More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3247 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_3247  beta-lactamase  100 
 
 		 513 aa  1063    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04833  beta-lactamase  45.53 
 
 		 529 aa  436  1e-121  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2987  beta-lactamase  44.44 
 
 		 526 aa  426  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.204407  normal  0.639877 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1234  beta-lactamase  43.19 
 
 		 519 aa  414  1e-114  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565811  normal  0.301621 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1460  beta-lactamase  40.61 
 
 		 523 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0171679  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0154  beta-lactamase  38.64 
 
 		 526 aa  373  1e-102  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1055  beta-lactamase  41.34 
 
 		 547 aa  366  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2343  beta-lactamase  39.69 
 
 		 803 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.23617 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4159  beta-lactamase  39.17 
 
 		 544 aa  344  2e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0453527  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0467  beta-lactamase  37.52 
 
 		 520 aa  343  5.999999999999999e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4882  beta-lactamase  35.11 
 
 		 497 aa  290  6e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1867  beta-lactamase  33.4 
 
 		 517 aa  286  9e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0109165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1638  beta-lactamase  34.7 
 
 		 485 aa  271  2e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0331332  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2060  beta-lactamase  34.52 
 
 		 485 aa  268  2e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.258254  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3106  hypothetical protein  33.49 
 
 		 485 aa  266  5.999999999999999e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000134591 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2018  penicillin-binding protein  33.73 
 
 		 485 aa  266  8e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.225321  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2262  hypothetical protein  33.49 
 
 		 485 aa  264  3e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.60427e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2346  hypothetical protein  33.73 
 
 		 485 aa  263  6e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0051399  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2081  hypothetical protein  33.25 
 
 		 485 aa  261  2e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.765888  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2235  hypothetical protein  33.25 
 
 		 485 aa  261  2e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.336147  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2264  hypothetical protein  33.02 
 
 		 485 aa  261  3e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.145649  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2218  hypothetical protein  32.78 
 
 		 485 aa  260  3e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2018  penicillin-binding protein  33.02 
 
 		 485 aa  259  6e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0343  beta-lactamase  34.13 
 
 		 517 aa  253  5.000000000000001e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.6779 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1298  beta-lactamase  31.06 
 
 		 566 aa  230  6e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4420  beta-lactamase  34.38 
 
 		 519 aa  226  6e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09923  hypothetical protein  30.51 
 
 		 591 aa  226  1e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.916627  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4050  beta-lactamase  35.06 
 
 		 519 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.817302  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2539  beta-lactamase  35.34 
 
 		 567 aa  218  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.470437  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0693  beta-lactamase  31.96 
 
 		 530 aa  217  4e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.750269  normal  0.541197 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2813  beta-lactamase  29.88 
 
 		 499 aa  211  3e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4657  beta-lactamase  31.62 
 
 		 485 aa  209  1e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2632  beta-lactamase  30.91 
 
 		 503 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.119708  hitchhiker  0.000636173 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0735  beta-lactamase  31.22 
 
 		 551 aa  202  9.999999999999999e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10925  hypothetical protein  31.58 
 
 		 562 aa  201  3e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4990  beta-lactamase  30.72 
 
 		 531 aa  197  3e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1625  beta-lactamase  31.06 
 
 		 533 aa  189  1e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.170379  normal  0.921213 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1514  beta-lactamase  28.54 
 
 		 620 aa  189  1e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00027695  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4076  beta-lactamase  33.33 
 
 		 566 aa  187  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1230  beta-lactamase  30.49 
 
 		 455 aa  187  4e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1263  beta-lactamase-like protein  30.49 
 
 		 455 aa  187  5e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0653  beta-lactamase  30.46 
 
 		 531 aa  187  6e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0822  6Fe-6S prismane cluster-containing protein-like protein  31.07 
 
 		 455 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1757  beta-lactamase  30.17 
 
 		 531 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4610  beta-lactamase  30.68 
 
 		 533 aa  182  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0702461  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6123  beta-lactamase  29.7 
 
 		 536 aa  181  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.299024  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1134  beta-lactamase  29.91 
 
 		 603 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.260461 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4133  beta-lactamase  33.43 
 
