More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0563 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0563  beta-lactamase  100 
 
 
506 aa  1034    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000636485 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1460  beta-lactamase  26.67 
 
 
523 aa  117  6e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0171679  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1234  beta-lactamase  27.07 
 
 
519 aa  114  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565811  normal  0.301621 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2987  beta-lactamase  27.33 
 
 
526 aa  115  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.204407  normal  0.639877 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04833  beta-lactamase  28.96 
 
 
529 aa  114  5e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2068  beta-lactamase  26.54 
 
 
385 aa  108  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.567046  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3247  beta-lactamase  27.34 
 
 
513 aa  108  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4159  beta-lactamase  26.32 
 
 
544 aa  108  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0453527  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01660  beta-lactamase  27.95 
 
 
447 aa  108  3e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.142612  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1638  beta-lactamase  22.08 
 
 
485 aa  107  5e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0331332  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2060  beta-lactamase  24.68 
 
 
485 aa  103  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.258254  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2346  hypothetical protein  23.26 
 
 
485 aa  103  6e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0051399  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1263  beta-lactamase-like protein  26.79 
 
 
455 aa  103  7e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3106  hypothetical protein  22.34 
 
 
485 aa  102  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000134591 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2264  hypothetical protein  22.39 
 
 
485 aa  102  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.145649  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2262  hypothetical protein  24.73 
 
 
485 aa  102  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.60427e-26 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2018  penicillin-binding protein  24.45 
 
 
485 aa  101  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.225321  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1230  beta-lactamase  26.48 
 
 
455 aa  101  3e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2218  hypothetical protein  23.2 
 
 
485 aa  100  7e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2498  beta-lactamase  25.07 
 
 
385 aa  100  7e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0428857  normal  0.830123 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3068  beta-lactamase  27.78 
 
 
466 aa  100  8e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.129348 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8721  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  26.84 
 
 
480 aa  100  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2081  hypothetical protein  23.49 
 
 
485 aa  99.4  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.765888  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2235  hypothetical protein  23.49 
 
 
485 aa  99.4  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.336147  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1968  beta-lactamase  25 
 
 
380 aa  99.4  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.103464 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2018  penicillin-binding protein  24.29 
 
 
485 aa  98.2  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0154  beta-lactamase  26.11 
 
 
526 aa  97.8  4e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0467  beta-lactamase  23.21 
 
 
520 aa  97.4  5e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2118  beta-lactamase  24.04 
 
 
389 aa  96.7  9e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.146261  normal  0.0898893 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1164  beta-lactamase  27.74 
 
 
501 aa  96.7  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2459  beta-lactamase  27.95 
 
 
466 aa  95.1  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1134  beta-lactamase  25.16 
 
 
603 aa  95.5  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.260461 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1621  beta-lactamase  23.53 
 
 
426 aa  95.1  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.193235  normal  0.330681 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2343  beta-lactamase  24.52 
 
 
803 aa  94.7  4e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.23617 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4420  beta-lactamase  27.03 
 
 
519 aa  94  6e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0693  beta-lactamase  27.9 
 
 
530 aa  93.6  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.750269  normal  0.541197 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1867  beta-lactamase  25.55 
 
 
517 aa  93.2  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0109165  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3032  beta-lactamase  27.49 
 
 
507 aa  92.8  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.436003 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1298  beta-lactamase  27.53 
 
 
566 aa  92  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4882  beta-lactamase  25.93 
 
 
497 aa  91.7  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4133  beta-lactamase  26.35 
 
 
822 aa  91.3  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.668063  normal  0.0496796 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4050  beta-lactamase  25.84 
 
 
519 aa  90.5  7e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.817302  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1055  beta-lactamase  26.97 
 
 
547 aa  89.7  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427639  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2632  beta-lactamase  26.54 
 
 
503 aa  89.4  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.119708  hitchhiker  0.000636173 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0675  beta-lactamase  24.4 
 
 
377 aa  87.8  4e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  23.51 
 
 
505 aa  87.4  6e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1788  beta-lactamase  27.52 
 
 
560 aa  86.3  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.358741  normal  0.761746 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2539  beta-lactamase  24.69 
 
 
567 aa  86.7  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.470437  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0201  beta-lactamase  28.26 
 
 
530 aa  86.3  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.494145 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0370  beta-lactamase  25.9 
 
