More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5618 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5618  beta-lactamase  100 
 
 
456 aa  927    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357665  normal  0.013094 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6025  beta-lactamase  66.01 
 
 
460 aa  629  1e-179  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.565651 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3177  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  58.98 
 
 
484 aa  507  9.999999999999999e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.075148  normal  0.866618 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1018  beta-lactamase  38.84 
 
 
461 aa  289  8e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.624623 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5715  beta-lactamase  38.98 
 
 
437 aa  285  1.0000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0772  beta-lactamase  41.08 
 
 
431 aa  244  1.9999999999999999e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5714  beta-lactamase  38.76 
 
 
446 aa  244  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6467  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  33.33 
 
 
551 aa  243  5e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.341842  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4257  beta-lactamase  38.79 
 
 
464 aa  243  7.999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4688  beta-lactamase  34.79 
 
 
462 aa  227  3e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.331113  normal  0.125502 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0468  beta-lactamase  38.79 
 
 
455 aa  218  1e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000926021 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11747  penicillin-binding protein  34.05 
 
 
539 aa  176  9e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.47398 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1710  beta-lactamase  31.73 
 
 
463 aa  161  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.903063 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5327  beta-lactamase  35.87 
 
 
440 aa  153  8e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.620258 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0683  Beta-lactamase  31.1 
 
 
530 aa  144  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.564885  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4308  beta-lactamase  34.62 
 
 
459 aa  125  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0244726  normal  0.721784 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1171  beta-lactamase  26.42 
 
 
455 aa  124  3e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0973  beta-lactamase  27.65 
 
 
514 aa  123  7e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  28.29 
 
 
595 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1946  Beta-lactamase  27.57 
 
 
588 aa  117  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0335  hypothetical protein  28.08 
 
 
533 aa  114  5e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4308  beta-lactamase  28.53 
 
 
650 aa  113  8.000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.805936  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0201  beta-lactamase  29.97 
 
 
530 aa  111  3e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.494145 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0154  beta-lactamase  28.17 
 
 
526 aa  110  5e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  26.82 
 
 
601 aa  109  9.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2346  hypothetical protein  25.49 
 
 
485 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0051399  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  37.17 
 
 
477 aa  108  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2991  beta-lactamase  27.84 
 
 
475 aa  107  3e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2650  beta-lactamase  29.19 
 
 
497 aa  107  4e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0361544  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1234  beta-lactamase  28.69 
 
 
519 aa  107  5e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565811  normal  0.301621 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2539  beta-lactamase  28.83 
 
 
567 aa  105  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.470437  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3032  beta-lactamase  29 
 
 
507 aa  105  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.436003 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0471  beta-lactamase  30.43 
 
 
616 aa  105  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1460  beta-lactamase  29.64 
 
 
523 aa  105  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0171679  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2989  penicillin-binding protein  28 
 
 
691 aa  104  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3214  penicillin-binding protein  28 
 
 
691 aa  104  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38843  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2262  hypothetical protein  24.65 
 
 
485 aa  104  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.60427e-26 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2036  putative penicillin-binding protein  27.92 
 
 
691 aa  104  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1755  beta-lactamase  31.54 
 
 
450 aa  104  4e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2018  penicillin-binding protein  24.65 
 
 
485 aa  103  5e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.225321  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3223  putative penicillin-binding protein  26.75 
 
 
691 aa  103  8e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2264  hypothetical protein  24.65 
 
 
485 aa  103  9e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.145649  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2997  beta-lactamase  25.7 
 
 
513 aa  103  9e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3106  hypothetical protein  24.36 
 
 
485 aa  102  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000134591 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8721  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  29.72 
 
 
480 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0291  beta-lactamase class C domain-containing protein  24.63 
 
 
519 aa  102  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000012653  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04833  beta-lactamase  27.35 
 
 
529 aa  102  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2573  fmtA-like protein, putative  25.23 
 
 
482 aa  102  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00911316  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0095  beta-lactamase  27.65 
 
 
580 aa  102  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2916  penicillin-binding protein  27.35 
 
 
691 aa  101  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5620  beta-lactamase  31.58 
 
