More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1951 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1951  beta-lactamase  100 
 
 		 369 aa  728    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2357  beta-lactamase  38.37 
 
 		 368 aa  213  2.9999999999999995e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1021  beta-lactamase  35.76 
 
 		 353 aa  151  1e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.627803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4159  beta-lactamase  26.53 
 
 		 544 aa  105  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0453527  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5525  beta-lactamase  28.37 
 
 		 357 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.434559  normal  0.445851 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2539  beta-lactamase  27.87 
 
 		 567 aa  97.8  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.470437  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1219  beta-lactamase  20.94 
 
 		 357 aa  94  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.705817  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2813  beta-lactamase  31.73 
 
 		 499 aa  88.2  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3518  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  27.9 
 
 		 508 aa  86.7  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1625  beta-lactamase  26.98 
 
 		 533 aa  85.5  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.170379  normal  0.921213 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1968  beta-lactamase  22.32 
 
 		 380 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.103464 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1013  beta-lactamase  29.06 
 
 		 449 aa  84.3  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4429  beta-lactamase  27 
 
 		 533 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4516  beta-lactamase  27 
 
 		 533 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4810  beta-lactamase  27 
 
 		 533 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3247  beta-lactamase  27.23 
 
 		 513 aa  83.6  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4076  beta-lactamase  29.4 
 
 		 566 aa  83.2  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0154  beta-lactamase  23.08 
 
 		 526 aa  82.8  0.000000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1671  beta-lactamase  25.07 
 
 		 633 aa  82.4  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1795  beta-lactamase  25.87 
 
 		 494 aa  82.4  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.478102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1134  beta-lactamase  23.18 
 
 		 603 aa  81.6  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.260461 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2018  penicillin-binding protein  22.34 
 
 		 485 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1465  beta-lactamase  25.79 
 
 		 657 aa  81.6  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.16455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2415  beta-lactamase  28.48 
 
 		 442 aa  81.6  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0834226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2632  beta-lactamase  25.83 
 
 		 503 aa  81.6  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.119708  hitchhiker  0.000636173 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2218  hypothetical protein  21.86 
 
 		 485 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1018  beta-lactamase  28.94 
 
 		 461 aa  80.9  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.624623 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  26.07 
 
 		 966 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3106  hypothetical protein  22.83 
 
 		 485 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000134591 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1298  beta-lactamase  23.28 
 
 		 566 aa  79.7  0.00000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2068  beta-lactamase  22.1 
 
 		 385 aa  79.7  0.00000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.567046  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0606  serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.1 
 
 		 438 aa  79.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4257  beta-lactamase  27.07 
 
 		 464 aa  79  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1867  beta-lactamase  24.31 
 
 		 517 aa  79.3  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0109165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2987  beta-lactamase  22.46 
 
 		 526 aa  79.3  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.204407  normal  0.639877 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1460  beta-lactamase  26.26 
 
 		 523 aa  78.2  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0171679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4610  beta-lactamase  27.07 
 
 		 533 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0702461  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6025  beta-lactamase  25.91 
 
 		 460 aa  77.4  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.565651 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0693  beta-lactamase  24.58 
 
 		 530 aa  77.4  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.750269  normal  0.541197 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0973  beta-lactamase  22.41 
 
 		 514 aa  77.4  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4882  beta-lactamase  25.36 
 
 		 497 aa  77  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2264  hypothetical protein  22.34 
 
 		 485 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.145649  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2137  beta-lactamase  29.97 
 
 		 366 aa  76.6  0.0000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.113996 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1621  beta-lactamase  20.91 
 
 		 426 aa  76.6  0.0000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.193235  normal  0.330681 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0201  beta-lactamase  26.78 
 
 		 530 aa  76.6  0.0000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.494145 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4058  beta-lactamase  26.52 
 
 		 405 aa  75.9  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00809672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04833  beta-lactamase  25.25 
 
