More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8144 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_8144  beta-lactamase  100 
 
 
674 aa  1338    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.977782 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0634  beta-lactamase  51.97 
 
 
661 aa  590  1e-167  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.232968 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1671  beta-lactamase  41.47 
 
 
633 aa  460  9.999999999999999e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9203  beta-lactamase  43.76 
 
 
635 aa  448  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.606578 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4308  beta-lactamase  34.15 
 
 
650 aa  300  6e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.805936  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1311  beta-lactamase  27.11 
 
 
669 aa  253  8.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3830  beta-lactamase  32.5 
 
 
658 aa  248  2e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223137  normal  0.372687 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0335  hypothetical protein  32.67 
 
 
533 aa  246  8e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4612  beta-lactamase  36.44 
 
 
677 aa  225  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2602  beta-lactamase  33.27 
 
 
778 aa  220  6e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2659  beta-lactamase  27.59 
 
 
662 aa  219  1e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1465  beta-lactamase  32.5 
 
 
657 aa  218  2e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.16455  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4262  beta-lactamase  34.49 
 
 
695 aa  200  6e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5423  beta-lactamase  31.33 
 
 
636 aa  195  3e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.251471  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0784  beta-lactamase  29.41 
 
 
638 aa  188  3e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.433281 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0467  beta-lactamase  29.03 
 
 
637 aa  177  6e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3362  beta-lactamase  28.98 
 
 
717 aa  157  6e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.450789  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4139  beta-lactamase  31.89 
 
 
422 aa  134  3.9999999999999996e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  27.88 
 
 
595 aa  124  5e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2997  beta-lactamase  26.61 
 
 
513 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2953  beta-lactamase  26.43 
 
 
513 aa  122  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2932  penicillin-binding protein  26.46 
 
 
513 aa  120  9e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2468  beta-lactamase  25.84 
 
 
498 aa  115  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00176956  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2516  beta-lactamase  25.84 
 
 
498 aa  115  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000422279  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0759  putative beta-lactamase class C penicillin binding protein  32.19 
 
 
498 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445171  normal  0.118882 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3243  beta-lactamase family protein  26.32 
 
 
513 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3247  beta-lactamase  26.7 
 
 
513 aa  115  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2650  beta-lactamase  30.86 
 
 
497 aa  115  4.0000000000000004e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0361544  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0116  beta-lactamase  28.36 
 
 
453 aa  114  5e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  33.33 
 
 
601 aa  111  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11747  penicillin-binding protein  30.77 
 
 
539 aa  110  6e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.47398 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3068  beta-lactamase  28.42 
 
 
466 aa  109  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.129348 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0095  beta-lactamase  29.11 
 
 
580 aa  109  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01660  beta-lactamase  29.2 
 
 
447 aa  108  3e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.142612  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2384  beta-lactamase  27.39 
 
 
483 aa  107  7e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5327  beta-lactamase  31.85 
 
 
440 aa  107  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.620258 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2316  penicillin-binding protein  30.57 
 
 
481 aa  105  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181197  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1514  beta-lactamase  29.55 
 
 
620 aa  105  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00027695  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2400  penicillin-binding protein  30.57 
 
 
481 aa  104  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443561  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2587  putative penicillin-binding protein  30.57 
 
 
463 aa  104  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35213e-17 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2575  penicillin-binding protein  30.57 
 
 
481 aa  104  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3032  beta-lactamase  31.71 
 
 
507 aa  104  5e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.436003 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0467  beta-lactamase  25.96 
 
 
520 aa  104  5e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2579  penicillin-binding protein, putative  29.53 
 
 
483 aa  103  9e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0220569  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  25.84 
 
 
559 aa  103  9e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0471  beta-lactamase  30.5 
 
 
616 aa  103  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3500  beta-lactamase  27.15 
 
 
600 aa  103  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.623073  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2353  penicillin-binding protein  29.53 
 
 
481 aa  102  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000218323  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3669  beta-lactamase  29.18 
 
 
507 aa  102  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1230  beta-lactamase  26.21 
 
 
455 aa  101  4e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1263  beta-lactamase-like protein  26.21 
 
