More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_0467 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_0467  beta-lactamase  100 
 
 
637 aa  1290    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4308  beta-lactamase  30.75 
 
 
650 aa  218  2e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.805936  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2602  beta-lactamase  31.75 
 
 
778 aa  191  2.9999999999999997e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1311  beta-lactamase  25.49 
 
 
669 aa  191  5e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2659  beta-lactamase  25.59 
 
 
662 aa  181  4e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9203  beta-lactamase  29.36 
 
 
635 aa  174  5.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.606578 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0335  hypothetical protein  27.37 
 
 
533 aa  173  1e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8144  beta-lactamase  29.34 
 
 
674 aa  172  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.977782 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3830  beta-lactamase  28.81 
 
 
658 aa  172  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223137  normal  0.372687 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5423  beta-lactamase  28.75 
 
 
636 aa  163  8.000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.251471  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1465  beta-lactamase  27.98 
 
 
657 aa  162  2e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.16455  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4612  beta-lactamase  29.35 
 
 
677 aa  156  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1671  beta-lactamase  28.29 
 
 
633 aa  149  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3362  beta-lactamase  26.3 
 
 
717 aa  147  4.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.450789  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4262  beta-lactamase  27.97 
 
 
695 aa  138  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0634  beta-lactamase  25.45 
 
 
661 aa  133  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.232968 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0784  beta-lactamase  23.92 
 
 
638 aa  133  1.0000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.433281 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2727  beta-lactamase  28.49 
 
 
486 aa  123  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  28.12 
 
 
601 aa  115  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0759  putative beta-lactamase class C penicillin binding protein  28.18 
 
 
498 aa  114  7.000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445171  normal  0.118882 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  25.82 
 
 
505 aa  113  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4139  beta-lactamase  27.61 
 
 
422 aa  113  1.0000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11747  penicillin-binding protein  27.27 
 
 
539 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.47398 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  26.56 
 
 
559 aa  112  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2018  penicillin-binding protein  25.88 
 
 
485 aa  112  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2813  beta-lactamase  28.21 
 
 
499 aa  111  3e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0471  beta-lactamase  28.53 
 
 
616 aa  112  3e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1638  beta-lactamase  26.06 
 
 
485 aa  110  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0331332  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  27.96 
 
 
595 aa  108  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5771  beta-lactamase  28.05 
 
 
711 aa  108  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0468  beta-lactamase  27.37 
 
 
455 aa  108  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000926021 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2262  hypothetical protein  25.07 
 
 
485 aa  107  6e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.60427e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2081  hypothetical protein  25.07 
 
 
485 aa  107  7e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.765888  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2235  hypothetical protein  25.07 
 
 
485 aa  107  7e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.336147  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2468  beta-lactamase  25.42 
 
 
498 aa  106  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00176956  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1134  beta-lactamase  27.15 
 
 
603 aa  106  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.260461 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2516  beta-lactamase  25.42 
 
 
498 aa  106  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000422279  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2264  hypothetical protein  24.85 
 
 
485 aa  106  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.145649  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2060  beta-lactamase  24.41 
 
 
485 aa  105  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.258254  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3500  beta-lactamase  25.94 
 
 
600 aa  105  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.623073  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2018  penicillin-binding protein  24.85 
 
 
485 aa  105  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.225321  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1783  cyclic peptide transporter  25.59 
 
 
1055 aa  105  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2177  beta-lactamase  26.09 
 
 
543 aa  103  7e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.816506 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3688  beta-lactamase  26.09 
 
 
543 aa  103  7e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497517  normal  0.011807 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3106  hypothetical protein  24.41 
 
 
485 aa  103  8e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000134591 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2346  hypothetical protein  24.64 
 
 
485 aa  103  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0051399  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0999  beta-lactamase  26.58 
 
 
367 aa  102  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0117018 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1946  Beta-lactamase  22.63 
 
 
588 aa  101  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2218  hypothetical protein  24.4 
 
 
485 aa  101  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2539  beta-lactamase  25.06 
 
 
567 aa  99.8  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.470437  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  26.94 
 
 
487 aa  100  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3742  beta-lactamase  28.66 
 