 		 529 aa  75.5  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2018  penicillin-binding protein  21.8 
 
 		 485 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.225321  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4420  beta-lactamase  30.24 
 
 		 519 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2118  beta-lactamase  22.06 
 
 		 389 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.146261  normal  0.0898893 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2262  hypothetical protein  21.8 
 
 		 485 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.60427e-26 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0653  beta-lactamase  27.82 
 
 		 531 aa  75.9  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0618  beta-lactamase  25.4 
 
 		 450 aa  75.9  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2081  hypothetical protein  21.8 
 
 		 485 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.765888  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2235  hypothetical protein  21.8 
 
 		 485 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.336147  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0335  hypothetical protein  23.61 
 
 		 533 aa  75.1  0.000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2932  penicillin-binding protein  23.31 
 
 		 513 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4765  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  26.54 
 
 		 514 aa  74.3  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.263187 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  23.1 
 
 		 578 aa  73.9  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5714  beta-lactamase  27.09 
 
 		 446 aa  73.9  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3068  beta-lactamase  24.86 
 
 		 466 aa  73.9  0.000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.129348 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2650  beta-lactamase  26.5 
 
 		 497 aa  73.2  0.000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0361544  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01660  beta-lactamase  27.2 
 
 		 447 aa  72.8  0.000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.142612  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  25.66 
 
 		 362 aa  72.8  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3984  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.52 
 
 		 390 aa  72  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4050  beta-lactamase  29.76 
 
 		 519 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.817302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  24.63 
 
 		 477 aa  72.4  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0034  alkaline D-peptidase  29 
 
 		 392 aa  72  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.698522 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2997  beta-lactamase  23.68 
 
 		 513 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0412  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  22.19 
 
 		 422 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2043  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.94 
 
 		 421 aa  72  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.956781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0570  alkaline D-peptidase  28.82 
 
 		 370 aa  72  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3177  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  26.2 
 
 		 484 aa  71.6  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.075148  normal  0.866618 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3027  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27.88 
 
 		 406 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.899556  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2384  beta-lactamase  20.62 
 
 		 483 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2587  putative penicillin-binding protein  21.32 
 
 		 463 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35213e-17 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09923  hypothetical protein  21.03 
 
 		 591 aa  70.9  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.916627  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2498  beta-lactamase  22.39 
 
 		 385 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0428857  normal  0.830123 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4325  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.86 
 
 		 405 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0248121  normal  0.0483573 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0483  putative penicillin-binding protein  22.19 
 
 		 412 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0473  penicillin-binding protein  22.19 
 
 		 421 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2400  penicillin-binding protein  21.32 
 
 		 481 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443561  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4519  beta-lactamase  27.17 
 
 		 451 aa  70.9  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.302372  normal  0.700128 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0502  penicillin-binding protein  22.19 
 
 		 412 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2575  penicillin-binding protein  21.32 
 
 		 481 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  24.86 
 
 		 601 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2953  beta-lactamase  21.13 
 
 		 513 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2353  penicillin-binding protein  21.32 
 
 		 481 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000218323  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4308  beta-lactamase  24.44 
 
 		 650 aa  70.5  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.805936  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4094  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.86 
 
 		 405 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4170  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.86 
 
 		 405 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0368  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.61 
 
 		 399 aa  70.1  0.00000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00562308  normal  0.495103 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2544  putative penicillin-binding protein  20.48 
 
 		 483 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0558  putative penicillin-binding protein  22.19 
 
 		 413 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.622752  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1230  beta-lactamase  23.87 
 
 		 455 aa  69.7  0.00000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1263  beta-lactamase-like protein  23.87 
 
 		 455 aa  69.7  0.00000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4368  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.57 
 
 		 416 aa  69.7  0.00000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041515 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1094  beta-lactamase  28.51 
 
 		 349 aa  69.7  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3872  beta-lactamase  21.89 
 
 		 375 aa  69.3  0.00000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  26.77 
 
 		 377 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>