170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1219 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1219  beta-lactamase  100 
 
 		 357 aa  738    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.705817  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5525  beta-lactamase  44.16 
 
 		 357 aa  322  7e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.434559  normal  0.445851 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2357  beta-lactamase  27.88 
 
 		 368 aa  117  5e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1951  beta-lactamase  20.94 
 
 		 369 aa  94.4  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1136  beta-lactamase  23.93 
 
 		 357 aa  70.9  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.167829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3247  beta-lactamase  23.92 
 
 		 513 aa  68.9  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2539  beta-lactamase  24.9 
 
 		 567 aa  67.4  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.470437  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2813  beta-lactamase  23.36 
 
 		 499 aa  66.6  0.0000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0618  beta-lactamase  29.67 
 
 		 450 aa  65.9  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1018  beta-lactamase  24.89 
 
 		 461 aa  64.3  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.624623 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5618  beta-lactamase  23.92 
 
 		 456 aa  62  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357665  normal  0.013094 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2539  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  26.64 
 
 		 445 aa  62  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1021  beta-lactamase  23.67 
 
 		 353 aa  60.8  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.627803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3068  beta-lactamase  22.41 
 
 		 466 aa  61.2  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.129348 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1621  beta-lactamase  24.45 
 
 		 426 aa  60.1  0.00000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.193235  normal  0.330681 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4420  beta-lactamase  30.61 
 
 		 519 aa  59.3  0.00000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2987  beta-lactamase  23.28 
 
 		 526 aa  58.9  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.204407  normal  0.639877 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4882  beta-lactamase  23.71 
 
 		 497 aa  58.9  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2118  beta-lactamase  25.88 
 
 		 389 aa  58.9  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.146261  normal  0.0898893 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1885  hypothetical protein  25.12 
 
 		 420 aa  58.2  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1874  hypothetical protein  25.12 
 
 		 420 aa  58.2  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  22.83 
 
 		 446 aa  58.2  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2143  beta-lactamase  20.06 
 
 		 401 aa  58.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.559529  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4050  beta-lactamase  32.67 
 
 		 519 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.817302  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13238  penicillin-binding protein, putative  22.29 
 
 		 431 aa  57.8  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.652866  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09923  hypothetical protein  25.12 
 
 		 591 aa  57.8  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.916627  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2498  beta-lactamase  24.86 
 
 		 385 aa  57.4  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0428857  normal  0.830123 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3534  amino acid adenylation  24 
 
 		 2457 aa  57  0.0000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  27.81 
 
 		 487 aa  56.6  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5306  beta-lactamase  24.48 
 
 		 411 aa  56.2  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1876  beta-lactamase  23.87 
 
 		 493 aa  56.2  0.0000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1263  beta-lactamase-like protein  23.19 
 
 		 455 aa  56.2  0.0000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2068  beta-lactamase  30.85 
 
 		 385 aa  56.2  0.0000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.567046  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4257  beta-lactamase  22.52 
 
 		 464 aa  56.2  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1460  beta-lactamase  24 
 
 		 523 aa  55.5  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0171679  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0201  beta-lactamase  21.74 
 
 		 530 aa  55.5  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.494145 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6025  beta-lactamase  24.9 
 
 		 460 aa  55.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.565651 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1230  beta-lactamase  22.83 
 
 		 455 aa  54.7  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1514  beta-lactamase  25.89 
 
 		 620 aa  54.3  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00027695  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1298  beta-lactamase  21.78 
 
 		 566 aa  54.7  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4325  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  22.86 
 
 		 405 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0248121  normal  0.0483573 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5013  alkaline D-peptidase  23.95 
 
 		 374 aa  54.3  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394865  normal  0.0638413 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2979  beta-lactamase  29.84 
 
 		 655 aa  53.9  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5715  beta-lactamase  21.94 
 
 		 437 aa  53.5  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2727  beta-lactamase  22.81 
 
 		 486 aa  53.1  0.000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0471  beta-lactamase  22.62 
 
 		 616 aa  53.1  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2343  beta-lactamase  26.34 
 
 		 803 aa  53.1  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.23617 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0693  beta-lactamase  28.87 
 
 		 530 aa  53.1  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.750269  normal  0.541197 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5714  beta-lactamase  21.67 
 
 		 446 aa  52.8  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2632  beta-lactamase  23.22 
 
