More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1234 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_04833  beta-lactamase  71.73 
 
 		 529 aa  766    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1234  beta-lactamase  100 
 
 		 519 aa  1066    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565811  normal  0.301621 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3247  beta-lactamase  43.19 
 
 		 513 aa  414  1e-114  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0660544 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2987  beta-lactamase  45.27 
 
 		 526 aa  409  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.204407  normal  0.639877 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1460  beta-lactamase  39.85 
 
 		 523 aa  393  1e-108  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0171679  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0154  beta-lactamase  38.72 
 
 		 526 aa  377  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2343  beta-lactamase  39.46 
 
 		 803 aa  372  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.23617 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1055  beta-lactamase  41.62 
 
 		 547 aa  356  5e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0467  beta-lactamase  37.67 
 
 		 520 aa  353  4e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4159  beta-lactamase  38.52 
 
 		 544 aa  353  5.9999999999999994e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0453527  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2264  hypothetical protein  30.75 
 
 		 485 aa  247  4e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.145649  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2218  hypothetical protein  30.24 
 
 		 485 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1867  beta-lactamase  32 
 
 		 517 aa  245  1.9999999999999999e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0109165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4882  beta-lactamase  32.19 
 
 		 497 aa  243  7e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1638  beta-lactamase  33.33 
 
 		 485 aa  243  9e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0331332  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2346  hypothetical protein  29.54 
 
 		 485 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0051399  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2018  penicillin-binding protein  30.75 
 
 		 485 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.225321  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2018  penicillin-binding protein  30.04 
 
 		 485 aa  240  5e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2262  hypothetical protein  30.55 
 
 		 485 aa  239  1e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.60427e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2081  hypothetical protein  30.35 
 
 		 485 aa  238  2e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.765888  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2235  hypothetical protein  30.35 
 
 		 485 aa  238  2e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.336147  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3106  hypothetical protein  29.66 
 
 		 485 aa  236  9e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000134591 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2060  beta-lactamase  32.3 
 
 		 485 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.258254  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0343  beta-lactamase  34.86 
 
 		 517 aa  230  5e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.6779 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2539  beta-lactamase  31.88 
 
 		 567 aa  219  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.470437  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4657  beta-lactamase  33.48 
 
 		 485 aa  205  2e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1298  beta-lactamase  30.43 
 
 		 566 aa  202  9e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0693  beta-lactamase  30.29 
 
 		 530 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.750269  normal  0.541197 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4610  beta-lactamase  30.54 
 
 		 533 aa  186  9e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0702461  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2813  beta-lactamase  27.8 
 
 		 499 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1625  beta-lactamase  33.41 
 
 		 533 aa  184  3e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.170379  normal  0.921213 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2632  beta-lactamase  31.46 
 
 		 503 aa  182  1e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.119708  hitchhiker  0.000636173 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0653  beta-lactamase  30.36 
 
 		 531 aa  182  2e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6123  beta-lactamase  30.33 
 
 		 536 aa  181  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.299024  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0735  beta-lactamase  29.72 
 
 		 551 aa  177  4e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09923  hypothetical protein  24.48 
 
 		 591 aa  175  1.9999999999999998e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.916627  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4076  beta-lactamase  31.94 
 
 		 566 aa  174  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4420  beta-lactamase  27.94 
 
 		 519 aa  173  6.999999999999999e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4050  beta-lactamase  28.34 
 
 		 519 aa  171  4e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.817302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10925  hypothetical protein  31.17 
 
 		 562 aa  169  8e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4990  beta-lactamase  29.94 
 
 		 531 aa  169  9e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0822  6Fe-6S prismane cluster-containing protein-like protein  28.85 
 
 		 455 aa  169  1e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1230  beta-lactamase  30.9 
 
 		 455 aa  168  2e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1263  beta-lactamase-like protein  30.9 
 
 		 455 aa  168  2e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1064  beta-lactamase  31.34 
 
 		 544 aa  167  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1134  beta-lactamase  27.76 
 
 		 603 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.260461 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3068  beta-lactamase  30.49 
 
 		 466 aa  164  3e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.129348 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01660  beta-lactamase  30.55 
 