 
417 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.141617  normal  0.875115 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2081  hypothetical protein  24.08 
 
 
485 aa  101  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.765888  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0154  beta-lactamase  24.92 
 
 
482 aa  101  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2235  hypothetical protein  24.08 
 
 
485 aa  101  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.336147  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6425  beta-lactamase  28.4 
 
 
437 aa  101  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.102177  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3018  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.98 
 
 
389 aa  101  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.470862  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1638  beta-lactamase  24.12 
 
 
485 aa  101  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0331332  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3702  beta-lactamase  30.4 
 
 
430 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0934  beta-lactamase  25.15 
 
 
475 aa  100  6e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000419238  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2587  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  25.91 
 
 
413 aa  100  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.607083  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2932  penicillin-binding protein  25.14 
 
 
513 aa  100  7e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3873  amino acid adenylation domain protein  28.92 
 
 
5698 aa  100  7e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.166545 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1955  beta-lactamase  28.96 
 
 
694 aa  100  7e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.1377  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01660  beta-lactamase  26.98 
 
 
447 aa  99.8  8e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.142612  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2343  beta-lactamase  28.36 
 
 
803 aa  99.8  8e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.23617 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2616  beta-lactamase  25.66 
 
 
353 aa  99.8  9e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3669  beta-lactamase  28.08 
 
 
507 aa  99.8  9e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5338  beta-lactamase  29.91 
 
 
525 aa  99.8  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.271651  normal  0.211898 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1514  beta-lactamase  28.28 
 
 
620 aa  99.8  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00027695  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3206  beta-lactamase  28.48 
 
 
389 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2060  beta-lactamase  23.96 
 
 
485 aa  99.4  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.258254  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2987  beta-lactamase  26.79 
 
 
526 aa  99.4  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.204407  normal  0.639877 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0099  D-stereospecific peptide hydrolase  28.12 
 
 
443 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000129924  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3247  beta-lactamase  25 
 
 
513 aa  99  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4511  beta-lactamase  27.22 
 
 
555 aa  98.6  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.480191  normal  0.743211 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0618  beta-lactamase  30.45 
 
 
450 aa  98.6  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2218  hypothetical protein  23.8 
 
 
485 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2573  beta-lactamase  24.85 
 
 
476 aa  98.2  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.369136  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1311  beta-lactamase  27.27 
 
 
669 aa  98.2  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00893  putative non-ribosomal peptide synthetase  27.4 
 
 
504 aa  98.2  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4159  beta-lactamase  27.61 
 
 
544 aa  97.8  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0453527  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0098  beta-lactamase  27 
 
 
691 aa  97.4  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3205  putative penicillin-binding protein  27.01 
 
 
694 aa  97.4  5e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3243  beta-lactamase family protein  24.13 
 
 
513 aa  97.1  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2953  beta-lactamase  23.59 
 
 
513 aa  97.1  6e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9203  beta-lactamase  26.84 
 
 
635 aa  97.1  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.606578 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3030  alkaline D-peptidase  29.23 
 
 
388 aa  97.1  6e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  30.56 
 
 
966 aa  96.7  7e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2576  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  27.88 
 
 
389 aa  96.7  7e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.145811 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3069  alkaline D-peptidase  28.91 
 
 
388 aa  96.7  8e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0417304  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2769  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  28.57 
 
 
389 aa  96.7  8e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.48212  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3027  alkaline D-peptidase  28.57 
 
 
388 aa  96.7  8e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2819  alkaline D-peptidase  28.57 
 
 
388 aa  96.3  9e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118082  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3033  alkaline d-peptidase  28.57 
 
 
388 aa  96.3  9e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.400662  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3163  beta-lactamase  30.06 
 
 
862 aa  95.9  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111664  normal  0.813914 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3362  beta-lactamase  27.03 
 
 
717 aa  96.3  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.450789  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3017  beta-lactamase  28.62 
 
 
694 aa  96.3  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151965  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33850  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  29.89 
 
 
453 aa  95.9  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3068  beta-lactamase  26.11 
 
 
466 aa  95.5  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.129348 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0822  6Fe-6S prismane cluster-containing protein-like protein  25.9 
 
 
455 aa  95.1  2e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>