 		 822 aa  179  9e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.668063  normal  0.0496796 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3068  beta-lactamase  30.27 
 
 		 466 aa  178  2e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.129348 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1064  beta-lactamase  30.53 
 
 		 544 aa  175  9.999999999999999e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01660  beta-lactamase  30 
 
 		 447 aa  174  2.9999999999999996e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.142612  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4429  beta-lactamase  31.44 
 
 		 533 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4516  beta-lactamase  31.44 
 
 		 533 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4810  beta-lactamase  31.44 
 
 		 533 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0805  beta-lactamase  29.19 
 
 		 519 aa  173  7.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8154  beta-lactamase  30.53 
 
 		 550 aa  171  4e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2979  beta-lactamase  29.1 
 
 		 655 aa  165  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  30.93 
 
 		 477 aa  156  8e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1621  beta-lactamase  27 
 
 		 426 aa  146  1e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.193235  normal  0.330681 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  27.55 
 
 		 559 aa  141  3.9999999999999997e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11747  penicillin-binding protein  29.45 
 
 		 539 aa  136  9.999999999999999e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.47398 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1968  beta-lactamase  25.27 
 
 		 380 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.103464 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5338  beta-lactamase  30.18 
 
 		 525 aa  133  6e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.271651  normal  0.211898 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  27.68 
 
 		 595 aa  133  9e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  29.1 
 
 		 505 aa  132  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  26.46 
 
 		 446 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2727  beta-lactamase  27.73 
 
 		 486 aa  132  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2498  beta-lactamase  27.22 
 
 		 385 aa  130  6e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0428857  normal  0.830123 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2779  beta-lactamase  29.65 
 
 		 445 aa  130  6e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000737728  hitchhiker  0.0000305116 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5715  beta-lactamase  26.28 
 
 		 437 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1520  Beta-lactamase  27.12 
 
 		 537 aa  129  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000638983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0759  putative beta-lactamase class C penicillin binding protein  29.23 
 
 		 498 aa  128  3e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445171  normal  0.118882 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5985  beta-lactamase  27.37 
 
 		 342 aa  127  6e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3032  beta-lactamase  28.65 
 
 		 507 aa  126  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.436003 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2459  beta-lactamase  26.26 
 
 		 466 aa  125  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4706  beta-lactamase  27.25 
 
 		 444 aa  124  4e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2118  beta-lactamase  25.14 
 
 		 389 aa  124  4e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.146261  normal  0.0898893 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1414  putative beta-lactamase  24.67 
 
 		 399 aa  122  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.182511  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1018  beta-lactamase  27.25 
 
 		 461 aa  122  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.624623 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  28.61 
 
 		 362 aa  120  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2068  beta-lactamase  25.55 
 
 		 385 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.567046  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1936  beta-lactamase  27.88 
 
 		 848 aa  120  7e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.178754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1311  beta-lactamase  25.56 
 
 		 669 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  28.24 
 
 		 601 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8721  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  29.88 
 
 		 480 aa  118  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0675  beta-lactamase  26.6 
 
 		 377 aa  118  3e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0116  beta-lactamase  26.8 
 
 		 453 aa  117  3.9999999999999997e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2717  beta-lactamase  29.27 
 
 		 470 aa  117  3.9999999999999997e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  28.57 
 
 		 356 aa  117  3.9999999999999997e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3688  beta-lactamase  24.55 
 
 		 543 aa  116  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497517  normal  0.011807 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2177  beta-lactamase  24.55 
 
 		 543 aa  116  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.816506 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5264  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  29.62 
 
 		 493 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.0797924 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4191  beta-lactamase  27.42 
 
 		 386 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.249358 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33850  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  28.36 
 
 		 453 aa  114  3e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3274  beta-lactamase  27.06 
 
 		 524 aa  114  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.847415 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4636  beta-lactamase  29.51 
 
 		 496 aa  114  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3030  alkaline D-peptidase  31.14 
 
 		 388 aa  113  6e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8144  beta-lactamase  27.02 
 
 		 674 aa  113  8.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.977782 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2217  alkaline D-peptidase  30.8 
 
 		 388 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.66047e-16 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1164  beta-lactamase  24.19 
 
 		 501 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.255434 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>