More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_35970 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_35970  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  100 
 
 		 582 aa  1167    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796833  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0270  beta-lactamase  57.17 
 
 		 717 aa  538  9.999999999999999e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0627  beta-lactamase  52.76 
 
 		 566 aa  468  9.999999999999999e-131  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1364  beta-lactamase  44.59 
 
 		 574 aa  395  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.185265  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1366  beta-lactamase  46.65 
 
 		 591 aa  393  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.416084  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1664  beta-lactamase  43.28 
 
 		 348 aa  230  4e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.15284 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2172  beta-lactamase  40.55 
 
 		 428 aa  229  1e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.65714  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1830  beta-lactamase  40.55 
 
 		 452 aa  229  1e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.162579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2615  hypothetical protein  40.97 
 
 		 793 aa  226  9e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.377093  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5693  beta-lactamase  42.01 
 
 		 415 aa  221  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.21234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1870  beta-lactamase  40.87 
 
 		 390 aa  221  3e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.375615 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4539  hypothetical protein  40.61 
 
 		 796 aa  214  3.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00469106 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4406  hypothetical protein  40.61 
 
 		 796 aa  214  3.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.343081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  39.94 
 
 		 966 aa  213  7.999999999999999e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3117  beta-lactamase  42.02 
 
 		 361 aa  211  3e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.577011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0660  beta-lactamase  39.3 
 
 		 395 aa  206  9e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.775643  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2604  beta-lactamase  43.49 
 
 		 354 aa  204  3e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.928872  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0925  beta-lactamase, putative  39.71 
 
 		 790 aa  203  6e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1740  beta-lactamase  37.91 
 
 		 379 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5607  hypothetical protein  43.27 
 
 		 784 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0439  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidease, putative  40.72 
 
 		 381 aa  196  1e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.737656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2362  beta-lactamase  38.48 
 
 		 357 aa  196  1e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6218  hypothetical protein  38.14 
 
 		 792 aa  195  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1874  beta-lactamase  37.86 
 
 		 379 aa  194  3e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999528 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5870  hypothetical protein  38.53 
 
 		 785 aa  193  9e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1715  beta-lactamase  35.62 
 
 		 528 aa  188  3e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102688  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1761  beta-lactamase  35.62 
 
 		 528 aa  188  3e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.775747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1797  beta-lactamase  39.45 
 
 		 391 aa  187  4e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0148599  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20140  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  39.94 
 
 		 371 aa  184  3e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.44906  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0839  beta-lactamase  33.25 
 
 		 1012 aa  182  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1692  beta-lactamase  35.02 
 
 		 531 aa  182  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.499627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1249  hypothetical protein  32.48 
 
 		 434 aa  179  1e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.303061 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2566  hypothetical protein  32.48 
 
 		 434 aa  179  1e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1790  beta-lactamase  40.92 
 
 		 483 aa  179  1e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0797219 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2716  hypothetical protein  32.23 
 
 		 434 aa  178  2e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2585  hypothetical protein  32.49 
 
 		 433 aa  178  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1697  beta-lactamase  35.89 
 
 		 381 aa  178  2e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.570462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1543  beta-lactamase  31.96 
 
 		 651 aa  177  3e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2426  beta-lactamase  40.78 
 
 		 459 aa  177  4e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00208801  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0301  beta-lactamase  38.23 
 
 		 351 aa  176  9e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1231  beta-lactamase  32.66 
 
 		 434 aa  176  9.999999999999999e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2113  beta-lactamase  32.51 
 
 		 597 aa  176  9.999999999999999e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.226997 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2255  beta-lactamase  35.47 
 
 		 379 aa  176  9.999999999999999e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.234898  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4160  hypothetical protein  39.83 
 
 		 818 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000766166  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2047  hypothetical protein  38.8 
 
 		 395 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0829987  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0714  beta-lactamase  37.98 
 
 		 392 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4206  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.51 
 
 		 1018 aa  174  5e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3660  hypothetical protein  32.23 
 
 		 434 aa  174  5.999999999999999e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2622  hypothetical protein  31.68 
 
 		 432 aa  173  9e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2711  hypothetical protein  32.24 
 
 		 432 aa  173  9e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.27035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2844  hypothetical protein  32 
 
 		 432 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2671  hypothetical protein  32 
 