 
403 aa  86.3  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.405453  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5618  beta-lactamase  27.96 
 
 
456 aa  86.3  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357665  normal  0.013094 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03893  putative beta-lactamase  25 
 
 
363 aa  86.3  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.616435  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2813  beta-lactamase  26.09 
 
 
499 aa  84.7  0.000000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5338  beta-lactamase  26.81 
 
 
525 aa  84.7  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.271651  normal  0.211898 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0822  6Fe-6S prismane cluster-containing protein-like protein  27.67 
 
 
455 aa  84.7  0.000000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1710  beta-lactamase  27.18 
 
 
463 aa  83.6  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.903063 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3274  beta-lactamase  25.57 
 
 
524 aa  83.6  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.847415 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2312  beta-lactamase  29.45 
 
 
406 aa  82.4  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1414  putative beta-lactamase  23.08 
 
 
399 aa  81.6  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.182511  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2991  beta-lactamase  24.69 
 
 
475 aa  81.3  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0471  beta-lactamase  25.24 
 
 
616 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0759  putative beta-lactamase class C penicillin binding protein  26.77 
 
 
498 aa  81.3  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445171  normal  0.118882 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0973  beta-lactamase  22.96 
 
 
514 aa  80.9  0.00000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09923  hypothetical protein  21.29 
 
 
591 aa  80.9  0.00000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.916627  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  23.81 
 
 
487 aa  79.3  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5593  beta-lactamase  26.05 
 
 
480 aa  79.7  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2516  beta-lactamase  22.95 
 
 
498 aa  79  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000422279  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2177  beta-lactamase  23.13 
 
 
543 aa  78.6  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.816506 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2468  beta-lactamase  22.95 
 
 
498 aa  79  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00176956  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3688  beta-lactamase  23.13 
 
 
543 aa  78.6  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497517  normal  0.011807 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0343  beta-lactamase  26.23 
 
 
517 aa  78.6  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.6779 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2727  beta-lactamase  24.06 
 
 
486 aa  78.2  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2389  cyclic peptide transporter  23.48 
 
 
1032 aa  77.8  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03210  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  25.4 
 
 
521 aa  77.8  0.0000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.205122  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3177  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  25 
 
 
484 aa  77  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.075148  normal  0.866618 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4610  beta-lactamase  26.65 
 
 
533 aa  76.6  0.0000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0702461  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0653  beta-lactamase  26.18 
 
 
531 aa  75.9  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5264  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  27.16 
 
 
493 aa  75.5  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.0797924 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4257  beta-lactamase  24.53 
 
 
464 aa  75.1  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1795  beta-lactamase  25.35 
 
 
494 aa  74.7  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.478102  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1064  beta-lactamase  26.27 
 
 
544 aa  74.7  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2143  beta-lactamase  26.96 
 
 
401 aa  74.3  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.559529  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0456  beta-lactamase  27.39 
 
 
395 aa  74.7  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0601  beta-lactam binding protein AmpH  28.31 
 
 
381 aa  74.3  0.000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2968  beta-lactamase  24.11 
 
 
462 aa  74.3  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3698  beta-lactamase  27.25 
 
 
476 aa  73.9  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.884543  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4076  beta-lactamase  27.41 
 
 
566 aa  73.6  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  21.45 
 
 
446 aa  72.8  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1520  Beta-lactamase  25.78 
 
 
537 aa  73.2  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000638983  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3477  beta-lactamase  30.85 
 
 
409 aa  72.8  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.295738  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2779  beta-lactamase  25.55 
 
 
445 aa  72  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000737728  hitchhiker  0.0000305116 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0634  beta-lactamase  23.34 
 
 
661 aa  72  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.232968 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1832  beta-lactamase  23.24 
 
 
446 aa  72.4  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.29245  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  24.84 
 
 
362 aa  72.4  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6025  beta-lactamase  25.08 
 
 
460 aa  72.4  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.565651 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  25.37 
 
 
442 aa  71.2  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5985  beta-lactamase  23.38 
 
 
342 aa  71.2  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1936  beta-lactamase  23.64 
 
 
848 aa  70.9  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.178754  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6123  beta-lactamase  24.27 
 
 
536 aa  70.9  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.299024  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2629  putative penicillin-binding protein  21.95 
 
 
490 aa  70.5  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0110315  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>