 		 503 aa  52.8  0.000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.119708  hitchhiker  0.000636173 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  21.96 
 
 		 505 aa  52.4  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4094  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  23.78 
 
 		 405 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4159  beta-lactamase  20.7 
 
 		 544 aa  52.4  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0453527  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4170  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  23.78 
 
 		 405 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4155  beta-lactamase  27.22 
 
 		 378 aa  52.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222212  normal  0.15208 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3391  beta-lactamase  24.86 
 
 		 420 aa  52.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2194  beta-lactamase  25.99 
 
 		 334 aa  51.6  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.724545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3177  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  22.18 
 
 		 484 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.075148  normal  0.866618 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12878  beta-lactamase, putative  23.62 
 
 		 504 aa  52  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4308  beta-lactamase  20.68 
 
 		 650 aa  51.6  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.805936  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2095  hypothetical protein  29.89 
 
 		 484 aa  51.2  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.187143  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1119  hypothetical protein  23.49 
 
 		 371 aa  50.8  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1351  beta-lactamase class C-like protein  25.96 
 
 		 384 aa  51.2  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.512666 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3518  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  22.62 
 
 		 508 aa  51.2  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4657  beta-lactamase  26.79 
 
 		 485 aa  51.2  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1625  beta-lactamase  26.37 
 
 		 533 aa  51.2  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.170379  normal  0.921213 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1750  beta-lactamase  24.18 
 
 		 375 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.339251  normal  0.99151 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3507  penicillin-binding protein, putative  23.48 
 
 		 375 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1414  putative beta-lactamase  24.15 
 
 		 399 aa  50.8  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.182511  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0772  beta-lactamase  27.48 
 
 		 431 aa  50.4  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0636  beta-lactam binding protein AmpH  22.83 
 
 		 380 aa  50.8  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.259822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1795  beta-lactamase  22.57 
 
 		 494 aa  50.8  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.478102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3518  putative penicillin-binding protein  23.48 
 
 		 377 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3264  beta-lactamase  23.48 
 
 		 377 aa  50.4  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.664291  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  25.84 
 
 		 377 aa  50.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3208  beta-lactamase  23.48 
 
 		 377 aa  49.7  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0230735  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4691  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  20.64 
 
 		 383 aa  49.7  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1867  beta-lactamase  23.72 
 
 		 517 aa  49.7  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0109165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01660  beta-lactamase  22.99 
 
 		 447 aa  49.7  0.00007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.142612  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0435  5,10-methylenetetrahydrofolate reductase  25.43 
 
 		 342 aa  49.7  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3294  penicillin-binding protein  23.48 
 
 		 377 aa  49.3  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.678008  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3554  penicillin-binding protein  23.48 
 
 		 377 aa  49.3  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2587  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  25.57 
 
 		 413 aa  49.3  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.607083  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3511  putative penicillin-binding protein  23.48 
 
 		 377 aa  49.3  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1123  hypothetical protein  22.89 
 
 		 371 aa  48.9  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1072  Beta-lactamase  24.74 
 
 		 412 aa  48.9  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2996  beta-lactamase  20.85 
 
 		 479 aa  49.3  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.168493 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2316  beta-lactamase  24.34 
 
 		 467 aa  49.3  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0048462  decreased coverage  0.0000015739 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1906  beta-lactamase  21.68 
 
 		 369 aa  49.3  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0563  beta-lactamase  22.31 
 
 		 506 aa  49.3  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000636485 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8711  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  23.33 
 
 		 383 aa  48.9  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0541056  normal  0.0995944 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0467  beta-lactamase  22.75 
 
 		 520 aa  49.3  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1638  beta-lactamase  20.73 
 
 		 485 aa  48.9  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0331332  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3498  beta-lactamase  25.34 
 
 		 375 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4511  beta-lactamase  23.53 
 
 		 555 aa  48.1  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.480191  normal  0.743211 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2896  alkaline D-peptidase  22.45 
 
 		 383 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.243898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2647  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  24.32 
 
 		 429 aa  48.5  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.180779  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1164  beta-lactamase  25.14 
 
 		 501 aa  48.5  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5771  beta-lactamase  22.71 
 
 		 711 aa  48.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6210  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  20.67 
 
 		 391 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126759  normal  0.402021 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>