 		 432 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2737  hypothetical protein  32 
 
 		 432 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4038  beta-lactamase  38.82 
 
 		 374 aa  171  5e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1238  beta-lactamase  36.66 
 
 		 361 aa  170  7e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0242548 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2687  beta-lactamase  36.77 
 
 		 381 aa  170  8e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000287138 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3257  beta-lactamase  38.71 
 
 		 430 aa  169  1e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1529  beta-lactamase  39.81 
 
 		 381 aa  169  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.303701  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0495  beta-lactamase  36.16 
 
 		 471 aa  168  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1201  beta-lactamase  29.74 
 
 		 665 aa  169  2e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0477  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidease, putative  33.81 
 
 		 385 aa  166  9e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.765713  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0954  Beta-lactamase  39.37 
 
 		 416 aa  166  9e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0591  beta-lactamase  35.54 
 
 		 360 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000780172  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4515  beta-lactamase  41.16 
 
 		 369 aa  166  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.942067 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1850  Beta-lactamase class C or other penicillin binding protein  34.95 
 
 		 338 aa  165  2.0000000000000002e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000532294  hitchhiker  0.000116253 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2487  beta-lactamase  36.87 
 
 		 408 aa  164  3e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0479  beta-lactamase  33.08 
 
 		 603 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000533746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2616  beta-lactamase  35.73 
 
 		 366 aa  161  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.763267 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5895  beta-lactamase  34.14 
 
 		 496 aa  161  4e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4196  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.54 
 
 		 1002 aa  158  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.690171 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3517  beta-lactamase  32.7 
 
 		 447 aa  156  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2708  beta-lactamase  30.96 
 
 		 992 aa  155  2.9999999999999998e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2506  beta-lactamase  39.05 
 
 		 344 aa  155  2.9999999999999998e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0383  Beta-lactamase class C related penicillin binding protein  36.61 
 
 		 337 aa  153  5.9999999999999996e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5392  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.68 
 
 		 953 aa  151  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3459  beta-lactamase  33.33 
 
 		 394 aa  151  4e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0213623 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1713  beta-lactamase  36.64 
 
 		 347 aa  150  5e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0444  beta-lactamase  34.28 
 
 		 339 aa  147  7.0000000000000006e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0538  beta-lactamase  30.53 
 
 		 433 aa  146  8.000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11048  putative hydrolase/beta lactamase fusion protein  27.64 
 
 		 971 aa  146  1e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.199531  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2095  hypothetical protein  30.32 
 
 		 484 aa  145  2e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.187143  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0013  b-glucosidase  30.3 
 
 		 990 aa  145  2e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2194  beta-lactamase  36.01 
 
 		 334 aa  143  9e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.724545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0471  beta-lactamase  34.34 
 
 		 336 aa  142  9.999999999999999e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0547  beta-lactamase  33.23 
 
 		 375 aa  141  3.9999999999999997e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.727644  normal  0.917223 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1690  beta-lactamase  34.28 
 
 		 426 aa  140  7.999999999999999e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3606  beta-lactamase  30.56 
 
 		 419 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000041879  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0637  beta-lactamase  30.24 
 
 		 424 aa  132  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000302256  normal  0.230717 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1439  hypothetical protein  27.8 
 
 		 1007 aa  132  2.0000000000000002e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00938781 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0624  beta-lactamase  30.28 
 
 		 370 aa  131  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.540607  normal  0.110236 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3511  beta-lactamase  29.81 
 
 		 364 aa  129  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.700919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0439  beta-lactamase  29.88 
 
 		 397 aa  129  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0784108 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2704  beta-lactamase  32.29 
 
 		 424 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.431746  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0011  glycosy hydrolase family protein  30.63 
 
 		 1003 aa  128  3e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.417282 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5348  beta-lactamase  31.92 
 
 		 414 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.635001  normal  0.0848814 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0011  beta-lactamase  28.77 
 
 		 427 aa  127  5e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000120746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4807  beta-lactamase  28.74 
 
 		 434 aa  126  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0814  beta-lactamase  28.05 
 
 		 422 aa  125  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4819  glycoside hydrolase family 3 protein  29 
 
 		 997 aa  124  4e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0831  beta-lactamase  30.05 
 
 		 445 aa  124  6e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.23283  normal  0.655791 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>