More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0095 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_0095  beta-lactamase  100 
 
 
580 aa  1198    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1554  beta-lactamase  43.33 
 
 
410 aa  310  5.9999999999999995e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2827  beta-lactamase  43.06 
 
 
410 aa  309  6.999999999999999e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.620293  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1519  beta-lactamase  43.42 
 
 
410 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1528  beta-lactamase  43.06 
 
 
410 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3058  beta-lactamase  38.62 
 
 
398 aa  273  9e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09928  putative non-ribosomal peptide synthetase  38.15 
 
 
483 aa  261  4e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.206304  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00893  putative non-ribosomal peptide synthetase  38.2 
 
 
504 aa  231  2e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3669  beta-lactamase  36.56 
 
 
507 aa  230  6e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1798  putative penicillin-binding protein  36.17 
 
 
345 aa  220  6e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3450  putative penicillin-binding protein  36.17 
 
 
345 aa  219  1e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3457  penicillin-binding protein, putative  35.26 
 
 
345 aa  219  2e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0846079  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3161  beta-lactamase  35.26 
 
 
345 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.513254  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3157  beta-lactamase  34.34 
 
 
345 aa  213  7.999999999999999e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00126272  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3224  penicillin-binding protein  34.35 
 
 
374 aa  208  3e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000147452  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3251  penicillin-binding protein  34.35 
 
 
374 aa  206  8e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3506  penicillin-binding protein  34.35 
 
 
345 aa  206  1e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3466  putative penicillin-binding protein  33.74 
 
 
345 aa  203  7e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3873  amino acid adenylation domain protein  34.35 
 
 
5698 aa  196  8.000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.166545 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2997  beta-lactamase  34.71 
 
 
513 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2953  beta-lactamase  33.53 
 
 
513 aa  183  6e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2932  penicillin-binding protein  34.41 
 
 
513 aa  183  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1905  beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins  34.39 
 
 
389 aa  179  9e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.0068252  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3243  beta-lactamase family protein  33.82 
 
 
513 aa  178  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3010  penicillin-binding protein, N-terminus  38.61 
 
 
285 aa  163  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.467747  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4833  beta-lactamase  32.85 
 
 
405 aa  160  6e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9203  beta-lactamase  31.5 
 
 
635 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.606578 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0335  hypothetical protein  29.91 
 
 
533 aa  120  7.999999999999999e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2177  beta-lactamase  24.1 
 
 
543 aa  119  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.816506 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3688  beta-lactamase  24.1 
 
 
543 aa  119  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497517  normal  0.011807 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0963  beta-lactamase  39.34 
 
 
423 aa  118  3e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.146357  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2650  beta-lactamase  29.33 
 
 
497 aa  118  3.9999999999999997e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0361544  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1311  beta-lactamase  28.32 
 
 
669 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2360  beta-lactamase  28.79 
 
 
494 aa  117  5e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.908213  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4612  beta-lactamase  30.49 
 
 
677 aa  116  8.999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1375  beta-lactamase  33.33 
 
 
491 aa  116  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  27.91 
 
 
559 aa  116  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4262  beta-lactamase  29.6 
 
 
695 aa  115  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41280  putative beta-lactamase  25.97 
 
 
610 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.607486 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4511  beta-lactamase  26.65 
 
 
555 aa  111  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.480191  normal  0.743211 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3500  beta-lactamase  25.95 
 
 
600 aa  110  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.623073  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4308  beta-lactamase  28.05 
 
 
650 aa  108  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.805936  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  25.92 
 
 
601 aa  109  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0318  beta-lactamase  26.95 
 
 
365 aa  108  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.180634 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2659  beta-lactamase  25.38 
 
 
662 aa  108  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  25.94 
 
 
477 aa  107  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8144  beta-lactamase  30.09 
 
 
674 aa  106  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.977782 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3817  beta-lactamase  25 
 
 
364 aa  106  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0412  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  25.75 
 
 
422 aa  106  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2573  beta-lactamase  25.16 
 
 
476 aa  106  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.369136  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0558  putative penicillin-binding protein  25.75 
 
 
413 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.622752  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2459  beta-lactamase  32.55 
 
