More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5593 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5593  beta-lactamase  100 
 
 		 480 aa  964    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8721  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  47.98 
 
 		 480 aa  355  1e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3032  beta-lactamase  46.53 
 
 		 507 aa  333  3e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.436003 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3698  beta-lactamase  41.43 
 
 		 476 aa  283  5.000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.884543  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5338  beta-lactamase  44.65 
 
 		 525 aa  267  2.9999999999999995e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.271651  normal  0.211898 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3518  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  38.22 
 
 		 508 aa  200  3.9999999999999996e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2650  beta-lactamase  30.39 
 
 		 497 aa  143  9e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0361544  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1788  beta-lactamase  33.43 
 
 		 560 aa  134  3e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.358741  normal  0.761746 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1955  beta-lactamase  33.89 
 
 		 694 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.1377  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3223  putative penicillin-binding protein  34.92 
 
 		 691 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2353  penicillin-binding protein  23.72 
 
 		 481 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000218323  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2036  putative penicillin-binding protein  34.92 
 
 		 691 aa  131  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2989  penicillin-binding protein  34.58 
 
 		 691 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3214  penicillin-binding protein  34.58 
 
 		 691 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38843  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0683  Beta-lactamase  31.94 
 
 		 530 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.564885  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2916  penicillin-binding protein  34.24 
 
 		 691 aa  128  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2587  putative penicillin-binding protein  23.27 
 
 		 463 aa  127  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35213e-17 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2400  penicillin-binding protein  22.81 
 
 		 481 aa  126  9e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443561  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2575  penicillin-binding protein  22.81 
 
 		 481 aa  126  9e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2316  penicillin-binding protein  22.81 
 
 		 481 aa  125  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181197  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2579  penicillin-binding protein, putative  23.35 
 
 		 483 aa  124  4e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0220569  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1839  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  30.65 
 
 		 681 aa  124  4e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000051234  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2384  beta-lactamase  23.25 
 
 		 483 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2629  putative penicillin-binding protein  23.42 
 
 		 490 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0110315  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3017  beta-lactamase  33.82 
 
 		 694 aa  121  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151965  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0098  beta-lactamase  33.45 
 
 		 691 aa  120  6e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0291  beta-lactamase class C domain-containing protein  29.75 
 
 		 519 aa  120  6e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000012653  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30 
 
 		 392 aa  119  9e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  22.15 
 
 		 505 aa  116  6.9999999999999995e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0154  beta-lactamase  24.56 
 
 		 482 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2468  beta-lactamase  22.31 
 
 		 498 aa  116  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00176956  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2516  beta-lactamase  22.31 
 
 		 498 aa  116  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000422279  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9203  beta-lactamase  30.41 
 
 		 635 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.606578 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1514  beta-lactamase  28.48 
 
 		 620 aa  115  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00027695  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0335  hypothetical protein  31.9 
 
 		 533 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0294  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  34.86 
 
 		 834 aa  114  3e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00108534  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2573  fmtA-like protein, putative  24.31 
 
 		 482 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00911316  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4213  beta-lactamase  30.25 
 
 		 403 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.161495  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0934  beta-lactamase  25.47 
 
 		 475 aa  114  5e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000419238  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1783  cyclic peptide transporter  26.63 
 
 		 1055 aa  114  6e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3205  putative penicillin-binding protein  32.07 
 
 		 694 aa  113  9e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2968  beta-lactamase  27.22 
 
 		 462 aa  113  9e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1460  beta-lactamase  27.86 
 
 		 523 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0171679  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2018  penicillin-binding protein  28.66 
 
 		 485 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.225321  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0801  beta-lactamase  30.14 
 
 		 478 aa  112  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.87828  normal  0.048033 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  26.14 
 
 		 595 aa  111  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1710  beta-lactamase  30.93 
 
 		 463 aa  111  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.903063 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.39 
 
 		 442 aa  110  5e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1520  Beta-lactamase  29.57 
 
 		 537 aa  110  6e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000638983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2717  beta-lactamase  27.78 
 
