More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3362 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3362  beta-lactamase  100 
 
 		 717 aa  1431    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.450789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4308  beta-lactamase  31.34 
 
 		 650 aa  239  2e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.805936  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3830  beta-lactamase  29.78 
 
 		 658 aa  218  4e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223137  normal  0.372687 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4612  beta-lactamase  33.33 
 
 		 677 aa  209  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0335  hypothetical protein  30.72 
 
 		 533 aa  207  6e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1465  beta-lactamase  32.98 
 
 		 657 aa  205  2e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.16455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2602  beta-lactamase  30.14 
 
 		 778 aa  185  2.0000000000000003e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1311  beta-lactamase  25.48 
 
 		 669 aa  184  6e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1671  beta-lactamase  27.32 
 
 		 633 aa  178  3e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9203  beta-lactamase  31.93 
 
 		 635 aa  174  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.606578 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4262  beta-lactamase  31.83 
 
 		 695 aa  167  8e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2659  beta-lactamase  23.89 
 
 		 662 aa  164  5.0000000000000005e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0784  beta-lactamase  27.86 
 
 		 638 aa  159  1e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.433281 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0634  beta-lactamase  27.26 
 
 		 661 aa  159  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.232968 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5423  beta-lactamase  29.62 
 
 		 636 aa  158  3e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.251471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0467  beta-lactamase  26.69 
 
 		 637 aa  150  7e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8144  beta-lactamase  32.69 
 
 		 674 aa  148  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.977782 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  27.86 
 
 		 601 aa  143  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  28.57 
 
 		 595 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4139  beta-lactamase  32.06 
 
 		 422 aa  125  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0471  beta-lactamase  26.6 
 
 		 616 aa  125  2e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11747  penicillin-binding protein  26.98 
 
 		 539 aa  118  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.47398 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1946  Beta-lactamase  29.12 
 
 		 588 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4990  beta-lactamase  29.93 
 
 		 531 aa  116  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2813  beta-lactamase  29.92 
 
 		 499 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1757  beta-lactamase  27.96 
 
 		 531 aa  114  6e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4257  beta-lactamase  31.44 
 
 		 464 aa  114  8.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1625  beta-lactamase  26.85 
 
 		 533 aa  113  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.170379  normal  0.921213 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4429  beta-lactamase  28.86 
 
 		 533 aa  113  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4516  beta-lactamase  28.86 
 
 		 533 aa  113  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4810  beta-lactamase  28.86 
 
 		 533 aa  113  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3247  beta-lactamase  27.45 
 
 		 513 aa  112  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0693  beta-lactamase  28.4 
 
 		 530 aa  111  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.750269  normal  0.541197 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  30.56 
 
 		 966 aa  110  8.000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5771  beta-lactamase  27.93 
 
 		 711 aa  110  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1164  beta-lactamase  25.36 
 
 		 501 aa  108  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2650  beta-lactamase  29.38 
 
 		 497 aa  107  7e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0361544  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4657  beta-lactamase  30.26 
 
 		 485 aa  105  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0116  beta-lactamase  25.35 
 
 		 453 aa  105  3e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2632  beta-lactamase  29.02 
 
 		 503 aa  104  4e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.119708  hitchhiker  0.000636173 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3062  beta-lactamase  25.18 
 
 		 614 aa  104  7e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.367625  hitchhiker  0.002383 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0294  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  25.1 
 
 		 834 aa  103  9e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00108534  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0973  beta-lactamase  26.67 
 
 		 514 aa  103  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4610  beta-lactamase  26.91 
 
 		 533 aa  101  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0702461  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0735  beta-lactamase  27.32 
 
 		 551 aa  100  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1134  beta-lactamase  36.07 
 
 		 459 aa  99.4  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3287  beta-lactamase  29.97 
 
 		 463 aa  99  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0209216 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6025  beta-lactamase  27.32 
 
 		 460 aa  99  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.565651 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1710  beta-lactamase  28.53 
 
 		 463 aa  99  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.903063 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3017  beta-lactamase  25.81 
 
 		 694 aa  98.2  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151965  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5618  beta-lactamase  27.03 
 
 		 456 aa  98.2  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357665  normal  0.013094 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6123  beta-lactamase  27.46 
 
