More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3518 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3518  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  100 
 
 		 508 aa  1006    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8721  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  41.55 
 
 		 480 aa  226  7e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5593  beta-lactamase  38.22 
 
 		 480 aa  202  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5338  beta-lactamase  41.74 
 
 		 525 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.271651  normal  0.211898 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3032  beta-lactamase  37.44 
 
 		 507 aa  192  1e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.436003 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3698  beta-lactamase  32.7 
 
 		 476 aa  159  9e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.884543  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2036  putative penicillin-binding protein  33.24 
 
 		 691 aa  139  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3223  putative penicillin-binding protein  33.24 
 
 		 691 aa  139  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2989  penicillin-binding protein  31.78 
 
 		 691 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2916  penicillin-binding protein  31.18 
 
 		 691 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3214  penicillin-binding protein  31.78 
 
 		 691 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38843  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0098  beta-lactamase  31.44 
 
 		 691 aa  134  5e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1955  beta-lactamase  32.19 
 
 		 694 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.1377  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3205  putative penicillin-binding protein  31.14 
 
 		 694 aa  127  7e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3017  beta-lactamase  31.37 
 
 		 694 aa  126  7e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151965  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2717  beta-lactamase  34.17 
 
 		 470 aa  125  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0759  putative beta-lactamase class C penicillin binding protein  33.33 
 
 		 498 aa  124  3e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445171  normal  0.118882 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2353  penicillin-binding protein  24.85 
 
 		 481 aa  124  4e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000218323  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0291  beta-lactamase class C domain-containing protein  31.95 
 
 		 519 aa  124  5e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000012653  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2629  putative penicillin-binding protein  24.54 
 
 		 490 aa  120  6e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0110315  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2587  putative penicillin-binding protein  24.31 
 
 		 463 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35213e-17 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2384  beta-lactamase  24.92 
 
 		 483 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2400  penicillin-binding protein  24.31 
 
 		 481 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443561  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2575  penicillin-binding protein  24.31 
 
 		 481 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  26.52 
 
 		 446 aa  117  5e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2316  penicillin-binding protein  24 
 
 		 481 aa  117  6e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181197  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  33.44 
 
 		 356 aa  115  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2968  beta-lactamase  30.96 
 
 		 462 aa  115  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1839  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  31.25 
 
 		 681 aa  113  6e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000051234  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2579  penicillin-binding protein, putative  23.6 
 
 		 483 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0220569  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33850  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  31.85 
 
 		 453 aa  112  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04833  beta-lactamase  32.76 
 
 		 529 aa  111  3e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1832  beta-lactamase  24.76 
 
 		 446 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.29245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11747  penicillin-binding protein  29.75 
 
 		 539 aa  110  8.000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.47398 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  29.45 
 
 		 578 aa  110  8.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  31.48 
 
 		 392 aa  109  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0505  putative penicillin-binding protein  27.67 
 
 		 415 aa  109  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0859162  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  28.08 
 
 		 362 aa  109  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4159  beta-lactamase  29.31 
 
 		 544 aa  109  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0453527  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1234  beta-lactamase  32.26 
 
 		 519 aa  109  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565811  normal  0.301621 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2294  penicillin-binding protein, putative  26.86 
 
 		 434 aa  109  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.272122  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2638  beta-lactamase  32.24 
 
 		 445 aa  108  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1906  beta-lactamase  27.03 
 
 		 369 aa  108  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1018  beta-lactamase  31.4 
 
 		 461 aa  107  5e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.624623 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0473  penicillin-binding protein  27.36 
 
 		 421 aa  107  7e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0502  penicillin-binding protein  27.04 
 
 		 412 aa  107  7e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0419  beta-lactamase  26.81 
 
 		 416 aa  107  7e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0416  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  27.36 
 
 		 421 aa  106  8e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0430511  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0483  putative penicillin-binding protein  27.04 
 
 		 412 aa  106  9e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5264  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  32.29 
 
 		 493 aa  106  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.0797924 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2953  beta-lactamase  24 
 
 		 513 aa  106  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0579  beta-lactamase  37.35 
 