 		 470 aa  110  6e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0973  beta-lactamase  24.57 
 
 		 514 aa  110  8.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2659  beta-lactamase  26.77 
 
 		 662 aa  110  8.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2544  putative penicillin-binding protein  22.11 
 
 		 483 aa  109  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0416  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  26.85 
 
 		 421 aa  108  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0430511  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1936  beta-lactamase  27.64 
 
 		 848 aa  108  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.178754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0502  penicillin-binding protein  26.85 
 
 		 412 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0483  putative penicillin-binding protein  26.85 
 
 		 412 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2262  hypothetical protein  28.06 
 
 		 485 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.60427e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0473  penicillin-binding protein  26.85 
 
 		 421 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2081  hypothetical protein  28.06 
 
 		 485 aa  107  5e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.765888  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2235  hypothetical protein  28.06 
 
 		 485 aa  107  5e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.336147  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2218  hypothetical protein  27.46 
 
 		 485 aa  107  5e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1818  beta-lactamase  31.45 
 
 		 513 aa  107  5e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5013  alkaline D-peptidase  32.27 
 
 		 374 aa  107  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394865  normal  0.0638413 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4818  putative penicillin-binding protein  26.85 
 
 		 416 aa  106  8e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.618322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11747  penicillin-binding protein  27.68 
 
 		 539 aa  106  9e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.47398 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2459  beta-lactamase  27.7 
 
 		 466 aa  106  1e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1263  beta-lactamase-like protein  24.32 
 
 		 455 aa  105  1e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1230  beta-lactamase  24.32 
 
 		 455 aa  105  1e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5769  beta-lactamase  28.75 
 
 		 670 aa  105  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.477057 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01660  beta-lactamase  26.95 
 
 		 447 aa  105  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.142612  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3144  beta-lactamase  29.51 
 
 		 590 aa  105  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4262  beta-lactamase  30.41 
 
 		 695 aa  105  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0759  putative beta-lactamase class C penicillin binding protein  26.06 
 
 		 498 aa  105  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445171  normal  0.118882 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04833  beta-lactamase  29.72 
 
 		 529 aa  105  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0412  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  26.4 
 
 		 422 aa  104  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3517  beta-lactamase  28.73 
 
 		 447 aa  104  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  29.15 
 
 		 377 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0675  beta-lactamase  25 
 
 		 377 aa  104  3e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1906  beta-lactamase  27.87 
 
 		 369 aa  105  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3106  hypothetical protein  26.95 
 
 		 485 aa  104  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000134591 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0831  beta-lactamase  34.55 
 
 		 422 aa  104  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0468  beta-lactamase  30.09 
 
 		 455 aa  104  5e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000926021 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1234  beta-lactamase  28.69 
 
 		 519 aa  104  5e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565811  normal  0.301621 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3830  beta-lactamase  27.17 
 
 		 658 aa  103  6e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223137  normal  0.372687 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0505  putative penicillin-binding protein  26.51 
 
 		 415 aa  103  7e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0859162  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3068  beta-lactamase  25.53 
 
 		 466 aa  103  8e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.129348 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  26.25 
 
 		 601 aa  103  9e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2360  beta-lactamase  26.61 
 
 		 494 aa  103  9e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.908213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0419  beta-lactamase  26.04 
 
 		 416 aa  103  9e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4308  beta-lactamase  30.06 
 
 		 650 aa  102  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.805936  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2616  beta-lactamase  26.3 
 
 		 353 aa  102  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3688  beta-lactamase  26.67 
 
 		 543 aa  102  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497517  normal  0.011807 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2177  beta-lactamase  26.67 
 
 		 543 aa  102  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.816506 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5985  beta-lactamase  24.92 
 
 		 342 aa  102  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0558  putative penicillin-binding protein  26.17 
 
 		 413 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.622752  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0495  beta-lactamase  37.74 
 
 		 471 aa  102  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6088  beta-lactamase  31.37 
 
 		 406 aa  102  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.496561  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  30.9 
 
 		 966 aa  101  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15810  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  31.14 
 
 		 488 aa  101  3e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.091319  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>