More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_26810 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_26810  pyoverdine synthetase E, pdvE  100 
 
 
553 aa  1102    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1823  cyclic peptide transporter  66.1 
 
 
555 aa  715    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.774131  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1599  cyclic peptide transporter  49.72 
 
 
581 aa  496  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181378  hitchhiker  0.00126952 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1614  cyclic peptide transporter  49.82 
 
 
607 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170963  normal  0.0520134 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1159  cyclic peptide transporter  49.82 
 
 
607 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.216015  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1639  cyclic peptide transporter  49.82 
 
 
607 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0715869  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4785  ABC cyclic peptide/siderophore export pump, fused ATPase and inner membrane subunits  49.08 
 
 
581 aa  488  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.257895  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1557  cyclic peptide transporter  48.81 
 
 
581 aa  487  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.931443  normal  0.535209 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1536  cyclic peptide transporter  48.62 
 
 
581 aa  486  1e-136  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0345189  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4071  cyclic peptide transporter  48.06 
 
 
588 aa  483  1e-135  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.324358 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0524  ABC cyclic peptide efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  46.88 
 
 
562 aa  484  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1307  cyclic peptide transporter  48.51 
 
 
560 aa  480  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2788  cyclic peptide transporter  48.7 
 
 
581 aa  469  1.0000000000000001e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.441384  normal  0.126304 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2419  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  47.18 
 
 
562 aa  464  1e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.232259  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1626  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  47.19 
 
 
562 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.667512  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0289  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  47.19 
 
 
562 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.243685  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1183  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  47.19 
 
 
562 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.141269  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2085  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  47.19 
 
 
562 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.130982  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1926  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein MbaE  47.19 
 
 
562 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0312938  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1940  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein MbaE  47.19 
 
 
562 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0387498  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0872  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  47.19 
 
 
562 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0361195  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5068  cyclic peptide transporter  41.92 
 
 
546 aa  432  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4040  cyclic peptide transporter  46.88 
 
 
597 aa  428  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2862  pyoverdine biosynthesis protein PvdE  39.35 
 
 
550 aa  375  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.519418  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1963  cyclic peptide transporter  38.67 
 
 
558 aa  372  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.787784  normal  0.816592 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4216  cyclic peptide transporter  39.62 
 
 
552 aa  368  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2153  pyoverdine ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.48 
 
 
554 aa  368  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105223  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3540  cyclic peptide transporter  37.48 
 
 
551 aa  363  3e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.495743  normal  0.985666 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4089  cyclic peptide transporter  37.85 
 
 
550 aa  362  9e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0319097  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1091  pyoverdine ABC transporter permease/ATP-binding protein  39.72 
 
 
564 aa  361  2e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.737034 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0505  cyclic peptide transporter  37.34 
 
 
548 aa  359  9e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33690  pyoverdine biosynthesis protein PvdE  38.2 
 
 
549 aa  355  1e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00697095  hitchhiker  0.00612682 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1850  cyclic peptide transporter  37.71 
 
 
552 aa  353  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3724  cyclic peptide transporter  38.82 
 
 
564 aa  351  2e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.411426 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1681  cyclic peptide transporter  37.8 
 
 
562 aa  343  7e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1531  cyclic peptide transporter  38.11 
 
 
554 aa  333  5e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.229527  normal  0.420973 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1928  ABC cyclic peptide efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  37.75 
 
 
564 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00990563  normal  0.428537 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3736  cyclic peptide transporter  36.43 
 
 
563 aa  320  3.9999999999999996e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4746  cyclic peptide transporter  37.21 
 
 
571 aa  308  2.0000000000000002e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.235902 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3313  cyclic peptide transporter  39.43 
 
 
558 aa  303  5.000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.473343  normal  0.840311 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1783  cyclic peptide transporter  32.38 
 
 
1055 aa  297  4e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2327  cyclic peptide transporter  36.48 
 
 
579 aa  296  5e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0354402  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1039  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  34.15 
 
 
557 aa  295  1e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1007  cyclic peptide transporter  31.51 
 
 
551 aa  294  2e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6469  cyclic peptide transporter  32.9 
 
 
567 aa  292  9e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1675  cyclic peptide transporter  33.81 
 
 
551 aa  291  2e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2872  cyclic peptide transporter  37.18 
 
 
558 aa  291  2e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.27305 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1497  cyclic peptide transporter  36.74 
 