 		 447 aa  162  2e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.142612  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4429  beta-lactamase  30.97 
 
 		 533 aa  162  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4516  beta-lactamase  30.97 
 
 		 533 aa  162  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4810  beta-lactamase  30.97 
 
 		 533 aa  162  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1757  beta-lactamase  29.6 
 
 		 531 aa  160  5e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8154  beta-lactamase  30 
 
 		 550 aa  156  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11747  penicillin-binding protein  29.95 
 
 		 539 aa  144  3e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.47398 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1514  beta-lactamase  27.11 
 
 		 620 aa  144  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00027695  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  26.57 
 
 		 477 aa  139  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0759  putative beta-lactamase class C penicillin binding protein  31.09 
 
 		 498 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.445171  normal  0.118882 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2979  beta-lactamase  27.39 
 
 		 655 aa  133  9e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3032  beta-lactamase  31.22 
 
 		 507 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.436003 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0805  beta-lactamase  26.85 
 
 		 519 aa  132  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0294  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  29.17 
 
 		 834 aa  132  2.0000000000000002e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00108534  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1018  beta-lactamase  28.12 
 
 		 461 aa  128  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.624623 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  28.07 
 
 		 505 aa  127  5e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.45 
 
 		 442 aa  127  6e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4133  beta-lactamase  28.61 
 
 		 822 aa  126  8.000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.668063  normal  0.0496796 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1520  Beta-lactamase  27.36 
 
 		 537 aa  125  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000638983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1762  beta-lactamase  29.11 
 
 		 431 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178293  normal  0.700473 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  34.37 
 
 		 356 aa  124  5e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0291  beta-lactamase class C domain-containing protein  28.43 
 
 		 519 aa  124  5e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000012653  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2991  beta-lactamase  29.13 
 
 		 475 aa  124  6e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3702  beta-lactamase  30.33 
 
 		 430 aa  123  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2118  beta-lactamase  23.78 
 
 		 389 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.146261  normal  0.0898893 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2638  beta-lactamase  30.75 
 
 		 445 aa  122  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6467  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  26.79 
 
 		 551 aa  122  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.341842  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  27.08 
 
 		 595 aa  120  7e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2717  beta-lactamase  27.16 
 
 		 470 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0201  beta-lactamase  26.47 
 
 		 530 aa  118  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.494145 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2498  beta-lactamase  25.07 
 
 		 385 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0428857  normal  0.830123 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  27.75 
 
 		 559 aa  119  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1839  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  28.45 
 
 		 681 aa  118  1.9999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000051234  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2968  beta-lactamase  23.89 
 
 		 462 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8721  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  30.79 
 
 		 480 aa  117  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2779  beta-lactamase  29.36 
 
 		 445 aa  117  5e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000737728  hitchhiker  0.0000305116 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1798  beta-lactamase  30.3 
 
 		 426 aa  117  5e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.491739  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  27.3 
 
 		 487 aa  116  7.999999999999999e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4346  Beta-lactamase  31.15 
 
 		 547 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5264  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  30.14 
 
 		 493 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.0797924 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0934  beta-lactamase  29.54 
 
 		 475 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000419238  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2727  beta-lactamase  26.09 
 
 		 486 aa  116  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2650  beta-lactamase  29.8 
 
 		 497 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0361544  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2573  beta-lactamase  28.29 
 
 		 476 aa  114  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.369136  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0154  beta-lactamase  28.7 
 
 		 482 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2573  fmtA-like protein, putative  28.4 
 
 		 482 aa  114  6e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00911316  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.75 
 
 		 392 aa  114  6e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1710  beta-lactamase  29.69 
 
 		 463 aa  114  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.903063 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1414  putative beta-lactamase  23.35 
 
 		 399 aa  113  8.000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.182511  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2143  beta-lactamase  28.61 
 
 		 401 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.559529  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1783  cyclic peptide transporter  27.01 
 
 		 1055 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0116  beta-lactamase  26.95 
 
 		 453 aa  111  3e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5338  beta-lactamase  29.71 
 
 		 525 aa  111  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.271651  normal  0.211898 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>