More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0634 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_0634  beta-lactamase  100 
 
 
661 aa  1326    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.232968 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8144  beta-lactamase  51.97 
 
 
674 aa  556  1e-157  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.977782 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1671  beta-lactamase  42.21 
 
 
633 aa  466  9.999999999999999e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9203  beta-lactamase  39.76 
 
 
635 aa  399  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.606578 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4308  beta-lactamase  34.43 
 
 
650 aa  320  3.9999999999999996e-86  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.805936  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0335  hypothetical protein  35.43 
 
 
533 aa  267  5e-70  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1311  beta-lactamase  28.53 
 
 
669 aa  253  6e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3830  beta-lactamase  30.86 
 
 
658 aa  252  2e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223137  normal  0.372687 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4612  beta-lactamase  35.76 
 
 
677 aa  240  5e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2602  beta-lactamase  32.86 
 
 
778 aa  224  3e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1465  beta-lactamase  32.1 
 
 
657 aa  223  9e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.16455  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5423  beta-lactamase  32.41 
 
 
636 aa  219  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.251471  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2659  beta-lactamase  28.73 
 
 
662 aa  211  3e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4262  beta-lactamase  32.92 
 
 
695 aa  186  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0784  beta-lactamase  28.11 
 
 
638 aa  181  4.999999999999999e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.433281 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3362  beta-lactamase  27.26 
 
 
717 aa  160  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.450789  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0467  beta-lactamase  25.55 
 
 
637 aa  143  9.999999999999999e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11747  penicillin-binding protein  29.77 
 
 
539 aa  126  1e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.47398 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1946  Beta-lactamase  31.48 
 
 
588 aa  123  9e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2650  beta-lactamase  30.12 
 
 
497 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0361544  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1230  beta-lactamase  27.01 
 
 
455 aa  119  9.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1263  beta-lactamase-like protein  26.56 
 
 
455 aa  118  3.9999999999999997e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  27.38 
 
 
595 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3243  beta-lactamase family protein  25.95 
 
 
513 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01660  beta-lactamase  28.32 
 
 
447 aa  110  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.142612  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2516  beta-lactamase  23.55 
 
 
498 aa  108  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000422279  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0095  beta-lactamase  26.87 
 
 
580 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  33.87 
 
 
601 aa  109  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2468  beta-lactamase  23.55 
 
 
498 aa  108  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00176956  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  24.16 
 
 
505 aa  108  4e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2953  beta-lactamase  24.3 
 
 
513 aa  108  4e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4139  beta-lactamase  30.4 
 
 
422 aa  108  5e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  27.88 
 
 
362 aa  107  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2997  beta-lactamase  25.66 
 
 
513 aa  107  6e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1788  beta-lactamase  30.63 
 
 
560 aa  106  1e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.358741  normal  0.761746 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3068  beta-lactamase  26.76 
 
 
466 aa  106  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.129348 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2932  penicillin-binding protein  25.07 
 
 
513 aa  105  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  28.9 
 
 
559 aa  104  4e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0468  beta-lactamase  28.18 
 
 
455 aa  104  5e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000926021 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2177  beta-lactamase  25.4 
 
 
543 aa  103  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.816506 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3688  beta-lactamase  25.4 
 
 
543 aa  103  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497517  normal  0.011807 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3002  TonB-dependent receptor  31.35 
 
 
630 aa  102  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000398528 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8721  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  30.09 
 
 
480 aa  100  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2262  hypothetical protein  27.51 
 
 
485 aa  100  8e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.60427e-26 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  26.43 
 
 
477 aa  99.8  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1164  beta-lactamase  29.03 
 
 
501 aa  100  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0471  beta-lactamase  25.88 
 
 
616 aa  99.4  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3500  beta-lactamase  27.91 
 
 
600 aa  99.4  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.623073  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0973  beta-lactamase  27.32 
 
 
514 aa  99  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2346  hypothetical protein  26.16 
 
 
485 aa  98.6  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0051399  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2081  hypothetical protein  27.22 
 
 
485 aa  98.2  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.765888  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2018  penicillin-binding protein  27.22 
 
