More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0291 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0291  beta-lactamase class C domain-containing protein  100 
 
 		 519 aa  1068    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000012653  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3205  putative penicillin-binding protein  42.67 
 
 		 694 aa  430  1e-119  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3017  beta-lactamase  42.15 
 
 		 694 aa  414  1e-114  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151965  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0098  beta-lactamase  43.27 
 
 		 691 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3223  putative penicillin-binding protein  42.65 
 
 		 691 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2036  putative penicillin-binding protein  42.45 
 
 		 691 aa  404  1e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2989  penicillin-binding protein  42.45 
 
 		 691 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1955  beta-lactamase  41.57 
 
 		 694 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.1377  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3214  penicillin-binding protein  42.45 
 
 		 691 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38843  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2916  penicillin-binding protein  42.24 
 
 		 691 aa  398  1e-109  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1839  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  31.61 
 
 		 681 aa  237  3e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000051234  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0294  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  31.27 
 
 		 834 aa  228  2e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00108534  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0674  beta-lactamase  25.96 
 
 		 715 aa  171  3e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.076052 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5769  beta-lactamase  26.52 
 
 		 670 aa  156  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.477057 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1018  beta-lactamase  28.83 
 
 		 461 aa  135  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.624623 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5715  beta-lactamase  25.86 
 
 		 437 aa  131  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3518  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  31.95 
 
 		 508 aa  124  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1234  beta-lactamase  28.43 
 
 		 519 aa  124  5e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565811  normal  0.301621 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  27.84 
 
 		 595 aa  121  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5593  beta-lactamase  30.29 
 
 		 480 aa  116  8.999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4257  beta-lactamase  26.57 
 
 		 464 aa  115  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0335  hypothetical protein  27.67 
 
 		 533 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0468  beta-lactamase  25.26 
 
 		 455 aa  113  7.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000926021 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0637  beta-lactamase  29.63 
 
 		 424 aa  113  9e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000302256  normal  0.230717 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1710  beta-lactamase  29.91 
 
 		 463 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.903063 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2953  beta-lactamase  30 
 
 		 513 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0473  penicillin-binding protein  29.75 
 
 		 421 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0483  putative penicillin-binding protein  29.75 
 
 		 412 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1520  Beta-lactamase  37.18 
 
 		 537 aa  111  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000638983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0502  penicillin-binding protein  29.75 
 
 		 412 aa  111  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35970  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  35.07 
 
 		 582 aa  111  3e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796833  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8721  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  36.76 
 
 		 480 aa  111  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  27.88 
 
 		 601 aa  110  5e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2997  beta-lactamase  30 
 
 		 513 aa  110  6e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0412  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  29.75 
 
 		 422 aa  110  6e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2659  beta-lactamase  27.38 
 
 		 662 aa  110  8.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5714  beta-lactamase  27.76 
 
 		 446 aa  110  8.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0416  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  29.39 
 
 		 421 aa  110  9.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0430511  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1713  beta-lactamase  28.62 
 
 		 347 aa  109  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04833  beta-lactamase  28.88 
 
 		 529 aa  108  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3751  beta-lactamase  30.32 
 
 		 395 aa  108  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000498352 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  28.09 
 
 		 559 aa  108  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1364  beta-lactamase  29.07 
 
 		 574 aa  107  4e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.185265  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6025  beta-lactamase  25.43 
 
 		 460 aa  107  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.565651 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0558  putative penicillin-binding protein  29.03 
 
 		 413 aa  106  9e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.622752  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2932  penicillin-binding protein  28.73 
 
 		 513 aa  105  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  30.25 
 
 		 356 aa  105  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3243  beta-lactamase family protein  29.2 
 
 		 513 aa  106  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4612  beta-lactamase  28.09 
 
 		 677 aa  105  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4788  beta-lactamase  30.04 
 
 		 400 aa  105  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.416977  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0505  putative penicillin-binding protein  29.75 
 
 		 415 aa  104  4e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0859162  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3177  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  25.17 
 
 		 484 aa  103  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.075148  normal  0.866618 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4818  putative penicillin-binding protein  29.03 
 
