More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1867 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1867  beta-lactamase  100 
 
 		 517 aa  1071    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0109165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4882  beta-lactamase  52.17 
 
 		 497 aa  548  1e-155  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3247  beta-lactamase  33.4 
 
 		 513 aa  286  9e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04833  beta-lactamase  34.8 
 
 		 529 aa  273  6e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1055  beta-lactamase  37.17 
 
 		 547 aa  267  4e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1460  beta-lactamase  33.12 
 
 		 523 aa  264  3e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0171679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1234  beta-lactamase  32 
 
 		 519 aa  245  1.9999999999999999e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565811  normal  0.301621 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0154  beta-lactamase  29.75 
 
 		 526 aa  242  1e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2343  beta-lactamase  30.14 
 
 		 803 aa  239  1e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.23617 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1298  beta-lactamase  29.89 
 
 		 566 aa  237  3e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2987  beta-lactamase  31.61 
 
 		 526 aa  237  4e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.204407  normal  0.639877 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2346  hypothetical protein  27.67 
 
 		 485 aa  224  2e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0051399  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4159  beta-lactamase  31.26 
 
 		 544 aa  225  2e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0453527  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2060  beta-lactamase  29.09 
 
 		 485 aa  223  9.999999999999999e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.258254  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2264  hypothetical protein  27.35 
 
 		 485 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.145649  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2218  hypothetical protein  27.09 
 
 		 485 aa  219  7e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2018  penicillin-binding protein  26.99 
 
 		 485 aa  218  2e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1638  beta-lactamase  26.84 
 
 		 485 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0331332  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3106  hypothetical protein  26.7 
 
 		 485 aa  217  5e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000134591 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2262  hypothetical protein  26.44 
 
 		 485 aa  216  8e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.60427e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2081  hypothetical protein  26.44 
 
 		 485 aa  216  9e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.765888  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2235  hypothetical protein  26.44 
 
 		 485 aa  216  9e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.336147  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2018  penicillin-binding protein  26.44 
 
 		 485 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.225321  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2539  beta-lactamase  31.44 
 
 		 567 aa  215  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.470437  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2813  beta-lactamase  31.05 
 
 		 499 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0467  beta-lactamase  28.6 
 
 		 520 aa  202  1.9999999999999998e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09923  hypothetical protein  27.56 
 
 		 591 aa  196  1e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.916627  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4420  beta-lactamase  30.41 
 
 		 519 aa  186  7e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0693  beta-lactamase  28.14 
 
 		 530 aa  180  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.750269  normal  0.541197 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4050  beta-lactamase  29.57 
 
 		 519 aa  172  1e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.817302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1134  beta-lactamase  26.83 
 
 		 603 aa  171  4e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.260461 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0343  beta-lactamase  32.75 
 
 		 517 aa  169  1e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.6779 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2632  beta-lactamase  29.3 
 
 		 503 aa  167  5e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.119708  hitchhiker  0.000636173 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0735  beta-lactamase  28.76 
 
 		 551 aa  162  1e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4610  beta-lactamase  26.76 
 
 		 533 aa  159  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0702461  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4657  beta-lactamase  27.31 
 
 		 485 aa  157  6e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10925  hypothetical protein  28.1 
 
 		 562 aa  155  2e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0653  beta-lactamase  25.94 
 
 		 531 aa  145  2e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1514  beta-lactamase  26.98 
 
 		 620 aa  144  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00027695  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01660  beta-lactamase  29.88 
 
 		 447 aa  144  4e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.142612  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1625  beta-lactamase  26.43 
 
 		 533 aa  143  7e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.170379  normal  0.921213 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6123  beta-lactamase  27.49 
 
 		 536 aa  142  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.299024  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3068  beta-lactamase  29.11 
 
 		 466 aa  142  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.129348 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4133  beta-lactamase  29.15 
 
 		 822 aa  141  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.668063  normal  0.0496796 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1230  beta-lactamase  27.21 
 
 		 455 aa  142  1.9999999999999998e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1263  beta-lactamase-like protein  27.21 
 
 		 455 aa  142  1.9999999999999998e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1757  beta-lactamase  25.11 
 
