More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_6025 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_6025  beta-lactamase  100 
 
 		 460 aa  938    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.565651 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5618  beta-lactamase  66.01 
 
 		 456 aa  629  1e-179  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357665  normal  0.013094 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3177  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  54.08 
 
 		 484 aa  475  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.075148  normal  0.866618 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1018  beta-lactamase  40.53 
 
 		 461 aa  296  6e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.624623 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5715  beta-lactamase  40.35 
 
 		 437 aa  293  6e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5714  beta-lactamase  36.01 
 
 		 446 aa  233  5e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4257  beta-lactamase  37.04 
 
 		 464 aa  232  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6467  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  36.25 
 
 		 551 aa  230  5e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.341842  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0772  beta-lactamase  37.2 
 
 		 431 aa  221  1.9999999999999999e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4688  beta-lactamase  36.22 
 
 		 462 aa  221  3e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.331113  normal  0.125502 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0468  beta-lactamase  37.89 
 
 		 455 aa  204  3e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000926021 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11747  penicillin-binding protein  31.27 
 
 		 539 aa  178  2e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.47398 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1710  beta-lactamase  31.94 
 
 		 463 aa  162  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.903063 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5327  beta-lactamase  33.33 
 
 		 440 aa  146  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.620258 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0683  Beta-lactamase  29.92 
 
 		 530 aa  137  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.564885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1171  beta-lactamase  26.82 
 
 		 455 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4308  beta-lactamase  32.44 
 
 		 650 aa  120  3.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.805936  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  28.39 
 
 		 595 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  30.59 
 
 		 601 aa  117  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0973  beta-lactamase  25.73 
 
 		 514 aa  117  6e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8721  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  31.55 
 
 		 480 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2989  penicillin-binding protein  27.56 
 
 		 691 aa  111  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3214  penicillin-binding protein  27.56 
 
 		 691 aa  111  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38843  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1946  Beta-lactamase  28.87 
 
 		 588 aa  110  5e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2539  beta-lactamase  29.47 
 
 		 567 aa  110  5e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.470437  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2916  penicillin-binding protein  27.33 
 
 		 691 aa  109  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2987  beta-lactamase  24.58 
 
 		 526 aa  108  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.204407  normal  0.639877 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3223  putative penicillin-binding protein  27.25 
 
 		 691 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1638  beta-lactamase  24.85 
 
 		 485 aa  107  3e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0331332  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2650  beta-lactamase  29.56 
 
 		 497 aa  108  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0361544  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2036  putative penicillin-binding protein  27.54 
 
 		 691 aa  107  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0291  beta-lactamase class C domain-containing protein  25.43 
 
 		 519 aa  107  4e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000012653  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1460  beta-lactamase  27.01 
 
 		 523 aa  107  5e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0171679  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5338  beta-lactamase  30.82 
 
 		 525 aa  107  6e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.271651  normal  0.211898 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1234  beta-lactamase  27.62 
 
 		 519 aa  106  7e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565811  normal  0.301621 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0154  beta-lactamase  26.57 
 
 		 526 aa  106  8e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2264  hypothetical protein  24.86 
 
 		 485 aa  105  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.145649  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3032  beta-lactamase  30.42 
 
 		 507 aa  105  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.436003 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1514  beta-lactamase  26.76 
 
 		 620 aa  106  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00027695  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4308  beta-lactamase  32.3 
 
 		 459 aa  105  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0244726  normal  0.721784 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2060  beta-lactamase  23.33 
 
 		 485 aa  105  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.258254  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3247  beta-lactamase  27.76 
 
 		 513 aa  105  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0335  hypothetical protein  28.57 
 
 		 533 aa  105  2e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04833  beta-lactamase  26.82 
 
 		 529 aa  104  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9203  beta-lactamase  28.36 
 
 		 635 aa  103  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.606578 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2346  hypothetical protein  24.58 
 
 		 485 aa  103  7e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0051399  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3106  hypothetical protein  24.79 
 
 		 485 aa  103  8e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000134591 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2218  hypothetical protein  24.58 
 
 		 485 aa  103  9e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2018  penicillin-binding protein  24.29 
 
 		 485 aa  102  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.225321  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2262  hypothetical protein  24.29 
 