 
466 aa  105  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2602  beta-lactamase  25.81 
 
 
778 aa  105  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  25.81 
 
 
505 aa  105  3e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0416  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  25.24 
 
 
421 aa  104  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0430511  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0502  penicillin-binding protein  25.24 
 
 
412 aa  104  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0483  putative penicillin-binding protein  25.24 
 
 
412 aa  104  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1465  beta-lactamase  28.32 
 
 
657 aa  104  4e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.16455  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0473  penicillin-binding protein  25.24 
 
 
421 aa  104  5e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0419  beta-lactamase  25.38 
 
 
416 aa  104  5e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0555  penicillin-binding protein, putative  25.45 
 
 
413 aa  103  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.389605  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0674  beta-lactamase  31.82 
 
 
715 aa  103  6e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.076052 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5618  beta-lactamase  27.78 
 
 
456 aa  103  7e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357665  normal  0.013094 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0505  putative penicillin-binding protein  25.15 
 
 
415 aa  103  7e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0859162  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0612  beta-lactamase  25.77 
 
 
391 aa  103  9e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2539  beta-lactamase  24.93 
 
 
567 aa  103  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.470437  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1671  beta-lactamase  28.19 
 
 
633 aa  102  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0428  beta-lactamase  26.19 
 
 
404 aa  101  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.354595  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0759  putative beta-lactamase class C penicillin binding protein  26.51 
 
 
498 aa  101  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445171  normal  0.118882 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1798  beta-lactamase  26.38 
 
 
426 aa  100  5e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.491739  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3177  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  28.16 
 
 
484 aa  101  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.075148  normal  0.866618 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6025  beta-lactamase  29.05 
 
 
460 aa  100  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.565651 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3207  beta-lactamase  26.95 
 
 
357 aa  100  6e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.916512  normal  0.585337 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2384  beta-lactamase  30 
 
 
483 aa  100  7e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0471  beta-lactamase  28.96 
 
 
616 aa  100  7e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3830  beta-lactamase  27.03 
 
 
658 aa  100  7e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223137  normal  0.372687 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4818  putative penicillin-binding protein  24.85 
 
 
416 aa  100  7e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.618322  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  26.94 
 
 
595 aa  100  9e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1832  beta-lactamase  24.36 
 
 
446 aa  98.6  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.29245  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0973  beta-lactamase  30.81 
 
 
514 aa  99.4  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3062  beta-lactamase  26.3 
 
 
614 aa  99.4  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.367625  hitchhiker  0.002383 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1762  beta-lactamase  26.8 
 
 
431 aa  99.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178293  normal  0.700473 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2717  beta-lactamase  27.57 
 
 
470 aa  99  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0634  beta-lactamase  26.87 
 
 
661 aa  99.4  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.232968 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2174  beta-lactamase  24.66 
 
 
429 aa  98.2  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1364  beta-lactamase  28.92 
 
 
574 aa  98.2  4e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.185265  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1621  beta-lactamase  24 
 
 
426 aa  98.2  4e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.193235  normal  0.330681 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3702  beta-lactamase  27.33 
 
 
430 aa  97.4  6e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1601  beta-lactamase  27.36 
 
 
444 aa  97.4  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27.43 
 
 
392 aa  97.4  6e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5985  beta-lactamase  29.9 
 
 
342 aa  97.1  7e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2579  penicillin-binding protein, putative  27.78 
 
 
483 aa  97.1  8e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0220569  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4519  beta-lactamase  28.62 
 
 
451 aa  97.1  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.302372  normal  0.700128 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1357  beta-lactamase  26.9 
 
 
378 aa  96.7  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1946  Beta-lactamase  27.4 
 
 
588 aa  96.3  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1520  Beta-lactamase  27.54 
 
 
537 aa  96.7  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000638983  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0999  beta-lactamase  26.53 
 
 
367 aa  96.7  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0117018 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2143  beta-lactamase  24.7 
 
 
401 aa  96.3  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.559529  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3422  beta-lactamase  25.85 
 
 
593 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.126074  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4591  beta-lactamase  25.64 
 
 
675 aa  95.1  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.434255  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>