 		 395 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.521189  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2544  putative penicillin-binding protein  23.48 
 
 		 483 aa  105  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1460  beta-lactamase  28.95 
 
 		 523 aa  104  3e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0171679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0973  beta-lactamase  25.06 
 
 		 514 aa  105  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0558  putative penicillin-binding protein  27.04 
 
 		 413 aa  104  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.622752  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  26.91 
 
 		 477 aa  104  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0412  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  27.04 
 
 		 422 aa  103  5e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1710  beta-lactamase  30.75 
 
 		 463 aa  103  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.903063 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4818  putative penicillin-binding protein  26.18 
 
 		 416 aa  103  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.618322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5715  beta-lactamase  35.59 
 
 		 437 aa  103  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2468  beta-lactamase  25.06 
 
 		 498 aa  103  7e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00176956  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2516  beta-lactamase  25.06 
 
 		 498 aa  103  7e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000422279  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  31.99 
 
 		 377 aa  103  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2539  beta-lactamase  29.1 
 
 		 567 aa  102  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.470437  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0343  beta-lactamase  29.48 
 
 		 517 aa  102  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.6779 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0294  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  29.08 
 
 		 834 aa  103  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00108534  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0934  beta-lactamase  26.67 
 
 		 475 aa  102  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000419238  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5150  beta-lactamase  31.4 
 
 		 369 aa  101  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.654906 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0683  Beta-lactamase  30.07 
 
 		 530 aa  102  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.564885  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3175  beta-lactamase  28.28 
 
 		 351 aa  101  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0119788  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0201  beta-lactamase  31.12 
 
 		 530 aa  101  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.494145 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0863  beta-lactamase  33.33 
 
 		 363 aa  101  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.07 
 
 		 442 aa  101  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0428  beta-lactamase  28.16 
 
 		 404 aa  101  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.354595  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2343  beta-lactamase  27.35 
 
 		 803 aa  101  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.23617 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0822  6Fe-6S prismane cluster-containing protein-like protein  32.65 
 
 		 455 aa  100  4e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0555  penicillin-binding protein, putative  26.73 
 
 		 413 aa  100  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.389605  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5769  beta-lactamase  30.88 
 
 		 670 aa  100  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.477057 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1896  beta-lactamase  31.69 
 
 		 425 aa  100  6e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.227365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2650  beta-lactamase  31.04 
 
 		 497 aa  100  8e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0361544  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1788  beta-lactamase  30.35 
 
 		 560 aa  100  8e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.358741  normal  0.761746 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2043  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  31.91 
 
 		 421 aa  100  8e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.956781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2498  beta-lactamase  25.61 
 
 		 385 aa  99.8  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0428857  normal  0.830123 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  26.55 
 
 		 487 aa  99.8  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3422  beta-lactamase  29.7 
 
 		 593 aa  99  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.126074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0463  beta-lactamase  35.34 
 
 		 395 aa  99  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4919  beta-lactamase  30.31 
 
 		 415 aa  99  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.318437  normal  0.850487 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0939  beta-lactamase  31.95 
 
 		 338 aa  98.6  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.18746 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1783  cyclic peptide transporter  26.54 
 
 		 1055 aa  98.6  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0154  beta-lactamase  28.57 
 
 		 482 aa  98.6  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2997  beta-lactamase  24.22 
 
 		 513 aa  98.2  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2143  beta-lactamase  27.22 
 
 		 401 aa  98.2  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.559529  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2987  beta-lactamase  25.71 
 
 		 526 aa  97.8  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.204407  normal  0.639877 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2573  fmtA-like protein, putative  28.57 
 
 		 482 aa  97.8  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00911316  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0570  alkaline D-peptidase  33.09 
 
 		 370 aa  97.1  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2616  beta-lactamase  27.04 
 
 		 353 aa  97.1  7e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3731  beta-lactamase  29.04 
 
 		 603 aa  96.7  9e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.227339 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13238  penicillin-binding protein, putative  26.32 
 
 		 431 aa  96.7  9e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.652866  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3106  hypothetical protein  26.87 
 
 		 485 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000134591 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>