 
478 aa  100  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.877046  normal  0.0540026 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1457  beta-lactamase  26.84 
 
 
325 aa  99.4  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.17461  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4833  beta-lactamase  25.24 
 
 
405 aa  99.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4191  beta-lactamase  24.66 
 
 
386 aa  98.6  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.249358 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0291  beta-lactamase class C domain-containing protein  21.38 
 
 
519 aa  99  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000012653  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3669  beta-lactamase  27.94 
 
 
507 aa  98.2  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27.18 
 
 
442 aa  97.4  6e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41280  putative beta-lactamase  24.85 
 
 
610 aa  97.4  7e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.607486 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2755  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  24.74 
 
 
388 aa  96.7  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0494186  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3058  beta-lactamase  27.54 
 
 
398 aa  96.7  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01660  beta-lactamase  26.09 
 
 
447 aa  96.7  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.142612  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2932  penicillin-binding protein  24.53 
 
 
513 aa  96.3  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3512  beta-lactamase  27.55 
 
 
364 aa  95.1  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0683  Beta-lactamase  26.32 
 
 
530 aa  95.5  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.564885  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2638  beta-lactamase  28.15 
 
 
445 aa  95.1  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3068  beta-lactamase  25.62 
 
 
466 aa  94.7  4e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.129348 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3208  beta-lactamase  24.78 
 
 
377 aa  94.7  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0230735  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5327  beta-lactamase  29.82 
 
 
440 aa  95.1  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.620258 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2198  beta-lactamase  27.22 
 
 
543 aa  94.7  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.176904  normal  0.0317754 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2819  alkaline D-peptidase  24.17 
 
 
388 aa  94.7  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118082  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2769  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  24.17 
 
 
389 aa  94.4  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.48212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3033  alkaline d-peptidase  24.17 
 
 
388 aa  94.7  5e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.400662  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1263  beta-lactamase-like protein  26.63 
 
 
455 aa  94.7  5e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3294  penicillin-binding protein  25.16 
 
 
377 aa  94.4  6e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.678008  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  27.08 
 
 
578 aa  94.4  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3511  putative penicillin-binding protein  25.16 
 
 
377 aa  94.4  6e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3554  penicillin-binding protein  25.16 
 
 
377 aa  94.4  6e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3144  beta-lactamase  26.52 
 
 
590 aa  94.4  6e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3027  alkaline D-peptidase  24.17 
 
 
388 aa  94.4  7e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3064  alkaline D-peptidase  25.48 
 
 
388 aa  93.6  9e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0312865  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2953  beta-lactamase  25.96 
 
 
513 aa  93.6  9e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0805  beta-lactamase  27.79 
 
 
519 aa  93.6  9e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2384  beta-lactamase  30.24 
 
 
483 aa  93.2  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1230  beta-lactamase  27.16 
 
 
455 aa  93.2  1e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1905  beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins  26.22 
 
 
389 aa  93.6  1e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.0068252  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35970  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  28.25 
 
 
582 aa  93.2  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796833  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3062  beta-lactamase  26.45 
 
 
614 aa  92.4  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.367625  hitchhiker  0.002383 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1357  beta-lactamase  28.83 
 
 
378 aa  92.4  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0116  beta-lactamase  23.19 
 
 
453 aa  92.4  2e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0772  beta-lactamase  25.23 
 
 
431 aa  92.8  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0095  beta-lactamase  23.22 
 
 
580 aa  92.8  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1818  beta-lactamase  29.29 
 
 
513 aa  92  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2997  beta-lactamase  26.6 
 
 
513 aa  92  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5715  beta-lactamase  25.69 
 
 
437 aa  92  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0456  beta-lactamase  29.14 
 
 
395 aa  92  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2824  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  24.03 
 
 
388 aa  91.7  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.130693  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09923  hypothetical protein  25.39 
 
 
591 aa  91.7  4e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.916627  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4133  beta-lactamase  26.27 
 
 
822 aa  91.7  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.668063  normal  0.0496796 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4882  beta-lactamase  24.93 
 
 
497 aa  91.3  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>