More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4076 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4076  beta-lactamase  100 
 
 		 566 aa  1113    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8154  beta-lactamase  61.54 
 
 		 550 aa  546  1e-154  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1064  beta-lactamase  55.07 
 
 		 544 aa  530  1e-149  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0693  beta-lactamase  52.64 
 
 		 530 aa  481  1e-134  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.750269  normal  0.541197 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10925  hypothetical protein  51.03 
 
 		 562 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4657  beta-lactamase  49.3 
 
 		 485 aa  437  1e-121  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4990  beta-lactamase  49.32 
 
 		 531 aa  434  1e-120  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1757  beta-lactamase  48.59 
 
 		 531 aa  429  1e-119  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1625  beta-lactamase  49.1 
 
 		 533 aa  428  1e-118  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.170379  normal  0.921213 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4429  beta-lactamase  49.31 
 
 		 533 aa  426  1e-118  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4516  beta-lactamase  49.31 
 
 		 533 aa  426  1e-118  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4810  beta-lactamase  49.31 
 
 		 533 aa  426  1e-118  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0653  beta-lactamase  48.13 
 
 		 531 aa  411  1e-113  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6123  beta-lactamase  47.39 
 
 		 536 aa  407  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.299024  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0735  beta-lactamase  45.35 
 
 		 551 aa  395  1e-109  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4610  beta-lactamase  46.72 
 
 		 533 aa  393  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0702461  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4420  beta-lactamase  46.14 
 
 		 519 aa  384  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4050  beta-lactamase  46.14 
 
 		 519 aa  384  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.817302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0805  beta-lactamase  45.49 
 
 		 519 aa  345  1e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2632  beta-lactamase  39.51 
 
 		 503 aa  294  4e-78  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.119708  hitchhiker  0.000636173 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0822  6Fe-6S prismane cluster-containing protein-like protein  38.92 
 
 		 455 aa  276  7e-73  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3247  beta-lactamase  32.36 
 
 		 513 aa  210  6e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1234  beta-lactamase  32.02 
 
 		 519 aa  196  1e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565811  normal  0.301621 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4159  beta-lactamase  31.07 
 
 		 544 aa  194  3e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0453527  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2343  beta-lactamase  29.42 
 
 		 803 aa  189  8e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.23617 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2813  beta-lactamase  32.92 
 
 		 499 aa  182  1e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2987  beta-lactamase  29.31 
 
 		 526 aa  181  4e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.204407  normal  0.639877 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3106  hypothetical protein  28.57 
 
 		 485 aa  179  8e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000134591 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2081  hypothetical protein  29.3 
 
 		 485 aa  179  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.765888  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2235  hypothetical protein  29.3 
 
 		 485 aa  179  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.336147  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2262  hypothetical protein  29.3 
 
 		 485 aa  178  3e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.60427e-26 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2018  penicillin-binding protein  29.3 
 
 		 485 aa  177  4e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.225321  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2218  hypothetical protein  28.76 
 
 		 485 aa  177  6e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1638  beta-lactamase  28.1 
 
 		 485 aa  177  6e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0331332  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2018  penicillin-binding protein  28.85 
 
 		 485 aa  176  7e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2264  hypothetical protein  28.41 
 
 		 485 aa  173  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.145649  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2060  beta-lactamase  28.38 
 
 		 485 aa  173  7.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.258254  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04833  beta-lactamase  30.94 
 
 		 529 aa  172  2e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2346  hypothetical protein  28.04 
 
 		 485 aa  170  7e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0051399  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1298  beta-lactamase  28.81 
 
 		 566 aa  167  5e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2539  beta-lactamase  30.32 
 
 		 567 aa  159  9e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.470437  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1460  beta-lactamase  28.66 
 
 		 523 aa  159  1e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0171679  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0154  beta-lactamase  26.41 
 
 		 526 aa  157  6e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0467  beta-lactamase  26.13 
 
 		 520 aa  150  6e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0343  beta-lactamase  31.59 
 
 		 517 aa  146  9e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.6779 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4882  beta-lactamase  27.2 
 
 		 497 aa  145  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1055  beta-lactamase  32.11 
 
 		 547 aa  144  6e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427639  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09923  hypothetical protein  24.52 
 
 		 591 aa  141  1.9999999999999998e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.916627  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1230  beta-lactamase  29.86 
 
 		 455 aa  134  3e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1263  beta-lactamase-like protein  29.59 
 