 
485 aa  98.2  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.225321  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2235  hypothetical protein  27.22 
 
 
485 aa  98.2  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.336147  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0675  beta-lactamase  25.37 
 
 
377 aa  98.2  4e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0116  beta-lactamase  24.41 
 
 
453 aa  97.4  7e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5593  beta-lactamase  31.29 
 
 
480 aa  97.4  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0467  beta-lactamase  24.25 
 
 
520 aa  97.1  9e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2923  beta-lactamase  32.59 
 
 
423 aa  97.1  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.633134 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3669  beta-lactamase  27.86 
 
 
507 aa  95.1  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2459  beta-lactamase  26.98 
 
 
466 aa  95.1  4e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2316  penicillin-binding protein  28.77 
 
 
481 aa  94.7  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181197  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1554  beta-lactamase  28.24 
 
 
410 aa  94.7  4e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.94 
 
 
442 aa  95.1  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3247  beta-lactamase  26.27 
 
 
513 aa  94.7  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2174  beta-lactamase  24.92 
 
 
429 aa  94.7  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0759  putative beta-lactamase class C penicillin binding protein  26.83 
 
 
498 aa  94.7  4e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445171  normal  0.118882 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3873  amino acid adenylation domain protein  33.06 
 
 
5698 aa  94.7  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.166545 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  30.2 
 
 
487 aa  94.7  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2018  penicillin-binding protein  25.37 
 
 
485 aa  94.4  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3210  beta-lactamase  27.22 
 
 
375 aa  94.4  7e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.767379  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2384  beta-lactamase  29.41 
 
 
483 aa  93.6  9e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2587  putative penicillin-binding protein  29.22 
 
 
463 aa  93.6  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35213e-17 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1519  beta-lactamase  29.15 
 
 
410 aa  93.2  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2336  beta-lactamase  27.13 
 
 
359 aa  93.2  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0999  beta-lactamase  26.24 
 
 
367 aa  93.6  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0117018 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2343  beta-lactamase  26.36 
 
 
803 aa  93.2  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.23617 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1783  cyclic peptide transporter  26.94 
 
 
1055 aa  93.2  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3058  beta-lactamase  27.33 
 
 
398 aa  93.6  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2400  penicillin-binding protein  30.21 
 
 
481 aa  92.8  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443561  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2575  penicillin-binding protein  30.21 
 
 
481 aa  92.8  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3106  hypothetical protein  24.63 
 
 
485 aa  92.4  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000134591 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4159  beta-lactamase  25.99 
 
 
544 aa  92.8  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0453527  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2987  beta-lactamase  28.25 
 
 
526 aa  92.4  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.204407  normal  0.639877 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2481  beta-lactamase  26.11 
 
 
359 aa  92  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3498  beta-lactamase  31.5 
 
 
375 aa  91.7  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2742  beta-lactamase  29.07 
 
 
376 aa  91.7  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0750006  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2629  putative penicillin-binding protein  28.31 
 
 
490 aa  91.3  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0110315  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2264  hypothetical protein  25.22 
 
 
485 aa  91.3  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.145649  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2579  penicillin-binding protein, putative  29.95 
 
 
483 aa  91.3  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0220569  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2353  penicillin-binding protein  29.17 
 
 
481 aa  91.3  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000218323  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2236  beta-lactamase  25.4 
 
 
428 aa  90.9  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2827  beta-lactamase  26.94 
 
 
410 aa  90.5  8e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.620293  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1528  beta-lactamase  27.65 
 
 
410 aa  90.5  8e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41280  putative beta-lactamase  24.86 
 
 
610 aa  90.5  9e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.607486 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2218  hypothetical protein  25 
 
 
485 aa  90.1  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1818  beta-lactamase  30.66 
 
 
513 aa  90.1  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0473  penicillin-binding protein  31.76 
 
 
421 aa  90.1  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0502  penicillin-binding protein  31.76 
 
 
412 aa  90.1  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  32.49 
 
 
446 aa  90.1  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04833  beta-lactamase  26.63 
 
 
529 aa  90.1  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>