 		 531 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2979  beta-lactamase  27.46 
 
 		 655 aa  136  9e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4990  beta-lactamase  24.78 
 
 		 531 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4810  beta-lactamase  25.76 
 
 		 533 aa  133  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4429  beta-lactamase  25.76 
 
 		 533 aa  133  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4516  beta-lactamase  25.76 
 
 		 533 aa  133  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0822  6Fe-6S prismane cluster-containing protein-like protein  25.75 
 
 		 455 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5715  beta-lactamase  26.36 
 
 		 437 aa  127  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1064  beta-lactamase  26.59 
 
 		 544 aa  127  6e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2498  beta-lactamase  26.92 
 
 		 385 aa  125  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0428857  normal  0.830123 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0335  hypothetical protein  25.72 
 
 		 533 aa  125  2e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0805  beta-lactamase  26.46 
 
 		 519 aa  124  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8154  beta-lactamase  27.42 
 
 		 550 aa  122  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1018  beta-lactamase  28.65 
 
 		 461 aa  122  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.624623 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5985  beta-lactamase  25.83 
 
 		 342 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0675  beta-lactamase  25.37 
 
 		 377 aa  113  8.000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2727  beta-lactamase  25.53 
 
 		 486 aa  113  9e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1968  beta-lactamase  26.15 
 
 		 380 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.103464 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2118  beta-lactamase  24.01 
 
 		 389 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.146261  normal  0.0898893 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1311  beta-lactamase  25.51 
 
 		 669 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2968  beta-lactamase  25.39 
 
 		 462 aa  111  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2659  beta-lactamase  27.86 
 
 		 662 aa  110  6e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2068  beta-lactamase  24.29 
 
 		 385 aa  109  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.567046  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4688  beta-lactamase  24.31 
 
 		 462 aa  109  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.331113  normal  0.125502 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8721  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  26.71 
 
 		 480 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  25.46 
 
 		 477 aa  108  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6467  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  26.72 
 
 		 551 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.341842  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0116  beta-lactamase  26.22 
 
 		 453 aa  108  2e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4076  beta-lactamase  26.33 
 
 		 566 aa  107  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1936  beta-lactamase  26.3 
 
 		 848 aa  106  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.178754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3830  beta-lactamase  29.79 
 
 		 658 aa  105  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223137  normal  0.372687 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2615  hypothetical protein  28.57 
 
 		 793 aa  104  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.377093  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1621  beta-lactamase  21.66 
 
 		 426 aa  104  4e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.193235  normal  0.330681 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1357  beta-lactamase  28.36 
 
 		 378 aa  103  7e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  25.21 
 
 		 446 aa  103  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1762  beta-lactamase  29.25 
 
 		 431 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178293  normal  0.700473 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  23.45 
 
 		 505 aa  102  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0538  beta-lactamase  28.57 
 
 		 433 aa  102  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1870  beta-lactamase  27.24 
 
 		 390 aa  102  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.375615 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3702  beta-lactamase  28.17 
 
 		 430 aa  101  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0294  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  29.31 
 
 		 834 aa  101  3e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00108534  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  26.09 
 
 		 362 aa  100  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9203  beta-lactamase  26.27 
 
 		 635 aa  100  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.606578 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  26.8 
 
 		 356 aa  100  7e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  26.09 
 
 		 392 aa  99.8  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2717  beta-lactamase  25.77 
 
 		 470 aa  99.4  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0759  putative beta-lactamase class C penicillin binding protein  31.52 
 
 		 498 aa  99  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445171  normal  0.118882 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  25.38 
 
 		 559 aa  98.2  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3517  beta-lactamase  25.82 
 
 		 447 aa  98.6  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  25.88 
 
 		 442 aa  98.6  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3362  beta-lactamase  27.2 
 
 		 717 aa  97.8  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.450789  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1414  putative beta-lactamase  23.56 
 
 		 399 aa  97.8  5e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.182511  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1798  beta-lactamase  27.99 
 
 		 426 aa  97.4  6e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.491739  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0291  beta-lactamase class C domain-containing protein  27.57 
 
 		 519 aa  97.4  6e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000012653  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>