 		 455 aa  134  6e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1621  beta-lactamase  27.78 
 
 		 426 aa  132  2.0000000000000002e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.193235  normal  0.330681 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01660  beta-lactamase  32.11 
 
 		 447 aa  130  7.000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.142612  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1968  beta-lactamase  26.69 
 
 		 380 aa  127  7e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.103464 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4133  beta-lactamase  31.4 
 
 		 822 aa  124  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.668063  normal  0.0496796 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1867  beta-lactamase  25.68 
 
 		 517 aa  124  5e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0109165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1134  beta-lactamase  31.01 
 
 		 603 aa  124  5e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.260461 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2979  beta-lactamase  29.28 
 
 		 655 aa  122  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3068  beta-lactamase  30.47 
 
 		 466 aa  122  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.129348 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2498  beta-lactamase  27.13 
 
 		 385 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0428857  normal  0.830123 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2118  beta-lactamase  25.53 
 
 		 389 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.146261  normal  0.0898893 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2068  beta-lactamase  25.59 
 
 		 385 aa  115  3e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.567046  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  27.71 
 
 		 595 aa  113  7.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1514  beta-lactamase  27.32 
 
 		 620 aa  112  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00027695  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11747  penicillin-binding protein  29.97 
 
 		 539 aa  113  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.47398 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  26.63 
 
 		 601 aa  105  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4706  beta-lactamase  30.7 
 
 		 444 aa  104  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0675  beta-lactamase  27.51 
 
 		 377 aa  102  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0116  beta-lactamase  26.01 
 
 		 453 aa  100  9e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4257  beta-lactamase  27.62 
 
 		 464 aa  100  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3874  beta-lactamase  28.75 
 
 		 359 aa  99  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3032  beta-lactamase  32.13 
 
 		 507 aa  98.6  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.436003 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  27.22 
 
 		 362 aa  97.8  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0759  putative beta-lactamase class C penicillin binding protein  28.33 
 
 		 498 aa  97.8  4e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445171  normal  0.118882 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2143  beta-lactamase  28.39 
 
 		 401 aa  96.7  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.559529  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  27.89 
 
 		 356 aa  96.7  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1946  Beta-lactamase  25.27 
 
 		 588 aa  95.5  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1018  beta-lactamase  29.97 
 
 		 461 aa  95.9  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.624623 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3362  beta-lactamase  29.81 
 
 		 717 aa  94.4  5e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.450789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2174  beta-lactamase  23.65 
 
 		 429 aa  94  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6467  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  26.63 
 
 		 551 aa  94  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.341842  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2236  beta-lactamase  23.7 
 
 		 428 aa  92.8  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4688  beta-lactamase  26.51 
 
 		 462 aa  92.4  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.331113  normal  0.125502 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  23.37 
 
 		 505 aa  91.3  4e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0370  beta-lactamase  27.25 
 
 		 403 aa  91.3  4e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.405453  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1414  putative beta-lactamase  24.23 
 
 		 399 aa  90.5  8e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.182511  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1951  beta-lactamase  29.4 
 
 		 369 aa  89.7  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03893  putative beta-lactamase  27.08 
 
 		 363 aa  89.4  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.616435  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2779  beta-lactamase  28.21 
 
 		 445 aa  89.4  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000737728  hitchhiker  0.0000305116 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2357  beta-lactamase  26.7 
 
 		 368 aa  88.6  3e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0335  hypothetical protein  25.53 
 
 		 533 aa  88.2  4e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0934  beta-lactamase  26.86 
 
 		 475 aa  87.4  7e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000419238  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  24.18 
 
 		 477 aa  87  9e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1788  beta-lactamase  27.78 
 
 		 560 aa  86.3  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.358741  normal  0.761746 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1783  cyclic peptide transporter  25.51 
 
 		 1055 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6025  beta-lactamase  27.36 
 
 		 460 aa  85.5  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.565651 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1671  beta-lactamase  27.11 
 
 		 633 aa  85.5  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2353  penicillin-binding protein  23.34 
 
 		 481 aa  84.7  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000218323  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0201  beta-lactamase  29.08 
 
 		 530 aa  83.6  0.000000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.494145 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2968  beta-lactamase  23.75 
 
 		 462 aa  83.6  0.000000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5338  beta-lactamase  27.63 
 
 		 525 aa  83.6  0.000000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.271651  normal  0.211898 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>