 		 416 aa  103  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.618322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2343  beta-lactamase  26 
 
 		 803 aa  103  6e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.23617 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3032  beta-lactamase  29.56 
 
 		 507 aa  103  8e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.436003 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0270  beta-lactamase  31.96 
 
 		 717 aa  103  8e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0555  penicillin-binding protein, putative  28.32 
 
 		 413 aa  102  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.389605  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3517  beta-lactamase  30.28 
 
 		 447 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4213  beta-lactamase  28.67 
 
 		 403 aa  102  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.161495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5618  beta-lactamase  24.63 
 
 		 456 aa  102  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357665  normal  0.013094 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4308  beta-lactamase  25.23 
 
 		 650 aa  102  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.805936  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  26.67 
 
 		 377 aa  103  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11747  penicillin-binding protein  25.62 
 
 		 539 aa  102  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.47398 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3698  beta-lactamase  30.83 
 
 		 476 aa  102  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.884543  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0467  beta-lactamase  28.7 
 
 		 520 aa  102  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2060  beta-lactamase  25.43 
 
 		 485 aa  101  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.258254  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2987  beta-lactamase  24.89 
 
 		 526 aa  101  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.204407  normal  0.639877 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1638  beta-lactamase  25.07 
 
 		 485 aa  101  4e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0331332  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0349  beta-lactamase  29.26 
 
 		 407 aa  100  5e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1936  beta-lactamase  33.97 
 
 		 848 aa  100  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.178754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0419  beta-lactamase  28.78 
 
 		 416 aa  100  6e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0201  beta-lactamase  27.3 
 
 		 530 aa  100  9e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.494145 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  28.67 
 
 		 487 aa  99.8  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2252  beta-lactamase  27.49 
 
 		 460 aa  98.6  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.119961  normal  0.0203286 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1134  beta-lactamase  28.42 
 
 		 459 aa  98.6  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0467  beta-lactamase  21.38 
 
 		 637 aa  98.6  2e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1457  beta-lactamase  30.14 
 
 		 325 aa  99  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.17461  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4346  Beta-lactamase  30.64 
 
 		 547 aa  98.6  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5607  hypothetical protein  33.16 
 
 		 784 aa  98.6  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3830  beta-lactamase  28.35 
 
 		 658 aa  98.2  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223137  normal  0.372687 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6467  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  25.41 
 
 		 551 aa  98.2  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.341842  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.03 
 
 		 392 aa  97.4  5e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1460  beta-lactamase  25.3 
 
 		 523 aa  97.4  5e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0171679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1867  beta-lactamase  27.57 
 
 		 517 aa  97.4  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0109165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2525  beta-lactamase  28.14 
 
 		 377 aa  96.7  9e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.45 
 
 		 442 aa  96.7  9e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3866  beta-lactamase  28.57 
 
 		 388 aa  96.3  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2717  beta-lactamase  30.26 
 
 		 470 aa  96.7  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4159  beta-lactamase  26.61 
 
 		 544 aa  96.7  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0453527  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6028  beta-lactamase  30.32 
 
 		 438 aa  96.3  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.198472  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2539  beta-lactamase  27.02 
 
 		 567 aa  95.5  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.470437  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1946  Beta-lactamase  23.73 
 
 		 588 aa  95.9  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2209  beta-lactamase  24.32 
 
 		 420 aa  95.9  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.683727  normal  0.729907 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0714  beta-lactamase  24.48 
 
 		 392 aa  95.9  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0772  beta-lactamase  27.14 
 
 		 431 aa  95.1  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0723  beta-lactamase  30.94 
 
 		 511 aa  95.9  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000618645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3274  beta-lactamase  24.41 
 
 		 524 aa  95.1  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.847415 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3106  hypothetical protein  24.29 
 
 		 485 aa  95.1  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000134591 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1311  beta-lactamase  28.85 
 
 		 669 aa  94.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3215  beta-lactamase  28.8 
 
 		 405 aa  94.7  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000372743  hitchhiker  0.00147977 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>