 
557 aa  291  3e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.353256  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2613  cyclic peptide transporter  33.27 
 
 
566 aa  288  2e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.104435  normal  0.36301 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2571  cyclic peptide transporter  31.67 
 
 
552 aa  287  4e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0512743  normal  0.0935023 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3437  cyclic peptide transporter  37.3 
 
 
556 aa  286  5e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2389  cyclic peptide transporter  33.21 
 
 
1032 aa  284  2.0000000000000002e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3118  cyclic peptide transporter  36.67 
 
 
556 aa  282  1e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.150881  normal  0.779975 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3060  cyclic peptide transporter  30.41 
 
 
576 aa  279  7e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.640427  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3349  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  31.73 
 
 
547 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.271374  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2333  cyclic peptide transporter  32.08 
 
 
650 aa  273  7e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3315  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  31.94 
 
 
548 aa  272  1e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2791  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  31.72 
 
 
547 aa  271  2e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.46753  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1439  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  31.37 
 
 
547 aa  271  2e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.216906 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2510  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  31.37 
 
 
547 aa  271  2e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.121773  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02138  fused predicted multidrug transport subunits of ABC superfamily: membrane component/ATP-binding component  31.37 
 
 
547 aa  271  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1447  cyclic peptide transporter  31.37 
 
 
547 aa  271  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.638888  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02097  hypothetical protein  31.37 
 
 
547 aa  271  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2350  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  31.37 
 
 
547 aa  271  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0995  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  33.55 
 
 
548 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.64415  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2399  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  31.72 
 
 
547 aa  270  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2503  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  31.72 
 
 
547 aa  270  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.45068  hitchhiker  0.000119936 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2606  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  31.72 
 
 
547 aa  270  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.421304  normal  0.757942 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0729  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  31.37 
 
 
547 aa  270  5e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.723573  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2489  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  31.72 
 
 
547 aa  270  5.9999999999999995e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2447  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  31.72 
 
 
547 aa  269  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.392835 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2360  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  30.93 
 
 
547 aa  269  1e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2925  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  33.88 
 
 
553 aa  266  5.999999999999999e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1501  cyclic peptide transporter  32.34 
 
 
557 aa  266  8.999999999999999e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3852  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  33.08 
 
 
550 aa  265  2e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.604854  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1758  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  29.34 
 
 
543 aa  264  4e-69  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1938  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  29.52 
 
 
543 aa  264  4e-69  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1575  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  29.34 
 
 
543 aa  263  8e-69  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3708  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.43 
 
 
557 aa  249  6e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.835875  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1956  cyclic peptide transporter  29.39 
 
 
544 aa  239  6.999999999999999e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.154959  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1528  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  28.41 
 
 
542 aa  239  8e-62  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1655  ABC transporter ATP-binding protein YojI  30.28 
 
 
544 aa  238  1e-61  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1530  ABC transporter ATP-binding protein YojI  29.81 
 
 
546 aa  231  3e-59  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3420  cyclic peptide transporter  30.29 
 
 
554 aa  229  1e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00388229  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03729  ABC transporter ATP-binding protein  33.2 
 
 
555 aa  227  5.0000000000000005e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.525568  normal  0.456711 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2101  cyclic peptide transporter  27.04 
 
 
541 aa  213  7.999999999999999e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1757  ABC transporter ATP-binding protein YojI  27.72 
 
 
514 aa  204  5e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5194  ABC transporter related  28.83 
 
 
549 aa  196  6e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202589  normal  0.0685542 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34840  ABC transporter, ATP-binding protein  25.98 
 
 
595 aa  103  7e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2200  ABC transporter ATP-binding protein  26.86 
 
 
592 aa  103  9e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1207  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  26.16 
 
 
574 aa  102  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0823  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.16 
 
 
596 aa  102  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1045  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.16 
 
 
596 aa  102  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.378722  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1912  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.16 
 
 
574 aa  102  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0734969  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0985  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  26.16 
 
 
596 aa  102  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.426098  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1061  ABC transporter ATP-binding protein/peptidase  23.05 
 
 
594 aa  102  3e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00531558  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1357  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  26.16 
 
 
575 aa  102  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0328  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.16 
 
 
575 aa  102  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1198  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  26.16 
 
 
575 aa  102  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3487  ABC transporter related protein  26.39 
 
 
616 aa  100  6e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0908956  normal  0.590401 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>