More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_1783 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_2389  cyclic peptide transporter  51.62 
 
 
1032 aa  1026    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1783  cyclic peptide transporter  100 
 
 
1055 aa  2154    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2333  cyclic peptide transporter  42.88 
 
 
650 aa  534  1e-150  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0973  beta-lactamase  39.08 
 
 
514 aa  337  5e-91  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5068  cyclic peptide transporter  35.95 
 
 
546 aa  323  8e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3540  cyclic peptide transporter  34.26 
 
 
551 aa  312  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.495743  normal  0.985666 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0505  cyclic peptide transporter  37.19 
 
 
548 aa  308  3e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2153  pyoverdine ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.52 
 
 
554 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105223  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1963  cyclic peptide transporter  32.7 
 
 
558 aa  303  1e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.787784  normal  0.816592 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4216  cyclic peptide transporter  33.58 
 
 
552 aa  298  4e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1823  cyclic peptide transporter  33.97 
 
 
555 aa  297  6e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.774131  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26810  pyoverdine synthetase E, pdvE  32.38 
 
 
553 aa  297  7e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3724  cyclic peptide transporter  31.86 
 
 
564 aa  296  1e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.411426 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1850  cyclic peptide transporter  32.95 
 
 
552 aa  295  3e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0524  ABC cyclic peptide efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  31.57 
 
 
562 aa  295  4e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4071  cyclic peptide transporter  31.57 
 
 
588 aa  293  8e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.324358 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1091  pyoverdine ABC transporter permease/ATP-binding protein  34.33 
 
 
564 aa  293  9e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.737034 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4089  cyclic peptide transporter  31.43 
 
 
550 aa  291  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0319097  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1599  cyclic peptide transporter  30.41 
 
 
581 aa  291  6e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181378  hitchhiker  0.00126952 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33690  pyoverdine biosynthesis protein PvdE  31.18 
 
 
549 aa  290  8e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00697095  hitchhiker  0.00612682 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1159  cyclic peptide transporter  31.24 
 
 
607 aa  287  9e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.216015  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1639  cyclic peptide transporter  31.24 
 
 
607 aa  287  9e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0715869  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1614  cyclic peptide transporter  31.24 
 
 
607 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170963  normal  0.0520134 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1307  cyclic peptide transporter  32.39 
 
 
560 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2862  pyoverdine biosynthesis protein PvdE  32.18 
 
 
550 aa  286  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.519418  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2419  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  31.53 
 
 
562 aa  284  6.000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.232259  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4785  ABC cyclic peptide/siderophore export pump, fused ATPase and inner membrane subunits  30.71 
 
 
581 aa  283  9e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.257895  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1557  cyclic peptide transporter  30.51 
 
 
581 aa  281  4e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.931443  normal  0.535209 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1681  cyclic peptide transporter  32.58 
 
 
562 aa  281  4e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6469  cyclic peptide transporter  32.08 
 
 
567 aa  281  5e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1536  cyclic peptide transporter  30.51 
 
 
581 aa  280  1e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0345189  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4746  cyclic peptide transporter  30.73 
 
 
571 aa  279  2e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.235902 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1940  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein MbaE  31.5 
 
 
562 aa  278  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0387498  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1183  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  31.5 
 
 
562 aa  278  3e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.141269  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2085  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  31.5 
 
 
562 aa  278  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.130982  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0289  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  31.5 
 
 
562 aa  278  3e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.243685  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0872  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  31.5 
 
 
562 aa  278  3e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0361195  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1926  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein MbaE  31.5 
 
 
562 aa  278  3e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0312938  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1626  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  31.5 
 
 
562 aa  278  3e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.667512  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3736  cyclic peptide transporter  30.84 
 
 
563 aa  275  3e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1956  cyclic peptide transporter  30.56 
 
 
544 aa  273  2e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.154959  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2613  cyclic peptide transporter  30.68 
 
 
566 aa  271  5e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.104435  normal  0.36301 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2788  cyclic peptide transporter  29.46 
 
 
581 aa  271  5.9999999999999995e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.441384  normal  0.126304 
 
 
-
 
NC_003296  RS03729  ABC transporter ATP-binding protein  29.68 
 
 
555 aa  265  4e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.525568  normal  0.456711 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1007  cyclic peptide transporter  32.46 
 
 
551 aa  265  4.999999999999999e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4040  cyclic peptide transporter  29.21 
 
 
597 aa  264  8e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2327  cyclic peptide transporter  28.74 
 
 
579 aa  264  8e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0354402  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2468  beta-lactamase  31.49 
 