 		 536 aa  98.2  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.299024  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3274  beta-lactamase  26.1 
 
 		 524 aa  97.8  7e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.847415 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2987  beta-lactamase  26.55 
 
 		 526 aa  97.8  7e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.204407  normal  0.639877 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4882  beta-lactamase  26.67 
 
 		 497 aa  97.4  8e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3500  beta-lactamase  23.97 
 
 		 600 aa  97.4  8e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.623073  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1867  beta-lactamase  27.75 
 
 		 517 aa  96.7  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0109165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0653  beta-lactamase  26.25 
 
 		 531 aa  97.1  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8721  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  28.12 
 
 		 480 aa  96.7  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4159  beta-lactamase  27.68 
 
 		 544 aa  97.1  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0453527  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1234  beta-lactamase  27.05 
 
 		 519 aa  96.7  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565811  normal  0.301621 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1364  beta-lactamase  24.12 
 
 		 574 aa  96.3  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.185265  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0098  beta-lactamase  25.71 
 
 		 691 aa  95.5  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1783  cyclic peptide transporter  26.09 
 
 		 1055 aa  95.5  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3742  beta-lactamase  31.53 
 
 		 478 aa  95.9  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.877046  normal  0.0540026 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  29.18 
 
 		 377 aa  95.1  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0468  beta-lactamase  28.79 
 
 		 455 aa  95.1  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000926021 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3669  beta-lactamase  28.57 
 
 		 507 aa  94.7  5e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  22.48 
 
 		 505 aa  94.4  7e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1795  beta-lactamase  26.63 
 
 		 494 aa  94  8e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.478102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0999  beta-lactamase  24.72 
 
 		 367 aa  94  9e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0117018 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04833  beta-lactamase  28.57 
 
 		 529 aa  93.6  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2252  beta-lactamase  29.82 
 
 		 460 aa  93.6  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.119961  normal  0.0203286 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  29.03 
 
 		 578 aa  93.2  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1460  beta-lactamase  27.22 
 
 		 523 aa  92  3e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0171679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2896  alkaline D-peptidase  34.59 
 
 		 383 aa  92.4  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.243898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1839  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  31.58 
 
 		 681 aa  92  4e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000051234  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8154  beta-lactamase  26.72 
 
 		 550 aa  91.3  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0805  beta-lactamase  27.63 
 
 		 519 aa  91.7  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2343  beta-lactamase  26.91 
 
 		 803 aa  91.3  6e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.23617 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1745  beta-lactamase  30.09 
 
 		 454 aa  91.3  6e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0714  beta-lactamase  25 
 
 		 392 aa  91.3  6e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1955  beta-lactamase  25.87 
 
 		 694 aa  91.3  6e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.1377  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5348  beta-lactamase  26.86 
 
 		 414 aa  90.9  8e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.635001  normal  0.0848814 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2389  cyclic peptide transporter  25.37 
 
 		 1032 aa  90.9  8e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5593  beta-lactamase  26.92 
 
 		 480 aa  90.5  9e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1755  beta-lactamase  27.94 
 
 		 450 aa  90.5  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0675  beta-lactamase  29.15 
 
 		 377 aa  90.5  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41280  putative beta-lactamase  25.14 
 
 		 610 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.607486 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10925  hypothetical protein  26.7 
 
 		 562 aa  90.5  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4133  beta-lactamase  27.16 
 
 		 822 aa  89.7  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.668063  normal  0.0496796 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0538  beta-lactamase  25.95 
 
 		 433 aa  89.7  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0683  Beta-lactamase  27.43 
 
 		 530 aa  89.4  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.564885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2979  beta-lactamase  25.81 
 
 		 655 aa  89.4  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0951  beta-lactamase  30.17 
 
 		 345 aa  89.4  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0224352  decreased coverage  0.0053447 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0467  beta-lactamase  25.97 
 
 		 520 aa  89.4  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2468  beta-lactamase  22.11 
 
 		 498 aa  89.4  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00176956  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2231  beta-lactamase  22.35 
 
 		 384 aa  89.4  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2516  beta-lactamase  22.11 
 
 		 498 aa  89.4  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000422279  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1881  beta-lactamase  29.56 
 
 		 613 aa  89  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.234575  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>