 		 485 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.60427e-26 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0471  beta-lactamase  29.56 
 
 		 616 aa  102  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  33.33 
 
 		 477 aa  101  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0201  beta-lactamase  31.33 
 
 		 530 aa  102  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.494145 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4159  beta-lactamase  25 
 
 		 544 aa  101  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0453527  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0095  beta-lactamase  29.05 
 
 		 580 aa  101  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6425  beta-lactamase  29.88 
 
 		 437 aa  100  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.102177  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2081  hypothetical protein  24.01 
 
 		 485 aa  100  4e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.765888  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2235  hypothetical protein  24.01 
 
 		 485 aa  100  4e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.336147  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4591  beta-lactamase  26.28 
 
 		 675 aa  100  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.434255  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1755  beta-lactamase  30 
 
 		 450 aa  100  5e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1955  beta-lactamase  28.28 
 
 		 694 aa  100  5e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.1377  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2343  beta-lactamase  28.36 
 
 		 803 aa  99.8  8e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.23617 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3163  beta-lactamase  30.18 
 
 		 862 aa  99.8  8e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111664  normal  0.813914 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1364  beta-lactamase  28.85 
 
 		 574 aa  99.8  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.185265  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5593  beta-lactamase  29.87 
 
 		 480 aa  99  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0805  beta-lactamase  28.66 
 
 		 519 aa  99  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3205  putative penicillin-binding protein  28.49 
 
 		 694 aa  98.2  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2616  beta-lactamase  24.35 
 
 		 353 aa  98.2  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4511  beta-lactamase  26.4 
 
 		 555 aa  97.4  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.480191  normal  0.743211 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3017  beta-lactamase  29.79 
 
 		 694 aa  97.4  5e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151965  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2018  penicillin-binding protein  24.16 
 
 		 485 aa  97.1  6e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3362  beta-lactamase  27.4 
 
 		 717 aa  97.1  6e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.450789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3287  beta-lactamase  28.75 
 
 		 463 aa  97.1  6e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0209216 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2632  beta-lactamase  26.69 
 
 		 503 aa  96.7  7e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.119708  hitchhiker  0.000636173 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0098  beta-lactamase  28.57 
 
 		 691 aa  96.7  9e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2991  beta-lactamase  25.81 
 
 		 475 aa  96.3  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5607  hypothetical protein  31.58 
 
 		 784 aa  96.3  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2576  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  27.4 
 
 		 389 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.145811 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01660  beta-lactamase  26.59 
 
 		 447 aa  95.5  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.142612  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3742  beta-lactamase  30.87 
 
 		 478 aa  95.5  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.877046  normal  0.0540026 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2602  beta-lactamase  30.91 
 
 		 778 aa  94.7  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2997  beta-lactamase  26.67 
 
 		 513 aa  94.7  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3669  beta-lactamase  28.23 
 
 		 507 aa  94.7  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1839  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  28.14 
 
 		 681 aa  95.1  3e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000051234  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0318  beta-lactamase  23.62 
 
 		 365 aa  94.4  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.180634 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0822  6Fe-6S prismane cluster-containing protein-like protein  24.37 
 
 		 455 aa  94  5e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3518  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  29.97 
 
 		 508 aa  93.6  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5985  beta-lactamase  26.2 
 
 		 342 aa  93.2  9e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3206  beta-lactamase  27.87 
 
 		 389 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2819  alkaline D-peptidase  26.37 
 
 		 388 aa  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118082  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2769  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  26.37 
 
 		 389 aa  91.7  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.48212  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2932  penicillin-binding protein  26.39 
 
 		 513 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3033  alkaline d-peptidase  26.37 
 
 		 388 aa  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.400662  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3030  alkaline D-peptidase  26.95 
 
 		 388 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3485  beta-lactamase  27.96 
 
 		 440 aa  92  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.807296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2384  beta-lactamase  23.9 
 
 		 483 aa  91.7  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0801  beta-lactamase  31.73 
 
 		 478 aa  91.7  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.87828  normal  0.048033 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3549  beta-lactamase  30.32 
 
 		 400 aa  91.3  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3018  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  26.37 
 
 		 389 aa  91.7  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.470862  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3027  alkaline D-peptidase  26.37 
 
 		 388 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>