		 416 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.618322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0505  putative penicillin-binding protein  28.66 
 
 		 415 aa  127  6e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0859162  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2573  beta-lactamase  31.25 
 
 		 476 aa  126  9e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.369136  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0412  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  28.31 
 
 		 422 aa  126  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04833  beta-lactamase  27.54 
 
 		 529 aa  126  1e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3731  beta-lactamase  24.94 
 
 		 603 aa  125  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.227339 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4043  beta-lactamase  33.22 
 
 		 361 aa  125  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0419  beta-lactamase  28.31 
 
 		 416 aa  124  4e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3615  beta-lactamase  24.04 
 
 		 611 aa  124  4e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0663146 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2400  penicillin-binding protein  30.52 
 
 		 481 aa  124  6e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443561  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2575  penicillin-binding protein  30.52 
 
 		 481 aa  124  6e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2768  beta-lactamase  29.6 
 
 		 483 aa  123  8e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3422  beta-lactamase  24.77 
 
 		 593 aa  123  9e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.126074  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2353  penicillin-binding protein  29.11 
 
 		 481 aa  123  9e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000218323  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0555  penicillin-binding protein, putative  28.31 
 
 		 413 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.389605  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1357  beta-lactamase  26.15 
 
 		 378 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0558  putative penicillin-binding protein  28 
 
 		 413 aa  121  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.622752  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2659  beta-lactamase  33.2 
 
 		 662 aa  121  3.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13238  penicillin-binding protein, putative  24.94 
 
 		 431 aa  120  4.9999999999999996e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.652866  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2587  putative penicillin-binding protein  30.19 
 
 		 463 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35213e-17 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8721  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  32.66 
 
 		 480 aa  120  7.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  29.58 
 
 		 505 aa  119  9.999999999999999e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2316  penicillin-binding protein  30.19 
 
 		 481 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181197  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0095  beta-lactamase  23.79 
 
 		 580 aa  119  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0428  beta-lactamase  29.6 
 
 		 404 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.354595  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2629  putative penicillin-binding protein  29.68 
 
 		 490 aa  118  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0110315  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1031  beta-lactamase  30.12 
 
 		 358 aa  118  3e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2384  beta-lactamase  27.15 
 
 		 483 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  25 
 
 		 595 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2921  beta-lactamase class C-like protein  25.94 
 
 		 451 aa  117  6e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.154271 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2579  penicillin-binding protein, putative  30.06 
 
 		 483 aa  117  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0220569  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0759  putative beta-lactamase class C penicillin binding protein  25.4 
 
 		 498 aa  117  7.999999999999999e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445171  normal  0.118882 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2556  beta-lactamase  27.91 
 
 		 328 aa  116  8.999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.400267 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2516  beta-lactamase  27.22 
 
 		 498 aa  115  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000422279  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0116  beta-lactamase  27.06 
 
 		 453 aa  116  1.0000000000000001e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3247  beta-lactamase  24.55 
 
 		 513 aa  116  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1638  beta-lactamase  30.19 
 
 		 485 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0331332  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2468  beta-lactamase  27.22 
 
 		 498 aa  115  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00176956  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2544  putative penicillin-binding protein  29.74 
 
 		 483 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2060  beta-lactamase  28.93 
 
 		 485 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.258254  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2264  hypothetical protein  28.75 
 
 		 485 aa  114  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.145649  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0947  D-aminopeptidase  23.64 
 
 		 518 aa  115  3e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1412  D-aminopeptidase  26.23 
 
 		 520 aa  114  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2539  beta-lactamase  26.11 
 
 		 567 aa  115  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.470437  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0889  D-aminopeptidase  23.85 
 
 		 518 aa  114  3e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2018  penicillin-binding protein  29.06 
 
 		 485 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3669  beta-lactamase  24.48 
 
 		 507 aa  114  4.0000000000000004e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2346  hypothetical protein  28.75 
 
 		 485 aa  114  6e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0051399  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2262  hypothetical protein  29.23 
 
 		 485 aa  114  6e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.60427e-26 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0059  beta-lactamase  28.57 
 
 		 383 aa  113  7.000000000000001e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0476107  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1839  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  25.12 
 
 		 681 aa  113  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000051234  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2218  hypothetical protein  29.38 
 
 		 485 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9203  beta-lactamase  26.43 
 
 		 635 aa  112  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.606578 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3751  beta-lactamase  25.5 
 
 		 395 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000498352 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2018  penicillin-binding protein  29.01 
 
 		 485 aa  111  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.225321  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>