 
498 aa  262  3e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00176956  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2516  beta-lactamase  31.49 
 
 
498 aa  262  3e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000422279  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1675  cyclic peptide transporter  36.59 
 
 
551 aa  262  3e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3708  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.25 
 
 
557 aa  260  1e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.835875  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1928  ABC cyclic peptide efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  30.7 
 
 
564 aa  259  2e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00990563  normal  0.428537 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1531  cyclic peptide transporter  31.3 
 
 
554 aa  256  1.0000000000000001e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.229527  normal  0.420973 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1039  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  29.94 
 
 
557 aa  256  2.0000000000000002e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2101  cyclic peptide transporter  29.85 
 
 
541 aa  254  7e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  31.62 
 
 
505 aa  249  3e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2571  cyclic peptide transporter  30.09 
 
 
552 aa  247  6.999999999999999e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0512743  normal  0.0935023 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1938  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  32.47 
 
 
543 aa  246  1.9999999999999999e-63  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1575  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  32.66 
 
 
543 aa  245  3e-63  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1758  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  32.66 
 
 
543 aa  244  6e-63  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2925  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  31.13 
 
 
553 aa  244  7.999999999999999e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3060  cyclic peptide transporter  31.28 
 
 
576 aa  242  2.9999999999999997e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.640427  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1497  cyclic peptide transporter  27.72 
 
 
557 aa  241  5e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.353256  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3420  cyclic peptide transporter  26.57 
 
 
554 aa  240  8e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00388229  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2872  cyclic peptide transporter  30.88 
 
 
558 aa  239  2e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.27305 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1528  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  28.34 
 
 
542 aa  238  5.0000000000000005e-61  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1655  ABC transporter ATP-binding protein YojI  30.97 
 
 
544 aa  238  7e-61  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3315  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  29.35 
 
 
548 aa  235  3e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0995  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  30.38 
 
 
548 aa  235  3e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.64415  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1530  ABC transporter ATP-binding protein YojI  33.74 
 
 
546 aa  233  1e-59  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3313  cyclic peptide transporter  29.53 
 
 
558 aa  233  1e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.473343  normal  0.840311 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3437  cyclic peptide transporter  31.62 
 
 
556 aa  232  2e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2503  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  29.48 
 
 
547 aa  232  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.45068  hitchhiker  0.000119936 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2447  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  29.48 
 
 
547 aa  231  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.392835 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2606  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  28.84 
 
 
547 aa  231  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.421304  normal  0.757942 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2399  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  28.84 
 
 
547 aa  231  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2489  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  30.04 
 
 
547 aa  230  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2791  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  30.21 
 
 
547 aa  229  2e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.46753  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3118  cyclic peptide transporter  30.77 
 
 
556 aa  229  3e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.150881  normal  0.779975 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1439  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  30.04 
 
 
547 aa  228  4e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.216906 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2360  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  30.22 
 
 
547 aa  228  4e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2510  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  30.04 
 
 
547 aa  228  4e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.121773  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02138  fused predicted multidrug transport subunits of ABC superfamily: membrane component/ATP-binding component  30.04 
 
 
547 aa  228  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1447  cyclic peptide transporter  30.04 
 
 
547 aa  228  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.638888  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02097  hypothetical protein  30.04 
 
 
547 aa  228  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2350  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  30.04 
 
 
547 aa  228  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0154  beta-lactamase  31.78 
 
 
482 aa  228  6e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0729  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  30.04 
 
 
547 aa  227  8e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.723573  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3349  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  30.04 
 
 
547 aa  227  9e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.271374  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2573  fmtA-like protein, putative  31.58 
 
 
482 aa  227  1e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00911316  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3852  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  28.99 
 
 
550 aa  219  2e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.604854  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1501  cyclic peptide transporter  28.78 
 
 
557 aa  219  2.9999999999999998e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0934  beta-lactamase  33.89 
 
 
475 aa  215  2.9999999999999995e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000419238  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5194  ABC transporter related  26.65 
 
 
549 aa  204  8e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202589  normal  0.0685542 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1757  ABC transporter ATP-binding protein YojI  27.65 
 
 
514 aa  171  5e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2353  penicillin-binding protein  26.65 
 
 
481 aa  139  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000218323  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2316  penicillin-binding protein  26.43 
 
 
481 aa  139  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181197  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2587  putative penicillin-binding protein  26.87 
 
 
463 aa  139  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35213e-17 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2650  beta-lactamase  26.6 
 
 
497 aa  139  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0361544  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0467  beta-lactamase  30.38 
 
 
520 aa  139  4e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>