 
455 aa  101  4e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0468  beta-lactamase  27.91 
 
 
455 aa  101  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000926021 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8721  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  31.35 
 
 
480 aa  101  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  25.7 
 
 
505 aa  100  9e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2629  putative penicillin-binding protein  28.5 
 
 
490 aa  99.8  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0110315  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0318  beta-lactamase  24.54 
 
 
365 aa  99  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.180634 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0201  beta-lactamase  32.71 
 
 
530 aa  98.2  4e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.494145 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1946  Beta-lactamase  24.77 
 
 
588 aa  97.8  5e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2481  beta-lactamase  26.21 
 
 
359 aa  97.8  6e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1519  beta-lactamase  29.28 
 
 
410 aa  97.8  6e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2987  beta-lactamase  26.58 
 
 
526 aa  97.8  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.204407  normal  0.639877 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0973  beta-lactamase  25 
 
 
514 aa  97.4  7e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1783  cyclic peptide transporter  26.39 
 
 
1055 aa  97.4  7e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2389  cyclic peptide transporter  25.91 
 
 
1032 aa  97.4  8e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4159  beta-lactamase  24.8 
 
 
544 aa  97.1  9e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0453527  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  31.66 
 
 
377 aa  97.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2336  beta-lactamase  25.83 
 
 
359 aa  97.1  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0999  beta-lactamase  27.76 
 
 
367 aa  96.7  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0117018 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2573  beta-lactamase  29.67 
 
 
476 aa  97.1  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.369136  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1357  beta-lactamase  28.44 
 
 
378 aa  97.1  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4636  beta-lactamase  29.41 
 
 
496 aa  96.3  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3058  beta-lactamase  28.52 
 
 
398 aa  96.7  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1818  beta-lactamase  33.01 
 
 
513 aa  96.7  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0963  beta-lactamase  31.51 
 
 
423 aa  97.1  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.146357  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2544  putative penicillin-binding protein  27.98 
 
 
483 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4882  beta-lactamase  25.65 
 
 
497 aa  95.1  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1460  beta-lactamase  27.5 
 
 
523 aa  95.5  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0171679  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41280  putative beta-lactamase  25.85 
 
 
610 aa  94.7  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.607486 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1528  beta-lactamase  27.99 
 
 
410 aa  94.7  4e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04833  beta-lactamase  27.43 
 
 
529 aa  95.1  4e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2827  beta-lactamase  27.99 
 
 
410 aa  94.7  5e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.620293  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1164  beta-lactamase  26.26 
 
 
501 aa  94.4  7e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5771  beta-lactamase  35.64 
 
 
711 aa  94.4  7e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1788  beta-lactamase  30.72 
 
 
560 aa  94  8e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.358741  normal  0.761746 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3062  beta-lactamase  30.39 
 
 
614 aa  93.2  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.367625  hitchhiker  0.002383 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5864  beta-lactamase  34.33 
 
 
389 aa  93.2  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3274  beta-lactamase  27.23 
 
 
524 aa  93.2  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.847415 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5338  beta-lactamase  31.8 
 
 
525 aa  93.2  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.271651  normal  0.211898 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0675  beta-lactamase  25.36 
 
 
377 aa  93.6  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4621  beta-lactamase  26.67 
 
 
377 aa  93.6  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0889352 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3840  Beta-lactamase  26.67 
 
 
377 aa  92.8  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1554  beta-lactamase  27.73 
 
 
410 aa  92.4  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3512  beta-lactamase  26.58 
 
 
364 aa  92.8  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4709  beta-lactamase  26.39 
 
 
377 aa  92.4  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5593  beta-lactamase  29.15 
 
 
480 aa  92  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4833  beta-lactamase  26.02 
 
 
405 aa  91.7  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0653  beta-lactamase  29.74 
 
 
531 aa  91.7  4e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1375  beta-lactamase  30.62 
 
 
491 aa  91.7  4e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3860  beta-lactamase  26.67 
 
 
377 aa  91.7  4e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.027383 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  30.25 
 
 
356 aa  91.3  5e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>